145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3571 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3571  protein of unknown function DUF418  100 
 
 		 405 aa  797    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.983337  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0252  protein of unknown function DUF405  49.6 
 
 		 410 aa  242  7.999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30910  predicted membrane protein  44.53 
 
 		 392 aa  239  8e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2840  hypothetical protein  38.42 
 
 		 414 aa  203  6e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.110654 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1661  transport protein  34.38 
 
 		 430 aa  173  5e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.414626  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1608  hypothetical protein  34.38 
 
 		 430 aa  172  6.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4423  hypothetical protein  34.37 
 
 		 417 aa  160  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00407884  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0455  hypothetical protein  33.97 
 
 		 415 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222068  hitchhiker  0.00425561 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2885  protein of unknown function DUF405  33.9 
 
 		 414 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.802913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0683  protein of unknown function DUF405  29.25 
 
 		 387 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0045  hypothetical protein  28.05 
 
 		 389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000457904  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2860  protein of unknown function DUF418  31.41 
 
 		 415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4881  hypothetical protein  27.76 
 
 		 390 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00420784  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01909  transport protein  35.35 
 
 		 409 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.694528  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2115  protein of unknown function DUF418  28.92 
 
 		 412 aa  130  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0285  protein of unknown function DUF418  29.17 
 
 		 409 aa  127  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1499  protein of unknown function DUF405  33.25 
 
 		 388 aa  126  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2066  protein of unknown function DUF418  28.89 
 
 		 404 aa  123  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0837783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1818  hypothetical protein  30.67 
 
 		 415 aa  122  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2355  protein of unknown function DUF405  32.99 
 
 		 364 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0820  hypothetical protein  34.02 
 
 		 365 aa  120  6e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0775  hypothetical protein  28.54 
 
 		 401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0095945  normal  0.285929 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1171  protein of unknown function DUF418  29.73 
 
 		 394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2201  hypothetical protein  29.67 
 
 		 416 aa  114  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.964455  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3717  hypothetical protein  25.92 
 
 		 387 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0190  hypothetical protein  33.17 
 
 		 428 aa  113  5e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.55784  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1699  hypothetical protein  25.98 
 
 		 387 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1739  hypothetical protein  26.35 
 
 		 387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00248027  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1538  protein of unknown function DUF405  30.56 
 
 		 406 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0117  membrane protein  26.58 
 
 		 381 aa  109  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000725343  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0733  protein of unknown function DUF405  29.12 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0015  hypothetical protein  27.09 
 
 		 381 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.428508  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3566  protein of unknown function DUF418  28.12 
 
 		 459 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.726105 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1628  hypothetical protein  27.45 
 
 		 387 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000608067  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.46 
 
 		 410 aa  105  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.037271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3565  protein of unknown function DUF418  28.27 
 
 		 431 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.708888  normal  0.443247 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0666  protein of unknown function DUF405  24.42 
 
 		 362 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000167692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4786  hypothetical protein  31.03 
 
 		 406 aa  103  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1492  hypothetical protein  27.07 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.512867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1449  hypothetical protein  27.12 
 
 		 387 aa  100  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.831542  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1663  hypothetical protein  27.12 
 
 		 387 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1477  hypothetical protein  26.88 
 
 		 387 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.117063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1593  hypothetical protein  26.88 
 
 		 387 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1198  hypothetical protein  25.44 
 
 		 399 aa  97.8  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1671  hypothetical protein  28.64 
 
 		 395 aa  97.4  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0371  hypothetical protein  30.19 
 
 		 397 aa  97.1  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2327  hypothetical protein  31.77 
 
 		 388 aa  96.3  8e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4804  transmembrane protein  24.27 
 
 		 312 aa  96.3  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000142062  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1304  hypothetical protein  28.12 
 
 		 388 aa  95.1  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1450  hypothetical protein  27.25 
 
 		 387 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000207641  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0178  hypothetical protein  25.63 
 
 		 381 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4860  hypothetical protein  30.67 
 
 		 387 aa  90.9  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0179  hypothetical protein  26.08 
 
 		 381 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000571802  hitchhiker  1.74871e-35 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1066  hypothetical protein  28.5 
 
 		 401 aa  89.7  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3067  hypothetical protein  30.9 
 
 		 404 aa  89.4  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2290  protein of unknown function DUF405  29.18 
 
 		 391 aa  89  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.578329  normal  0.0235381 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00200  predicted membrane protein  26.16 
 
 		 397 aa  89  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.220914 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5273  hypothetical protein  23.75 
 
 		 312 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2305  hypothetical protein  28.95 
 
 		 391 aa  87  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2581  hypothetical protein  30.06 
 
 		 388 aa  86.3  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.365833  normal  0.0605789 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4921  hypothetical protein  28.88 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0008351  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8135  hypothetical protein  29.41 
 
 		 397 aa  84  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026592  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1942  hypothetical protein  26.68 
 
 		 391 aa  82  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.235403  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2752  hypothetical protein  26.73 
 
 		 385 aa  79.7  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.915358  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4916  protein of unknown function DUF418  28.43 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.511749  normal  0.649012 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3078  hypothetical protein  23.72 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1736  protein of unknown function DUF405  27.32 
 
 		 410 aa  78.2  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.310002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1289  protein of unknown function DUF405  23.84 
 
 		 401 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3087  hypothetical protein  23.6 
 
 		 411 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07880  predicted membrane protein  31.18 
 
 		 407 aa  77  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3043  hypothetical protein  24.82 
 
 		 382 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3230  hypothetical protein  23.47 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2152  hypothetical protein  27.61 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.391046 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0746  protein of unknown function DUF405  34.29 
 
 		 204 aa  75.5  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.685935 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1668  protein of unknown function DUF418  27.57 
 
 		 420 aa  74.3  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0076  protein of unknown function DUF418  45.26 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.477208  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0035  hypothetical protein  29.07 
 
 		 402 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3529  protein of unknown function DUF418  29.62 
 
 		 398 aa  71.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.296308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1203  hypothetical protein  23.66 
 
 		 398 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1396  hypothetical protein  23.79 
 
 		 399 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24880  predicted membrane protein  30.02 
 
 		 432 aa  69.3  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0615892  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1236  hypothetical protein  29.75 
 
 		 399 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4868  hypothetical protein  35.88 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4479  membrane spanning protein  35.88 
 
 		 340 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6573  hypothetical protein  40.48 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00469917  normal  0.0258575 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4497  membrane spanning protein  35.88 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2404  hypothetical protein  26.62 
 
 		 382 aa  67.4  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.334101  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4097  hypothetical protein  22.19 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2882  hypothetical protein  23.11 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1063  protein of unknown function DUF405  33.85 
 
 		 472 aa  66.2  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4882  hypothetical protein  35.11 
 
 		 340 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1007  protein of unknown function DUF405  41 
 
 		 327 aa  65.9  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.120891  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1888  hypothetical protein  28.17 
 
 		 389 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4644  hypothetical protein  35.11 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0622  hypothetical protein  29.3 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4998  hypothetical protein  35.11 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8802  hypothetical protein  39.86 
 
 		 362 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0379  hypothetical protein  35.11 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4889  hypothetical protein  35.11 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14550  predicted membrane protein  27.16 
 
 		 384 aa  64.7  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127501  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>