150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0455 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0455  hypothetical protein  100 
 
 		 415 aa  815    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222068  hitchhiker  0.00425561 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4423  hypothetical protein  77.8 
 
 		 417 aa  637    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00407884  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0683  protein of unknown function DUF405  34.49 
 
 		 387 aa  202  9e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0285  protein of unknown function DUF418  34.64 
 
 		 409 aa  201  3e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2860  protein of unknown function DUF418  34.13 
 
 		 415 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2115  protein of unknown function DUF418  33.41 
 
 		 412 aa  194  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2885  protein of unknown function DUF405  34.86 
 
 		 414 aa  192  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.802913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1608  hypothetical protein  36.74 
 
 		 430 aa  186  8e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1661  transport protein  36.01 
 
 		 430 aa  184  3e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.414626  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4881  hypothetical protein  31.88 
 
 		 390 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00420784  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1538  protein of unknown function DUF405  33.17 
 
 		 406 aa  171  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2201  hypothetical protein  34.8 
 
 		 416 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.964455  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0045  hypothetical protein  31.03 
 
 		 389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000457904  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1499  protein of unknown function DUF405  32.65 
 
 		 388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01909  transport protein  36.56 
 
 		 409 aa  163  7e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.694528  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1628  hypothetical protein  30.77 
 
 		 387 aa  162  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000608067  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3566  protein of unknown function DUF418  29.93 
 
 		 459 aa  160  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.726105 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0076  protein of unknown function DUF418  33.58 
 
 		 416 aa  159  6e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.477208  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2840  hypothetical protein  34.25 
 
 		 414 aa  156  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.110654 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0190  hypothetical protein  34.96 
 
 		 428 aa  155  9e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.55784  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0733  protein of unknown function DUF405  31.91 
 
 		 398 aa  155  1e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0666  protein of unknown function DUF405  30.3 
 
 		 362 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000167692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1739  hypothetical protein  31.78 
 
 		 387 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00248027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1450  hypothetical protein  33.42 
 
 		 387 aa  154  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000207641  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1492  hypothetical protein  32.46 
 
 		 387 aa  153  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.512867  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1699  hypothetical protein  31.78 
 
 		 387 aa  151  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0252  protein of unknown function DUF405  35.14 
 
 		 410 aa  150  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1449  hypothetical protein  31.55 
 
 		 387 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.831542  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2355  protein of unknown function DUF405  34.22 
 
 		 364 aa  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1663  hypothetical protein  31.55 
 
 		 387 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3571  protein of unknown function DUF418  33.17 
 
 		 405 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.983337  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0820  hypothetical protein  34.83 
 
 		 365 aa  147  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1477  hypothetical protein  31.31 
 
 		 387 aa  147  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.117063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1593  hypothetical protein  31.31 
 
 		 387 aa  147  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3717  hypothetical protein  30.34 
 
 		 387 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0117  membrane protein  29.01 
 
 		 381 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000725343  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0179  hypothetical protein  29.97 
 
 		 381 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000571802  hitchhiker  1.74871e-35 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30910  predicted membrane protein  32.06 
 
 		 392 aa  144  4e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0015  hypothetical protein  28.36 
 
 		 381 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.428508  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0775  hypothetical protein  32.12 
 
 		 401 aa  140  4.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0095945  normal  0.285929 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0371  hypothetical protein  33.17 
 
 		 397 aa  138  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3565  protein of unknown function DUF418  29.66 
 
 		 431 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.708888  normal  0.443247 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1671  hypothetical protein  31.58 
 
 		 395 aa  134  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0178  hypothetical protein  28.97 
 
 		 381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2290  protein of unknown function DUF405  32.26 
 
 		 391 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.578329  normal  0.0235381 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1942  hypothetical protein  30.5 
 
 		 391 aa  130  6e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.235403  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4786  hypothetical protein  29.47 
 
 		 406 aa  129  8.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1304  hypothetical protein  31.5 
 
 		 388 aa  125  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2305  hypothetical protein  31.53 
 
 		 391 aa  125  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1066  hypothetical protein  31.4 
 
 		 401 aa  124  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2752  hypothetical protein  30.33 
 
 		 385 aa  122  8e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.915358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1199  hypothetical protein  27.7 
 
 		 398 aa  122  9e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1561  hypothetical protein  30.83 
 
 		 393 aa  122  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5203  conserved membrane spanning protein  30.79 
 
 		 347 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1818  hypothetical protein  30.1 
 
 		 415 aa  120  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.71 
 
 		 410 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.037271 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00200  predicted membrane protein  28.74 
 
 		 397 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.220914 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1198  hypothetical protein  26.13 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0746  protein of unknown function DUF405  40.91 
 
 		 204 aa  114  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.685935 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4921  hypothetical protein  29.03 
 
 		 265 aa  110  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0008351  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4858  hypothetical protein  24.3 
 
 		 340 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3078  hypothetical protein  27.66 
 
 		 411 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3087  hypothetical protein  27.23 
 
 		 411 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3230  hypothetical protein  27.66 
 
 		 411 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1171  protein of unknown function DUF418  27.43 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1289  protein of unknown function DUF405  27.23 
 
 		 401 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4860  hypothetical protein  29.17 
 
 		 387 aa  107  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2404  hypothetical protein  29.72 
 
 		 382 aa  106  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.334101  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4916  protein of unknown function DUF418  30.31 
 
 		 401 aa  106  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.511749  normal  0.649012 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3111  protein of unknown function DUF418  29.71 
 
 		 443 aa  103  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414343  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4479  membrane spanning protein  25.13 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4804  transmembrane protein  25.19 
 
 		 312 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000142062  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2066  protein of unknown function DUF418  28.37 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0837783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1203  hypothetical protein  27.27 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1670  hypothetical protein  28.7 
 
 		 405 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.704713  normal  0.19338 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5273  hypothetical protein  25.51 
 
 		 312 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4097  hypothetical protein  25.87 
 
 		 399 aa  98.2  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15990  predicted membrane protein  28.15 
 
 		 414 aa  97.1  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.230384 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1736  protein of unknown function DUF405  30.66 
 
 		 410 aa  96.3  8e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.310002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1461  hypothetical protein  28.92 
 
 		 401 aa  96.3  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1668  protein of unknown function DUF418  29.68 
 
 		 420 aa  95.1  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0622  hypothetical protein  27.45 
 
 		 439 aa  94.7  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1119  protein of unknown function DUF405  29.04 
 
 		 381 aa  94.7  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2327  hypothetical protein  34.58 
 
 		 388 aa  92.4  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1396  hypothetical protein  25.77 
 
 		 399 aa  92  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8135  hypothetical protein  27.86 
 
 		 397 aa  90.1  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026592  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2882  hypothetical protein  26.49 
 
 		 414 aa  86.3  9e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2152  hypothetical protein  27.23 
 
 		 393 aa  84.7  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.391046 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4741  hypothetical protein  29.7 
 
 		 392 aa  84  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.400946  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2978  hypothetical protein  26.37 
 
 		 414 aa  84  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2581  hypothetical protein  27.34 
 
 		 388 aa  83.6  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.365833  normal  0.0605789 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1646  protein of unknown function DUF405  28.88 
 
 		 394 aa  83.6  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3067  hypothetical protein  30.91 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2799  hypothetical protein  26.11 
 
 		 414 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25000  predicted membrane protein  27.49 
 
 		 387 aa  82.4  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0691  hypothetical protein  26.33 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0505  protein of unknown function DUF418  26.16 
 
 		 407 aa  81.3  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000344824 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3043  hypothetical protein  28.19 
 
 		 382 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3286  hypothetical protein  37.59 
 
 		 385 aa  80.1  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.385085  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1416  protein of unknown function DUF405  28.33 
 
 		 407 aa  80.5  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.548338  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>