111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1646 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1646  protein of unknown function DUF405  100 
 
 
394 aa  749    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1119  protein of unknown function DUF405  52.28 
 
 
381 aa  339  4e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00200  predicted membrane protein  45.74 
 
 
397 aa  283  3.0000000000000004e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.220914 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1066  hypothetical protein  47.01 
 
 
401 aa  272  1e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25000  predicted membrane protein  45.98 
 
 
387 aa  268  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1888  hypothetical protein  49.07 
 
 
389 aa  267  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4916  protein of unknown function DUF418  47.12 
 
 
401 aa  263  4e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.511749  normal  0.649012 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25010  predicted membrane protein  47.28 
 
 
417 aa  256  5e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24980  predicted membrane protein  46.34 
 
 
412 aa  241  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.740551  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1675  protein of unknown function DUF405  45.36 
 
 
375 aa  230  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.965008  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14550  predicted membrane protein  41.54 
 
 
384 aa  230  3e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127501  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2860  protein of unknown function DUF418  31.83 
 
 
415 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2885  protein of unknown function DUF405  32.07 
 
 
414 aa  119  9e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.802913  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1671  hypothetical protein  30.36 
 
 
395 aa  107  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4423  hypothetical protein  31.34 
 
 
417 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00407884  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1661  transport protein  27.71 
 
 
430 aa  102  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.414626  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0455  hypothetical protein  30.5 
 
 
415 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222068  hitchhiker  0.00425561 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1608  hypothetical protein  27.64 
 
 
430 aa  99.4  9e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1538  protein of unknown function DUF405  31.07 
 
 
406 aa  99  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1942  hypothetical protein  30.26 
 
 
391 aa  98.6  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.235403  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1561  hypothetical protein  31.54 
 
 
393 aa  97.8  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0076  protein of unknown function DUF418  31.71 
 
 
416 aa  97.8  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.477208  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2115  protein of unknown function DUF418  25.18 
 
 
412 aa  93.2  8e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0045  hypothetical protein  22.54 
 
 
389 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000457904  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2305  hypothetical protein  30.22 
 
 
391 aa  91.3  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4881  hypothetical protein  22.57 
 
 
390 aa  90.9  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00420784  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0683  protein of unknown function DUF405  24.34 
 
 
387 aa  90.9  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2752  hypothetical protein  29.34 
 
 
385 aa  90.1  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.915358  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0820  hypothetical protein  30.34 
 
 
365 aa  90.5  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0733  protein of unknown function DUF405  30.28 
 
 
398 aa  88.2  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0285  protein of unknown function DUF418  23.31 
 
 
409 aa  82.4  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2290  protein of unknown function DUF405  29.08 
 
 
391 aa  82.4  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.578329  normal  0.0235381 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2201  hypothetical protein  28.47 
 
 
416 aa  80.5  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.964455  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4860  hypothetical protein  32.2 
 
 
387 aa  79.7  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138362  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2567  hypothetical protein  31.62 
 
 
388 aa  79.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0666  protein of unknown function DUF405  24.68 
 
 
362 aa  79  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000167692  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3571  protein of unknown function DUF418  29.53 
 
 
405 aa  79.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.983337  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2469  hypothetical protein  32.05 
 
 
388 aa  77.4  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4097  hypothetical protein  23.99 
 
 
399 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2299  hypothetical protein  30.81 
 
 
385 aa  76.3  0.0000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383736 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02081  conserved inner membrane protein  29.87 
 
 
385 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.452541  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2447  hypothetical protein  30.2 
 
 
385 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3286  hypothetical protein  30.2 
 
 
385 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.385085  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30910  predicted membrane protein  31.09 
 
 
392 aa  75.9  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1499  protein of unknown function DUF405  27.34 
 
 
388 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1506  protein of unknown function DUF418  30.2 
 
 
385 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.253618  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0814  hypothetical protein  30.2 
 
 
385 aa  75.1  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3015  hypothetical protein  31.79 
 
 
388 aa  74.3  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00833892 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2355  protein of unknown function DUF405  30.1 
 
 
364 aa  74.3  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1203  hypothetical protein  26.14 
 
 
398 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1199  hypothetical protein  21.81 
 
 
398 aa  73.2  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3566  protein of unknown function DUF418  26.61 
 
 
459 aa  73.2  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.726105 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0691  hypothetical protein  28.14 
 
 
381 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0190  hypothetical protein  29.56 
 
 
428 aa  72.4  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.55784  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2066  protein of unknown function DUF418  26.19 
 
 
404 aa  72.8  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0837783  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4786  hypothetical protein  28.78 
 
 
406 aa  71.6  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6743  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.3 
 
 
410 aa  71.2  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.037271 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1198  hypothetical protein  23.53 
 
 
399 aa  71.2  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3230  hypothetical protein  25.38 
 
 
411 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2404  hypothetical protein  29.46 
 
 
382 aa  70.5  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.334101  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0015  hypothetical protein  21.17 
 
 
381 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.428508  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3067  hypothetical protein  30.42 
 
 
404 aa  69.7  0.00000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3087  hypothetical protein  25.13 
 
 
411 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1289  protein of unknown function DUF405  25.13 
 
 
401 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15990  predicted membrane protein  28.25 
 
 
414 aa  69.3  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.230384 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1396  hypothetical protein  26.28 
 
 
399 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3078  hypothetical protein  25.06 
 
 
411 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0117  membrane protein  20.92 
 
 
381 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000725343  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3043  hypothetical protein  24.23 
 
 
382 aa  65.1  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3565  protein of unknown function DUF418  25.75 
 
 
431 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.708888  normal  0.443247 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0179  hypothetical protein  23.51 
 
 
381 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000571802  hitchhiker  1.74871e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1477  hypothetical protein  23.45 
 
 
387 aa  63.2  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.117063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1593  hypothetical protein  23.45 
 
 
387 aa  63.2  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5273  hypothetical protein  21.04 
 
 
312 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1449  hypothetical protein  23.51 
 
 
387 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.831542  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2799  hypothetical protein  25.31 
 
 
414 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1663  hypothetical protein  23.51 
 
 
387 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0252  protein of unknown function DUF405  30.51 
 
 
410 aa  60.8  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4921  hypothetical protein  21.34 
 
 
265 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0008351  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4804  transmembrane protein  21.23 
 
 
312 aa  60.5  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000142062  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1492  hypothetical protein  22.45 
 
 
387 aa  60.1  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.512867  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2882  hypothetical protein  25.31 
 
 
414 aa  59.7  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3717  hypothetical protein  23.62 
 
 
387 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1739  hypothetical protein  23.1 
 
 
387 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00248027  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2840  hypothetical protein  28 
 
 
414 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.110654 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1736  protein of unknown function DUF405  39.24 
 
 
410 aa  59.3  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.310002  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1628  hypothetical protein  23.1 
 
 
387 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000608067  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0178  hypothetical protein  21.41 
 
 
381 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1450  hypothetical protein  22.22 
 
 
387 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000207641  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1699  hypothetical protein  22.8 
 
 
387 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0775  hypothetical protein  23.02 
 
 
401 aa  55.1  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0095945  normal  0.285929 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1171  protein of unknown function DUF418  25.5 
 
 
394 aa  53.5  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2978  hypothetical protein  24.27 
 
 
414 aa  53.1  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1818  hypothetical protein  36.99 
 
 
415 aa  50.4  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0622  hypothetical protein  25.84 
 
 
439 aa  50.4  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01909  transport protein  36.89 
 
 
409 aa  50.4  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.694528  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0746  protein of unknown function DUF405  27.97 
 
 
204 aa  49.3  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.685935 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2383  hypothetical protein  36.79 
 
 
380 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.76362 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2427  hypothetical protein  36.79 
 
 
380 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.901091 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2431  hypothetical protein  36.79 
 
 
380 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.503306  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>