110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_24880 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_24880  predicted membrane protein  100 
 
 		 432 aa  832    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0615892  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0622  hypothetical protein  42.13 
 
 		 439 aa  264  3e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3607  protein of unknown function DUF418  43.07 
 
 		 407 aa  247  3e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.526186  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1668  protein of unknown function DUF418  42.54 
 
 		 420 aa  242  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15990  predicted membrane protein  43.43 
 
 		 414 aa  237  3e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.230384 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1063  protein of unknown function DUF405  40.84 
 
 		 472 aa  212  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2581  hypothetical protein  38.39 
 
 		 388 aa  204  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.365833  normal  0.0605789 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3111  protein of unknown function DUF418  43.49 
 
 		 443 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8135  hypothetical protein  38.67 
 
 		 397 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026592  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1461  hypothetical protein  36.5 
 
 		 401 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3529  protein of unknown function DUF418  37.9 
 
 		 398 aa  184  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.296308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2152  hypothetical protein  34.21 
 
 		 393 aa  179  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.391046 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0505  protein of unknown function DUF418  35.4 
 
 		 407 aa  172  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000344824 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0719  protein of unknown function DUF418  40.2 
 
 		 405 aa  171  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.699875  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4741  hypothetical protein  36.53 
 
 		 392 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.400946  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1670  hypothetical protein  34.76 
 
 		 405 aa  169  7e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.704713  normal  0.19338 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1236  hypothetical protein  38.89 
 
 		 399 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4293  protein of unknown function DUF418  35.42 
 
 		 390 aa  164  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1416  protein of unknown function DUF405  36.47 
 
 		 407 aa  163  7e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.548338  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1415  protein of unknown function DUF405  36.41 
 
 		 399 aa  159  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.845184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0072  hypothetical protein  39.6 
 
 		 380 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0035  hypothetical protein  36.65 
 
 		 402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0984  protein of unknown function DUF418  37.37 
 
 		 387 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0392587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1078  protein of unknown function DUF418  35.81 
 
 		 384 aa  139  7e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3780  hypothetical protein  34.77 
 
 		 401 aa  126  8.000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4159  hypothetical protein  34.26 
 
 		 401 aa  117  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.776458  decreased coverage  0.000152397 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07880  predicted membrane protein  31.86 
 
 		 407 aa  111  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0683  protein of unknown function DUF405  28.67 
 
 		 387 aa  100  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2327  hypothetical protein  32.41 
 
 		 388 aa  94.7  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4423  hypothetical protein  28.54 
 
 		 417 aa  90.1  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00407884  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0455  hypothetical protein  27.61 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222068  hitchhiker  0.00425561 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5273  hypothetical protein  25.83 
 
 		 312 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4804  transmembrane protein  26.34 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000142062  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3571  protein of unknown function DUF418  29.22 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.983337  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00200  predicted membrane protein  28.87 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.220914 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4881  hypothetical protein  24.12 
 
 		 390 aa  77  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00420784  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0045  hypothetical protein  23.99 
 
 		 389 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000457904  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2066  protein of unknown function DUF418  25.94 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0837783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1499  protein of unknown function DUF405  27.07 
 
 		 388 aa  72.8  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2860  protein of unknown function DUF418  28.94 
 
 		 415 aa  72  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30910  predicted membrane protein  28.68 
 
 		 392 aa  67  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1538  protein of unknown function DUF405  28.97 
 
 		 406 aa  65.9  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0733  protein of unknown function DUF405  32.04 
 
 		 398 aa  66.2  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2290  protein of unknown function DUF405  27.91 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.578329  normal  0.0235381 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2840  hypothetical protein  28.82 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.110654 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0117  membrane protein  23.16 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000725343  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0190  hypothetical protein  29.67 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.55784  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1739  hypothetical protein  26.16 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00248027  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1699  hypothetical protein  25 
 
 		 387 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0015  hypothetical protein  30.34 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.428508  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1449  hypothetical protein  26.54 
 
 		 387 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.831542  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1663  hypothetical protein  26.54 
 
 		 387 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3067  hypothetical protein  29.47 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3566  protein of unknown function DUF418  25.6 
 
 		 459 aa  61.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.726105 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1450  hypothetical protein  26.58 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000207641  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1492  hypothetical protein  26.74 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.512867  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0666  protein of unknown function DUF405  27.11 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000167692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1628  hypothetical protein  26.12 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000608067  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3717  hypothetical protein  24.75 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1477  hypothetical protein  26.27 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.117063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1593  hypothetical protein  26.27 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2115  protein of unknown function DUF418  25.93 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0285  protein of unknown function DUF418  24.44 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0820  hypothetical protein  26.84 
 
 		 365 aa  56.6  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0746  protein of unknown function DUF405  29.22 
 
 		 204 aa  56.2  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.685935 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0775  hypothetical protein  26.88 
 
 		 401 aa  55.1  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0095945  normal  0.285929 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4097  hypothetical protein  24.63 
 
 		 399 aa  55.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2355  protein of unknown function DUF405  29.75 
 
 		 364 aa  55.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2882  hypothetical protein  25.17 
 
 		 414 aa  53.1  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2978  hypothetical protein  23.77 
 
 		 414 aa  53.5  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1066  hypothetical protein  28.41 
 
 		 401 aa  52.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0179  hypothetical protein  29.93 
 
 		 381 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000571802  hitchhiker  1.74871e-35 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1661  transport protein  25.06 
 
 		 430 aa  52  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.414626  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1608  hypothetical protein  25.3 
 
 		 430 aa  52  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0178  hypothetical protein  30.99 
 
 		 381 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6573  hypothetical protein  33.71 
 
 		 315 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00469917  normal  0.0258575 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0252  protein of unknown function DUF405  27.86 
 
 		 410 aa  51.6  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3087  hypothetical protein  25.11 
 
 		 411 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3565  protein of unknown function DUF418  35.8 
 
 		 431 aa  50.8  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.708888  normal  0.443247 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3078  hypothetical protein  24.72 
 
 		 411 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1396  hypothetical protein  21.75 
 
 		 399 aa  50.1  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3230  hypothetical protein  24.94 
 
 		 411 aa  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2305  hypothetical protein  27.95 
 
 		 391 aa  50.1  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1818  hypothetical protein  27.91 
 
 		 415 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1198  hypothetical protein  20.43 
 
 		 399 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1289  protein of unknown function DUF405  24.49 
 
 		 401 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1671  hypothetical protein  24.82 
 
 		 395 aa  49.3  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2799  hypothetical protein  24.59 
 
 		 414 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2201  hypothetical protein  26.65 
 
 		 416 aa  47.8  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.964455  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3043  hypothetical protein  29.84 
 
 		 382 aa  47.8  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0076  protein of unknown function DUF418  34.38 
 
 		 416 aa  47.4  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.477208  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2752  hypothetical protein  25 
 
 		 385 aa  47  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.915358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1203  hypothetical protein  23.02 
 
 		 398 aa  47  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4786  hypothetical protein  25.99 
 
 		 406 aa  46.2  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6743  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4889  hypothetical protein  27.01 
 
 		 340 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4644  hypothetical protein  26 
 
 		 340 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4921  hypothetical protein  21.35 
 
 		 265 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0008351  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4479  membrane spanning protein  26 
 
 		 340 aa  45.8  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4497  membrane spanning protein  26 
 
 		 340 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4998  hypothetical protein  26 
 
 		 340 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>