92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2152 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2152  hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  771    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.391046 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1236  hypothetical protein  51.78 
 
 		 399 aa  337  1.9999999999999998e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1078  protein of unknown function DUF418  41.89 
 
 		 384 aa  236  6e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2581  hypothetical protein  39.29 
 
 		 388 aa  217  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.365833  normal  0.0605789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8135  hypothetical protein  35.68 
 
 		 397 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026592  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4741  hypothetical protein  36.53 
 
 		 392 aa  182  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.400946  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1668  protein of unknown function DUF418  33.08 
 
 		 420 aa  179  8e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620816  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3529  protein of unknown function DUF418  34.55 
 
 		 398 aa  177  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.296308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1670  hypothetical protein  33.66 
 
 		 405 aa  175  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.704713  normal  0.19338 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0622  hypothetical protein  36.67 
 
 		 439 aa  168  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1063  protein of unknown function DUF405  34.34 
 
 		 472 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24880  predicted membrane protein  34.16 
 
 		 432 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0615892  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0719  protein of unknown function DUF418  35.2 
 
 		 405 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.699875  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1416  protein of unknown function DUF405  34.1 
 
 		 407 aa  164  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.548338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15990  predicted membrane protein  35.63 
 
 		 414 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.230384 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1415  protein of unknown function DUF405  34.46 
 
 		 399 aa  156  6e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.845184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1461  hypothetical protein  33.82 
 
 		 401 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3607  protein of unknown function DUF418  34.94 
 
 		 407 aa  154  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.526186  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3780  hypothetical protein  32.41 
 
 		 401 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0072  hypothetical protein  34.46 
 
 		 380 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484765  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0984  protein of unknown function DUF418  37.66 
 
 		 387 aa  146  8.000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0392587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0035  hypothetical protein  35.28 
 
 		 402 aa  143  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0505  protein of unknown function DUF418  33.51 
 
 		 407 aa  142  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000344824 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4293  protein of unknown function DUF418  33.33 
 
 		 390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4159  hypothetical protein  35.42 
 
 		 401 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.776458  decreased coverage  0.000152397 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07880  predicted membrane protein  30.2 
 
 		 407 aa  96.7  7e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4097  hypothetical protein  23.04 
 
 		 399 aa  79  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0455  hypothetical protein  26.81 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222068  hitchhiker  0.00425561 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3111  protein of unknown function DUF418  44.83 
 
 		 443 aa  74.3  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0683  protein of unknown function DUF405  25.55 
 
 		 387 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1396  hypothetical protein  23.51 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3571  protein of unknown function DUF418  27.32 
 
 		 405 aa  69.7  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.983337  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4423  hypothetical protein  26.76 
 
 		 417 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00407884  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1203  hypothetical protein  29.51 
 
 		 398 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3230  hypothetical protein  29.38 
 
 		 411 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3078  hypothetical protein  29.38 
 
 		 411 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1289  protein of unknown function DUF405  29.14 
 
 		 401 aa  67  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3087  hypothetical protein  29.14 
 
 		 411 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2115  protein of unknown function DUF418  24.24 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2882  hypothetical protein  30.95 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2290  protein of unknown function DUF405  26.18 
 
 		 391 aa  62  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.578329  normal  0.0235381 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2799  hypothetical protein  30.16 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3043  hypothetical protein  30.22 
 
 		 382 aa  62.4  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5273  hypothetical protein  24.93 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4804  transmembrane protein  25.54 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000142062  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0178  hypothetical protein  25.48 
 
 		 381 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2327  hypothetical protein  26.18 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0179  hypothetical protein  25.38 
 
 		 381 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000571802  hitchhiker  1.74871e-35 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0746  protein of unknown function DUF405  32 
 
 		 204 aa  58.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.685935 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0117  membrane protein  23.4 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000725343  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00200  predicted membrane protein  26.21 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.220914 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2978  hypothetical protein  29.29 
 
 		 414 aa  57  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30910  predicted membrane protein  27.04 
 
 		 392 aa  56.2  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2840  hypothetical protein  24.68 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.110654 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0015  hypothetical protein  27.82 
 
 		 381 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.428508  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1628  hypothetical protein  26.59 
 
 		 387 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000608067  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1661  transport protein  26.77 
 
 		 430 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.414626  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3067  hypothetical protein  25.21 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1608  hypothetical protein  27.27 
 
 		 430 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3566  protein of unknown function DUF418  30.08 
 
 		 459 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.726105 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1538  protein of unknown function DUF405  24.65 
 
 		 406 aa  51.2  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0285  protein of unknown function DUF418  23.63 
 
 		 409 aa  51.2  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1066  hypothetical protein  24.85 
 
 		 401 aa  50.1  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2066  protein of unknown function DUF418  24.21 
 
 		 404 aa  50.1  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0837783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2860  protein of unknown function DUF418  23.91 
 
 		 415 aa  50.1  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1561  hypothetical protein  25 
 
 		 393 aa  49.7  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0076  protein of unknown function DUF418  24.15 
 
 		 416 aa  47.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.477208  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2404  hypothetical protein  33.72 
 
 		 382 aa  47.8  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.334101  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3565  protein of unknown function DUF418  28.57 
 
 		 431 aa  47.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.708888  normal  0.443247 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1450  hypothetical protein  27.09 
 
 		 387 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000207641  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6573  hypothetical protein  31.5 
 
 		 315 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00469917  normal  0.0258575 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0252  protein of unknown function DUF405  27.73 
 
 		 410 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1199  hypothetical protein  20.39 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0031  protein of unknown function DUF405  39.02 
 
 		 352 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4874  protein of unknown function DUF418  32 
 
 		 456 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.93625 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0814  hypothetical protein  24.55 
 
 		 385 aa  44.7  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2201  hypothetical protein  27.97 
 
 		 416 aa  44.3  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.964455  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3286  hypothetical protein  24.09 
 
 		 385 aa  44.3  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.385085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1663  hypothetical protein  25.79 
 
 		 387 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1477  hypothetical protein  25.79 
 
 		 387 aa  43.9  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.117063  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1496  hypothetical protein  24.85 
 
 		 385 aa  43.9  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2447  hypothetical protein  24.12 
 
 		 385 aa  43.9  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1449  hypothetical protein  25.79 
 
 		 387 aa  43.9  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.831542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1593  hypothetical protein  25.79 
 
 		 387 aa  43.9  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1506  protein of unknown function DUF418  24.55 
 
 		 385 aa  43.5  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.253618  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1492  hypothetical protein  25.3 
 
 		 387 aa  43.5  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.512867  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02081  conserved inner membrane protein  24.55 
 
 		 385 aa  43.5  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.452541  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2752  hypothetical protein  21.96 
 
 		 385 aa  43.5  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.915358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2469  hypothetical protein  24.77 
 
 		 388 aa  43.5  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2305  hypothetical protein  32.89 
 
 		 391 aa  43.1  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1671  hypothetical protein  26.85 
 
 		 395 aa  43.1  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1818  hypothetical protein  27.34 
 
 		 415 aa  42.7  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.993356 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>