127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3111 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3111  protein of unknown function DUF418  100 
 
 		 443 aa  843    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0622  hypothetical protein  61.82 
 
 		 439 aa  425  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1668  protein of unknown function DUF418  50.25 
 
 		 420 aa  348  1e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620816  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1063  protein of unknown function DUF405  54.39 
 
 		 472 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1461  hypothetical protein  49.63 
 
 		 401 aa  295  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3607  protein of unknown function DUF418  48.77 
 
 		 407 aa  285  1.0000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.526186  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15990  predicted membrane protein  47.89 
 
 		 414 aa  281  2e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.230384 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2581  hypothetical protein  45.23 
 
 		 388 aa  260  3e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.365833  normal  0.0605789 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24880  predicted membrane protein  43.98 
 
 		 432 aa  241  2e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0615892  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8135  hypothetical protein  43.8 
 
 		 397 aa  239  6.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026592  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1670  hypothetical protein  42.12 
 
 		 405 aa  234  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.704713  normal  0.19338 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3529  protein of unknown function DUF418  38.1 
 
 		 398 aa  211  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.296308  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1416  protein of unknown function DUF405  42.16 
 
 		 407 aa  209  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.548338  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1415  protein of unknown function DUF405  41.62 
 
 		 399 aa  205  1e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.845184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4741  hypothetical protein  41 
 
 		 392 aa  202  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.400946  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0072  hypothetical protein  44.78 
 
 		 380 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484765  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0505  protein of unknown function DUF418  41.75 
 
 		 407 aa  201  3e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000344824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0035  hypothetical protein  39.23 
 
 		 402 aa  193  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4293  protein of unknown function DUF418  42.39 
 
 		 390 aa  193  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2152  hypothetical protein  36 
 
 		 393 aa  188  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.391046 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0719  protein of unknown function DUF418  44.72 
 
 		 405 aa  188  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.699875  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1236  hypothetical protein  38.65 
 
 		 399 aa  178  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1078  protein of unknown function DUF418  38.18 
 
 		 384 aa  166  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3780  hypothetical protein  38.13 
 
 		 401 aa  155  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4159  hypothetical protein  37.22 
 
 		 401 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.776458  decreased coverage  0.000152397 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0984  protein of unknown function DUF418  38.93 
 
 		 387 aa  141  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0392587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07880  predicted membrane protein  34.83 
 
 		 407 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0455  hypothetical protein  31.76 
 
 		 415 aa  127  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222068  hitchhiker  0.00425561 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4423  hypothetical protein  29.62 
 
 		 417 aa  123  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00407884  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1661  transport protein  28.83 
 
 		 430 aa  97.1  6e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.414626  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1608  hypothetical protein  28.6 
 
 		 430 aa  97.1  6e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2885  protein of unknown function DUF405  31.23 
 
 		 414 aa  96.3  9e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.802913  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0015  hypothetical protein  24.44 
 
 		 381 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.428508  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0117  membrane protein  23.89 
 
 		 381 aa  93.6  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000725343  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0285  protein of unknown function DUF418  25.73 
 
 		 409 aa  93.2  8e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0178  hypothetical protein  24.63 
 
 		 381 aa  93.2  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0190  hypothetical protein  32.79 
 
 		 428 aa  93.2  9e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.55784  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2115  protein of unknown function DUF418  23.99 
 
 		 412 aa  91.7  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0179  hypothetical protein  23.82 
 
 		 381 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000571802  hitchhiker  1.74871e-35 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0683  protein of unknown function DUF405  26.8 
 
 		 387 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30910  predicted membrane protein  31.98 
 
 		 392 aa  88.6  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1499  protein of unknown function DUF405  29.51 
 
 		 388 aa  87  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4881  hypothetical protein  25.19 
 
 		 390 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00420784  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0746  protein of unknown function DUF405  34.93 
 
 		 204 aa  82.4  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.685935 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0045  hypothetical protein  24.11 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000457904  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2290  protein of unknown function DUF405  27.72 
 
 		 391 aa  79.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.578329  normal  0.0235381 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2327  hypothetical protein  33.81 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01909  transport protein  29.3 
 
 		 409 aa  74.7  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.694528  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2066  protein of unknown function DUF418  25.58 
 
 		 404 aa  73.9  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0837783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00200  predicted membrane protein  26.57 
 
 		 397 aa  73.6  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.220914 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3571  protein of unknown function DUF418  29.83 
 
 		 405 aa  72.8  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.983337  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4097  hypothetical protein  24.2 
 
 		 399 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1396  hypothetical protein  26.11 
 
 		 399 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2840  hypothetical protein  27.45 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.110654 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3566  protein of unknown function DUF418  26.73 
 
 		 459 aa  67.8  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.726105 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1477  hypothetical protein  29.89 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.117063  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1449  hypothetical protein  29.89 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.831542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1593  hypothetical protein  29.89 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1663  hypothetical protein  29.89 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2383  hypothetical protein  28.88 
 
 		 380 aa  67  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.76362 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2427  hypothetical protein  28.88 
 
 		 380 aa  67  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.901091 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2431  hypothetical protein  28.88 
 
 		 380 aa  67  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.503306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3067  hypothetical protein  29.92 
 
 		 404 aa  65.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2338  hypothetical protein  28.64 
 
 		 380 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.890901  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1628  hypothetical protein  23.08 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000608067  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1538  protein of unknown function DUF405  28.07 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1198  hypothetical protein  22.76 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1739  hypothetical protein  23.52 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00248027  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3717  hypothetical protein  22.86 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1699  hypothetical protein  22.62 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2201  hypothetical protein  26.1 
 
 		 416 aa  63.2  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.964455  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2752  hypothetical protein  26.81 
 
 		 385 aa  63.2  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.915358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3286  hypothetical protein  25.53 
 
 		 385 aa  63.2  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.385085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2447  hypothetical protein  25.65 
 
 		 385 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3087  hypothetical protein  22.78 
 
 		 411 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1496  hypothetical protein  25.42 
 
 		 385 aa  62  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1289  protein of unknown function DUF405  23.02 
 
 		 401 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.34904 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02081  conserved inner membrane protein  25.42 
 
 		 385 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.452541  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1450  hypothetical protein  21.95 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000207641  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3230  hypothetical protein  22.78 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1492  hypothetical protein  21.29 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.512867  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2286  hypothetical protein  25.18 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1066  hypothetical protein  27.82 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1506  protein of unknown function DUF418  25.42 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.253618  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4804  transmembrane protein  34.04 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000142062  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0814  hypothetical protein  25.53 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5273  hypothetical protein  34.04 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0820  hypothetical protein  31.47 
 
 		 365 aa  59.7  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2882  hypothetical protein  24.7 
 
 		 414 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2978  hypothetical protein  25.28 
 
 		 414 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3078  hypothetical protein  23.72 
 
 		 411 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0666  protein of unknown function DUF405  24.81 
 
 		 362 aa  59.3  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000167692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0076  protein of unknown function DUF418  36.92 
 
 		 416 aa  58.9  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.477208  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0252  protein of unknown function DUF405  27.91 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1942  hypothetical protein  24.57 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.235403  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3043  hypothetical protein  31.13 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2355  protein of unknown function DUF405  27.23 
 
 		 364 aa  57.4  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2799  hypothetical protein  24.41 
 
 		 414 aa  57  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2299  hypothetical protein  25.3 
 
 		 385 aa  56.6  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383736 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0775  hypothetical protein  27.52 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0095945  normal  0.285929 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>