88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1670 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1670  hypothetical protein  100 
 
 
405 aa  798    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.704713  normal  0.19338 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2581  hypothetical protein  39.59 
 
 
388 aa  203  5e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.365833  normal  0.0605789 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1461  hypothetical protein  39.55 
 
 
401 aa  202  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8135  hypothetical protein  38.8 
 
 
397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026592  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1668  protein of unknown function DUF418  39.13 
 
 
420 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620816  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3607  protein of unknown function DUF418  39 
 
 
407 aa  197  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.526186  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0622  hypothetical protein  39.61 
 
 
439 aa  194  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3111  protein of unknown function DUF418  41.44 
 
 
443 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414343  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1078  protein of unknown function DUF418  38.52 
 
 
384 aa  180  4e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4741  hypothetical protein  35.96 
 
 
392 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.400946  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3529  protein of unknown function DUF418  35.97 
 
 
398 aa  177  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.296308  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0035  hypothetical protein  37.56 
 
 
402 aa  176  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2152  hypothetical protein  33.66 
 
 
393 aa  175  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.391046 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1416  protein of unknown function DUF405  37 
 
 
407 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.548338  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1063  protein of unknown function DUF405  36.87 
 
 
472 aa  173  5.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1415  protein of unknown function DUF405  36.25 
 
 
399 aa  169  7e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.845184  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4293  protein of unknown function DUF418  36.43 
 
 
390 aa  163  6e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0719  protein of unknown function DUF418  38.13 
 
 
405 aa  161  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.699875  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0072  hypothetical protein  38.94 
 
 
380 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484765  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1236  hypothetical protein  36.95 
 
 
399 aa  157  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0984  protein of unknown function DUF418  37.85 
 
 
387 aa  152  8e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0392587  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24880  predicted membrane protein  33.9 
 
 
432 aa  152  8e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0615892  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0505  protein of unknown function DUF418  33.33 
 
 
407 aa  150  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000344824 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15990  predicted membrane protein  36.86 
 
 
414 aa  144  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.230384 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3780  hypothetical protein  30.89 
 
 
401 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4159  hypothetical protein  32.14 
 
 
401 aa  123  6e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.776458  decreased coverage  0.000152397 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07880  predicted membrane protein  32.25 
 
 
407 aa  117  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4423  hypothetical protein  29.69 
 
 
417 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00407884  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0455  hypothetical protein  28.07 
 
 
415 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222068  hitchhiker  0.00425561 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0666  protein of unknown function DUF405  24.81 
 
 
362 aa  69.3  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000167692  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2066  protein of unknown function DUF418  27.34 
 
 
404 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0837783  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3043  hypothetical protein  29.58 
 
 
382 aa  65.5  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4097  hypothetical protein  24.11 
 
 
399 aa  64.3  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0683  protein of unknown function DUF405  23.74 
 
 
387 aa  64.3  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2327  hypothetical protein  28.71 
 
 
388 aa  64.3  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1066  hypothetical protein  26.47 
 
 
401 aa  63.5  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1661  transport protein  30.56 
 
 
430 aa  62.4  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.414626  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0076  protein of unknown function DUF418  27.9 
 
 
416 aa  62.4  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.477208  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2882  hypothetical protein  31.72 
 
 
414 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1608  hypothetical protein  29.86 
 
 
430 aa  61.2  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2978  hypothetical protein  31.03 
 
 
414 aa  60.8  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4804  transmembrane protein  23.32 
 
 
312 aa  60.8  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000142062  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2799  hypothetical protein  31.72 
 
 
414 aa  60.1  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3566  protein of unknown function DUF418  34.97 
 
 
459 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.726105 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2885  protein of unknown function DUF405  28.67 
 
 
414 aa  58.5  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.802913  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2860  protein of unknown function DUF418  32.12 
 
 
415 aa  56.2  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1538  protein of unknown function DUF405  25.42 
 
 
406 aa  55.8  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1396  hypothetical protein  29.08 
 
 
399 aa  55.8  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2840  hypothetical protein  27.39 
 
 
414 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.110654 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0775  hypothetical protein  26 
 
 
401 aa  54.7  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0095945  normal  0.285929 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0015  hypothetical protein  26.77 
 
 
381 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.428508  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30910  predicted membrane protein  28.71 
 
 
392 aa  54.3  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3571  protein of unknown function DUF418  33.33 
 
 
405 aa  54.3  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.983337  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2115  protein of unknown function DUF418  22.63 
 
 
412 aa  53.1  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0746  protein of unknown function DUF405  28.1 
 
 
204 aa  53.1  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.685935 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0252  protein of unknown function DUF405  27.89 
 
 
410 aa  53.1  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0285  protein of unknown function DUF418  22.54 
 
 
409 aa  52.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1561  hypothetical protein  30.08 
 
 
393 aa  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5273  hypothetical protein  33.61 
 
 
312 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1289  protein of unknown function DUF405  29.23 
 
 
401 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3087  hypothetical protein  29.23 
 
 
411 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3078  hypothetical protein  28.12 
 
 
411 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1499  protein of unknown function DUF405  33.08 
 
 
388 aa  51.6  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2404  hypothetical protein  32.8 
 
 
382 aa  51.2  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.334101  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1671  hypothetical protein  23.99 
 
 
395 aa  51.2  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3230  hypothetical protein  29.23 
 
 
411 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01909  transport protein  31.45 
 
 
409 aa  50.1  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.694528  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0117  membrane protein  27.56 
 
 
381 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000725343  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00200  predicted membrane protein  25.62 
 
 
397 aa  49.3  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.220914 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2305  hypothetical protein  33.86 
 
 
391 aa  49.3  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1203  hypothetical protein  27.89 
 
 
398 aa  48.5  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2355  protein of unknown function DUF405  31.25 
 
 
364 aa  48.5  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3565  protein of unknown function DUF418  31.58 
 
 
431 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.708888  normal  0.443247 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4881  hypothetical protein  26.27 
 
 
390 aa  47.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00420784  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0190  hypothetical protein  25.67 
 
 
428 aa  47  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.55784  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4916  protein of unknown function DUF418  26.67 
 
 
401 aa  47  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.511749  normal  0.649012 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0179  hypothetical protein  27.56 
 
 
381 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000571802  hitchhiker  1.74871e-35 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1628  hypothetical protein  29.75 
 
 
387 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000608067  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0045  hypothetical protein  25.91 
 
 
389 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000457904  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0691  hypothetical protein  24 
 
 
381 aa  45.8  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0820  hypothetical protein  26.59 
 
 
365 aa  45.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0178  hypothetical protein  27.56 
 
 
381 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3067  hypothetical protein  31.4 
 
 
404 aa  44.3  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0733  protein of unknown function DUF405  30.08 
 
 
398 aa  44.3  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2383  hypothetical protein  31.01 
 
 
380 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.76362 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2427  hypothetical protein  31.01 
 
 
380 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.901091 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2338  hypothetical protein  31.01 
 
 
380 aa  43.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.890901  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2541  hypothetical protein  31.01 
 
 
380 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0379465  normal  0.156144 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>