122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_07880 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_07880  predicted membrane protein  100 
 
 		 407 aa  760    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8135  hypothetical protein  37.66 
 
 		 397 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026592  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1668  protein of unknown function DUF418  37.53 
 
 		 420 aa  156  7e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2581  hypothetical protein  36.72 
 
 		 388 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.365833  normal  0.0605789 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0505  protein of unknown function DUF418  37.53 
 
 		 407 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000344824 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1416  protein of unknown function DUF405  35.75 
 
 		 407 aa  147  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.548338  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1415  protein of unknown function DUF405  35.58 
 
 		 399 aa  135  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.845184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0072  hypothetical protein  35.13 
 
 		 380 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1670  hypothetical protein  33.33 
 
 		 405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.704713  normal  0.19338 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4293  protein of unknown function DUF418  35.95 
 
 		 390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3529  protein of unknown function DUF418  34.9 
 
 		 398 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.296308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15990  predicted membrane protein  35.25 
 
 		 414 aa  127  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.230384 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0719  protein of unknown function DUF418  34 
 
 		 405 aa  123  5e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.699875  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0622  hypothetical protein  34.81 
 
 		 439 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1063  protein of unknown function DUF405  33.8 
 
 		 472 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1461  hypothetical protein  34.01 
 
 		 401 aa  116  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4741  hypothetical protein  31.97 
 
 		 392 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.400946  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24880  predicted membrane protein  33.09 
 
 		 432 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0615892  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2152  hypothetical protein  32.99 
 
 		 393 aa  113  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.391046 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0035  hypothetical protein  33.25 
 
 		 402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0984  protein of unknown function DUF418  35.25 
 
 		 387 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0392587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1236  hypothetical protein  34.27 
 
 		 399 aa  99  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3780  hypothetical protein  31.19 
 
 		 401 aa  96.3  8e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1078  protein of unknown function DUF418  34.09 
 
 		 384 aa  91.3  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4159  hypothetical protein  32.51 
 
 		 401 aa  90.1  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.776458  decreased coverage  0.000152397 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4423  hypothetical protein  27.71 
 
 		 417 aa  84.3  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00407884  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2327  hypothetical protein  31.03 
 
 		 388 aa  80.9  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1661  transport protein  34.04 
 
 		 430 aa  80.5  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.414626  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1608  hypothetical protein  31.18 
 
 		 430 aa  78.6  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2840  hypothetical protein  30.15 
 
 		 414 aa  77  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.110654 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1538  protein of unknown function DUF405  27.97 
 
 		 406 aa  75.1  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3111  protein of unknown function DUF418  37.23 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2860  protein of unknown function DUF418  29.75 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0455  hypothetical protein  39.02 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222068  hitchhiker  0.00425561 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1499  protein of unknown function DUF405  27.54 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00200  predicted membrane protein  27.57 
 
 		 397 aa  72  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.220914 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0746  protein of unknown function DUF405  35.66 
 
 		 204 aa  69.3  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.685935 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2290  protein of unknown function DUF405  27.62 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.578329  normal  0.0235381 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3571  protein of unknown function DUF418  31.82 
 
 		 405 aa  67.8  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.983337  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2066  protein of unknown function DUF418  25.06 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0837783  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4804  transmembrane protein  24.05 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000142062  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0117  membrane protein  31.88 
 
 		 381 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000725343  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5273  hypothetical protein  23.78 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2885  protein of unknown function DUF405  34.31 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.802913  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0015  hypothetical protein  30.34 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.428508  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3043  hypothetical protein  23.16 
 
 		 382 aa  60.8  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01909  transport protein  38.05 
 
 		 409 aa  60.1  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.694528  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0179  hypothetical protein  28.57 
 
 		 381 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000571802  hitchhiker  1.74871e-35 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0733  protein of unknown function DUF405  35.22 
 
 		 398 aa  58.9  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0775  hypothetical protein  35.34 
 
 		 401 aa  57  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0095945  normal  0.285929 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1066  hypothetical protein  27.56 
 
 		 401 aa  55.8  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1171  protein of unknown function DUF418  25.21 
 
 		 394 aa  56.2  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1119  protein of unknown function DUF405  26.96 
 
 		 381 aa  56.2  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5203  conserved membrane spanning protein  33.33 
 
 		 347 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0683  protein of unknown function DUF405  23.91 
 
 		 387 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6573  hypothetical protein  33.33 
 
 		 315 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00469917  normal  0.0258575 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0178  hypothetical protein  28.19 
 
 		 381 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0252  protein of unknown function DUF405  35.25 
 
 		 410 aa  54.7  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0190  hypothetical protein  31.46 
 
 		 428 aa  54.3  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.55784  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4097  hypothetical protein  23.94 
 
 		 399 aa  54.3  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0076  protein of unknown function DUF418  32.28 
 
 		 416 aa  53.9  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.477208  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1699  hypothetical protein  31.03 
 
 		 387 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3067  hypothetical protein  28.61 
 
 		 404 aa  52.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0609  hypothetical protein  38.26 
 
 		 787 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3607  protein of unknown function DUF418  36.36 
 
 		 407 aa  52.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.526186  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3717  hypothetical protein  28.12 
 
 		 387 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2305  hypothetical protein  34.33 
 
 		 391 aa  52.4  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1671  hypothetical protein  34.93 
 
 		 395 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1739  hypothetical protein  31.03 
 
 		 387 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00248027  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1628  hypothetical protein  30.83 
 
 		 387 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000608067  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0045  hypothetical protein  28.48 
 
 		 389 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000457904  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2404  hypothetical protein  35.77 
 
 		 382 aa  52.4  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.334101  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8802  hypothetical protein  38.46 
 
 		 362 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2882  hypothetical protein  23.86 
 
 		 414 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3078  hypothetical protein  23.04 
 
 		 411 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3230  hypothetical protein  23.51 
 
 		 411 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3087  hypothetical protein  23.53 
 
 		 411 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4881  hypothetical protein  28.67 
 
 		 390 aa  50.8  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00420784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1450  hypothetical protein  30.34 
 
 		 387 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000207641  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2115  protein of unknown function DUF418  27.04 
 
 		 412 aa  50.4  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1477  hypothetical protein  29.86 
 
 		 387 aa  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.117063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1593  hypothetical protein  29.86 
 
 		 387 aa  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1449  hypothetical protein  29.86 
 
 		 387 aa  49.7  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.831542  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1663  hypothetical protein  29.86 
 
 		 387 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2799  hypothetical protein  27.13 
 
 		 414 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1492  hypothetical protein  29.66 
 
 		 387 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.512867  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1289  protein of unknown function DUF405  23.53 
 
 		 401 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4858  hypothetical protein  28.38 
 
 		 340 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2978  hypothetical protein  27.13 
 
 		 414 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4479  membrane spanning protein  28.57 
 
 		 340 aa  47.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4497  membrane spanning protein  28.57 
 
 		 340 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4916  protein of unknown function DUF418  25.5 
 
 		 401 aa  47  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.511749  normal  0.649012 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0031  protein of unknown function DUF405  34.85 
 
 		 352 aa  47.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1942  hypothetical protein  30.99 
 
 		 391 aa  46.6  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.235403  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4889  hypothetical protein  28.38 
 
 		 340 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2752  hypothetical protein  29.32 
 
 		 385 aa  46.2  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.915358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1818  hypothetical protein  33.11 
 
 		 415 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4882  hypothetical protein  29.77 
 
 		 340 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4868  hypothetical protein  27.89 
 
 		 340 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4644  hypothetical protein  27.89 
 
 		 340 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>