138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2290 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_2290  protein of unknown function DUF405  100 
 
 
391 aa  760    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.578329  normal  0.0235381 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2860  protein of unknown function DUF418  40.1 
 
 
415 aa  248  1e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0733  protein of unknown function DUF405  39.85 
 
 
398 aa  216  8e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0076  protein of unknown function DUF418  37.91 
 
 
416 aa  212  7.999999999999999e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.477208  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1538  protein of unknown function DUF405  34.68 
 
 
406 aa  183  5.0000000000000004e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0190  hypothetical protein  37.4 
 
 
428 aa  176  4e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.55784  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1942  hypothetical protein  35.19 
 
 
391 aa  176  7e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.235403  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0814  hypothetical protein  33.76 
 
 
385 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2447  hypothetical protein  33.76 
 
 
385 aa  173  5e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3286  hypothetical protein  33.76 
 
 
385 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.385085  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02081  conserved inner membrane protein  33.5 
 
 
385 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.452541  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1506  protein of unknown function DUF418  33.5 
 
 
385 aa  171  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.253618  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2299  hypothetical protein  33.5 
 
 
385 aa  171  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383736 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2286  hypothetical protein  33.25 
 
 
385 aa  168  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1561  hypothetical protein  33.92 
 
 
393 aa  168  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2431  hypothetical protein  31.74 
 
 
380 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.503306  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2338  hypothetical protein  31.74 
 
 
380 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.890901  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1671  hypothetical protein  34.43 
 
 
395 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1496  hypothetical protein  33.25 
 
 
385 aa  167  4e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2383  hypothetical protein  31.74 
 
 
380 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.76362 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2427  hypothetical protein  31.74 
 
 
380 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.901091 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2752  hypothetical protein  32.83 
 
 
385 aa  165  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.915358  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2541  hypothetical protein  31.74 
 
 
380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0379465  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2201  hypothetical protein  31.99 
 
 
416 aa  162  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.964455  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3565  protein of unknown function DUF418  30.82 
 
 
431 aa  160  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.708888  normal  0.443247 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2305  hypothetical protein  34.5 
 
 
391 aa  158  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0775  hypothetical protein  32.24 
 
 
401 aa  155  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0095945  normal  0.285929 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3015  hypothetical protein  33.33 
 
 
388 aa  150  5e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00833892 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2567  hypothetical protein  33.33 
 
 
388 aa  149  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2469  hypothetical protein  33.08 
 
 
388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4423  hypothetical protein  33.66 
 
 
417 aa  132  7.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00407884  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2404  hypothetical protein  32.75 
 
 
382 aa  132  7.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.334101  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0455  hypothetical protein  31.51 
 
 
415 aa  126  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222068  hitchhiker  0.00425561 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3566  protein of unknown function DUF418  29.84 
 
 
459 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.726105 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4786  hypothetical protein  31.53 
 
 
406 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6743  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1203  hypothetical protein  27.81 
 
 
398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2115  protein of unknown function DUF418  27.19 
 
 
412 aa  114  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4097  hypothetical protein  26.18 
 
 
399 aa  108  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1396  hypothetical protein  28.94 
 
 
399 aa  104  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3087  hypothetical protein  25.37 
 
 
411 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3230  hypothetical protein  25.37 
 
 
411 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1289  protein of unknown function DUF405  25.62 
 
 
401 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3067  hypothetical protein  31.07 
 
 
404 aa  103  8e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2885  protein of unknown function DUF405  30.41 
 
 
414 aa  103  8e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.802913  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3078  hypothetical protein  24.88 
 
 
411 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1608  hypothetical protein  27.86 
 
 
430 aa  101  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0683  protein of unknown function DUF405  26.12 
 
 
387 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2882  hypothetical protein  27.64 
 
 
414 aa  101  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2978  hypothetical protein  27.39 
 
 
414 aa  100  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1661  transport protein  27.62 
 
 
430 aa  100  6e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.414626  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0691  hypothetical protein  28.32 
 
 
381 aa  99  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2799  hypothetical protein  28.14 
 
 
414 aa  98.6  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2840  hypothetical protein  29.85 
 
 
414 aa  98.2  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.110654 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2355  protein of unknown function DUF405  28.75 
 
 
364 aa  97.4  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0045  hypothetical protein  25.94 
 
 
389 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000457904  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4881  hypothetical protein  25.69 
 
 
390 aa  92.8  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00420784  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2066  protein of unknown function DUF418  24.4 
 
 
404 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0837783  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4860  hypothetical protein  31.19 
 
 
387 aa  90.5  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138362  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0117  membrane protein  24.87 
 
 
381 aa  90.1  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000725343  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1198  hypothetical protein  27.25 
 
 
399 aa  90.5  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2581  hypothetical protein  29.75 
 
 
388 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.365833  normal  0.0605789 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3043  hypothetical protein  22.72 
 
 
382 aa  87.8  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30910  predicted membrane protein  30.58 
 
 
392 aa  87.8  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0015  hypothetical protein  24.62 
 
 
381 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.428508  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4916  protein of unknown function DUF418  26.67 
 
 
401 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.511749  normal  0.649012 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0179  hypothetical protein  25.31 
 
 
381 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000571802  hitchhiker  1.74871e-35 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3571  protein of unknown function DUF418  28.86 
 
 
405 aa  84.3  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.983337  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01909  transport protein  28.81 
 
 
409 aa  84.3  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.694528  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1199  hypothetical protein  26.2 
 
 
398 aa  81.6  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1066  hypothetical protein  27.11 
 
 
401 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0820  hypothetical protein  28.39 
 
 
365 aa  80.9  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0285  protein of unknown function DUF418  24.75 
 
 
409 aa  80.5  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00200  predicted membrane protein  28.15 
 
 
397 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.220914 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0178  hypothetical protein  25.56 
 
 
381 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1499  protein of unknown function DUF405  27.09 
 
 
388 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.56 
 
 
410 aa  76.3  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.037271 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0371  hypothetical protein  27.63 
 
 
397 aa  74.3  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0252  protein of unknown function DUF405  41.07 
 
 
410 aa  73.2  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0505  protein of unknown function DUF418  27.8 
 
 
407 aa  70.9  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000344824 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1739  hypothetical protein  23.94 
 
 
387 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00248027  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0666  protein of unknown function DUF405  22.28 
 
 
362 aa  70.1  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000167692  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0622  hypothetical protein  29.28 
 
 
439 aa  69.7  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3717  hypothetical protein  24.19 
 
 
387 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1119  protein of unknown function DUF405  28.98 
 
 
381 aa  68.2  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1492  hypothetical protein  23.72 
 
 
387 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.512867  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1699  hypothetical protein  23.25 
 
 
387 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1818  hypothetical protein  26.87 
 
 
415 aa  67.8  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0746  protein of unknown function DUF405  30.15 
 
 
204 aa  67.8  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.685935 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1646  protein of unknown function DUF405  28.32 
 
 
394 aa  67.8  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2327  hypothetical protein  28.5 
 
 
388 aa  66.6  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1668  protein of unknown function DUF418  26.45 
 
 
420 aa  66.2  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620816  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1736  protein of unknown function DUF405  27.74 
 
 
410 aa  66.2  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.310002  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1628  hypothetical protein  28.34 
 
 
387 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000608067  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1449  hypothetical protein  23.97 
 
 
387 aa  65.1  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.831542  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1663  hypothetical protein  23.97 
 
 
387 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1477  hypothetical protein  23.71 
 
 
387 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.117063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1593  hypothetical protein  23.71 
 
 
387 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1450  hypothetical protein  28.35 
 
 
387 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000207641  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1171  protein of unknown function DUF418  23.51 
 
 
394 aa  62  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2152  hypothetical protein  26.18 
 
 
393 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.391046 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>