133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2383 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2383  hypothetical protein  100 
 
 
380 aa  748    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.76362 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2427  hypothetical protein  100 
 
 
380 aa  748    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.901091 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2431  hypothetical protein  99.21 
 
 
380 aa  742    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.503306  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2338  hypothetical protein  99.74 
 
 
380 aa  746    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.890901  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2541  hypothetical protein  99.47 
 
 
380 aa  746    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0379465  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2286  hypothetical protein  85.15 
 
 
385 aa  630  1e-179  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2447  hypothetical protein  84.39 
 
 
385 aa  629  1e-179  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1496  hypothetical protein  84.88 
 
 
385 aa  628  1e-179  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3286  hypothetical protein  84.62 
 
 
385 aa  628  1e-179  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.385085  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02081  conserved inner membrane protein  84.35 
 
 
385 aa  626  1e-178  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.452541  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1506  protein of unknown function DUF418  84.62 
 
 
385 aa  626  1e-178  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.253618  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2299  hypothetical protein  83.95 
 
 
385 aa  624  1e-178  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383736 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0814  hypothetical protein  84.13 
 
 
385 aa  626  1e-178  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2752  hypothetical protein  77.98 
 
 
385 aa  607  1e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.915358  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1561  hypothetical protein  65.08 
 
 
393 aa  472  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1671  hypothetical protein  60.92 
 
 
395 aa  443  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2469  hypothetical protein  60.48 
 
 
388 aa  435  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3015  hypothetical protein  60.74 
 
 
388 aa  435  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00833892 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2567  hypothetical protein  60.74 
 
 
388 aa  436  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1942  hypothetical protein  58.11 
 
 
391 aa  429  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.235403  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2305  hypothetical protein  54.64 
 
 
391 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2404  hypothetical protein  56.3 
 
 
382 aa  395  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.334101  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0076  protein of unknown function DUF418  36.48 
 
 
416 aa  186  7e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.477208  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1538  protein of unknown function DUF405  36.95 
 
 
406 aa  183  5.0000000000000004e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2860  protein of unknown function DUF418  35.32 
 
 
415 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0733  protein of unknown function DUF405  34.88 
 
 
398 aa  172  1e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2290  protein of unknown function DUF405  33.33 
 
 
391 aa  170  4e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.578329  normal  0.0235381 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0190  hypothetical protein  33.76 
 
 
428 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.55784  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2201  hypothetical protein  30.67 
 
 
416 aa  151  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.964455  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2885  protein of unknown function DUF405  33.17 
 
 
414 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.802913  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0775  hypothetical protein  31.17 
 
 
401 aa  135  9e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0095945  normal  0.285929 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01909  transport protein  34.8 
 
 
409 aa  132  6.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.694528  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1661  transport protein  31.86 
 
 
430 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.414626  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1608  hypothetical protein  31.86 
 
 
430 aa  124  4e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3565  protein of unknown function DUF418  29.31 
 
 
431 aa  123  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.708888  normal  0.443247 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3566  protein of unknown function DUF418  29.61 
 
 
459 aa  123  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.726105 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4786  hypothetical protein  32.36 
 
 
406 aa  122  8e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6743  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0455  hypothetical protein  30.51 
 
 
415 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222068  hitchhiker  0.00425561 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4423  hypothetical protein  27.03 
 
 
417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00407884  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4881  hypothetical protein  26 
 
 
390 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00420784  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0045  hypothetical protein  25.5 
 
 
389 aa  106  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000457904  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3078  hypothetical protein  27.53 
 
 
411 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3230  hypothetical protein  27.27 
 
 
411 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3087  hypothetical protein  26.92 
 
 
411 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4097  hypothetical protein  27.65 
 
 
399 aa  100  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0820  hypothetical protein  29.8 
 
 
365 aa  99.8  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1289  protein of unknown function DUF405  27.11 
 
 
401 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2355  protein of unknown function DUF405  29.57 
 
 
364 aa  99.8  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1396  hypothetical protein  27.2 
 
 
399 aa  98.6  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2066  protein of unknown function DUF418  28.11 
 
 
404 aa  97.8  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0837783  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2799  hypothetical protein  27.05 
 
 
414 aa  96.7  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2882  hypothetical protein  26.74 
 
 
414 aa  94.4  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5273  hypothetical protein  25 
 
 
312 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4804  transmembrane protein  24.47 
 
 
312 aa  92.4  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000142062  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0691  hypothetical protein  30.67 
 
 
381 aa  92.4  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1066  hypothetical protein  26.62 
 
 
401 aa  91.7  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2978  hypothetical protein  26.8 
 
 
414 aa  91.3  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1203  hypothetical protein  26.41 
 
 
398 aa  90.5  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2115  protein of unknown function DUF418  25 
 
 
412 aa  86.3  9e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3067  hypothetical protein  27.63 
 
 
404 aa  84  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4916  protein of unknown function DUF418  27.78 
 
 
401 aa  83.6  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.511749  normal  0.649012 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0252  protein of unknown function DUF405  30.3 
 
 
410 aa  83.6  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4860  hypothetical protein  29.92 
 
 
387 aa  82.8  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138362  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3043  hypothetical protein  26.08 
 
 
382 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0179  hypothetical protein  25 
 
 
381 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000571802  hitchhiker  1.74871e-35 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1699  hypothetical protein  24.08 
 
 
387 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1739  hypothetical protein  23.82 
 
 
387 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00248027  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0178  hypothetical protein  24.75 
 
 
381 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0117  membrane protein  24.75 
 
 
381 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000725343  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1119  protein of unknown function DUF405  26.97 
 
 
381 aa  76.6  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1628  hypothetical protein  24.29 
 
 
387 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000608067  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2327  hypothetical protein  30.3 
 
 
388 aa  75.5  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4889  hypothetical protein  24.22 
 
 
340 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1492  hypothetical protein  24.69 
 
 
387 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.512867  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3717  hypothetical protein  24.42 
 
 
387 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00200  predicted membrane protein  25.99 
 
 
397 aa  72.4  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.220914 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1450  hypothetical protein  24.48 
 
 
387 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000207641  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0666  protein of unknown function DUF405  26.01 
 
 
362 aa  71.2  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000167692  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0683  protein of unknown function DUF405  34.13 
 
 
387 aa  70.9  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1449  hypothetical protein  24.94 
 
 
387 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.831542  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1663  hypothetical protein  24.94 
 
 
387 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14550  predicted membrane protein  27.41 
 
 
384 aa  70.1  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127501  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4882  hypothetical protein  24.22 
 
 
340 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5203  conserved membrane spanning protein  40 
 
 
347 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1477  hypothetical protein  24.69 
 
 
387 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.117063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1593  hypothetical protein  24.69 
 
 
387 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0015  hypothetical protein  36.72 
 
 
381 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.428508  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8135  hypothetical protein  26.76 
 
 
397 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026592  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0746  protein of unknown function DUF405  33.56 
 
 
204 aa  67  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.685935 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1198  hypothetical protein  25.62 
 
 
399 aa  66.2  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24980  predicted membrane protein  25.56 
 
 
412 aa  65.5  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.740551  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2840  hypothetical protein  25.7 
 
 
414 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.110654 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4921  hypothetical protein  29.2 
 
 
265 aa  63.5  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0008351  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0622  hypothetical protein  25.3 
 
 
439 aa  62.8  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25010  predicted membrane protein  26.77 
 
 
417 aa  62.8  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1415  protein of unknown function DUF405  24.87 
 
 
399 aa  62.4  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.845184  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0609  hypothetical protein  27.23 
 
 
787 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8802  hypothetical protein  25.26 
 
 
362 aa  60.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0379  hypothetical protein  39.71 
 
 
340 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1888  hypothetical protein  25.92 
 
 
389 aa  59.7  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>