97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2581 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2581  hypothetical protein  100 
 
 
388 aa  750    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.365833  normal  0.0605789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0072  hypothetical protein  55.17 
 
 
380 aa  353  2.9999999999999997e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484765  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0719  protein of unknown function DUF418  49.87 
 
 
405 aa  300  2e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.699875  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8135  hypothetical protein  45.97 
 
 
397 aa  278  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026592  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1668  protein of unknown function DUF418  44.64 
 
 
420 aa  251  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620816  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4741  hypothetical protein  41.33 
 
 
392 aa  244  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.400946  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3529  protein of unknown function DUF418  40.99 
 
 
398 aa  236  4e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.296308  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0035  hypothetical protein  41.93 
 
 
402 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0622  hypothetical protein  43.88 
 
 
439 aa  224  3e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1416  protein of unknown function DUF405  40.72 
 
 
407 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.548338  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4293  protein of unknown function DUF418  42.82 
 
 
390 aa  220  3e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1063  protein of unknown function DUF405  41.75 
 
 
472 aa  219  6e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2152  hypothetical protein  39.29 
 
 
393 aa  217  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.391046 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3607  protein of unknown function DUF418  42.51 
 
 
407 aa  217  2.9999999999999998e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.526186  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3111  protein of unknown function DUF418  44.74 
 
 
443 aa  212  7.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414343  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1670  hypothetical protein  39.59 
 
 
405 aa  203  5e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.704713  normal  0.19338 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1461  hypothetical protein  40 
 
 
401 aa  202  8e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1415  protein of unknown function DUF405  40.21 
 
 
399 aa  197  3e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.845184  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1236  hypothetical protein  38.29 
 
 
399 aa  196  5.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0984  protein of unknown function DUF418  40.99 
 
 
387 aa  193  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0392587  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0505  protein of unknown function DUF418  40.39 
 
 
407 aa  192  7e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000344824 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3780  hypothetical protein  38.67 
 
 
401 aa  189  5e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24880  predicted membrane protein  38.48 
 
 
432 aa  187  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0615892  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15990  predicted membrane protein  40.25 
 
 
414 aa  184  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.230384 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1078  protein of unknown function DUF418  39.2 
 
 
384 aa  176  5e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4159  hypothetical protein  38.34 
 
 
401 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.776458  decreased coverage  0.000152397 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07880  predicted membrane protein  37.08 
 
 
407 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2290  protein of unknown function DUF405  29.75 
 
 
391 aa  88.2  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.578329  normal  0.0235381 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2327  hypothetical protein  32.15 
 
 
388 aa  88.2  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1661  transport protein  27.53 
 
 
430 aa  84  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.414626  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3087  hypothetical protein  26.05 
 
 
411 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1203  hypothetical protein  26.37 
 
 
398 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1608  hypothetical protein  27.29 
 
 
430 aa  81.6  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3230  hypothetical protein  25.81 
 
 
411 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1396  hypothetical protein  26.62 
 
 
399 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3571  protein of unknown function DUF418  30.06 
 
 
405 aa  80.5  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.983337  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4423  hypothetical protein  27.32 
 
 
417 aa  80.5  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00407884  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1289  protein of unknown function DUF405  25.81 
 
 
401 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0455  hypothetical protein  27.34 
 
 
415 aa  80.1  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222068  hitchhiker  0.00425561 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3078  hypothetical protein  25.56 
 
 
411 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2799  hypothetical protein  27.89 
 
 
414 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4097  hypothetical protein  25.92 
 
 
399 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2066  protein of unknown function DUF418  24.21 
 
 
404 aa  78.2  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0837783  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4804  transmembrane protein  25 
 
 
312 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000142062  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5273  hypothetical protein  25 
 
 
312 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1538  protein of unknown function DUF405  29.24 
 
 
406 aa  75.5  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2885  protein of unknown function DUF405  28.26 
 
 
414 aa  75.1  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.802913  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2882  hypothetical protein  27.86 
 
 
414 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0683  protein of unknown function DUF405  24.19 
 
 
387 aa  70.1  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0285  protein of unknown function DUF418  23.49 
 
 
409 aa  68.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0820  hypothetical protein  29.23 
 
 
365 aa  67.8  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2978  hypothetical protein  26.89 
 
 
414 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2840  hypothetical protein  27.35 
 
 
414 aa  67.8  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.110654 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30910  predicted membrane protein  28.45 
 
 
392 aa  67.4  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2860  protein of unknown function DUF418  27.95 
 
 
415 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0076  protein of unknown function DUF418  33.56 
 
 
416 aa  65.1  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.477208  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2115  protein of unknown function DUF418  23.42 
 
 
412 aa  62.4  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3043  hypothetical protein  23.01 
 
 
382 aa  61.6  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0190  hypothetical protein  31.28 
 
 
428 aa  60.5  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.55784  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00200  predicted membrane protein  26.59 
 
 
397 aa  60.5  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.220914 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01909  transport protein  28.68 
 
 
409 aa  59.7  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.694528  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3566  protein of unknown function DUF418  30.69 
 
 
459 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.726105 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1561  hypothetical protein  27.09 
 
 
393 aa  58.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2355  protein of unknown function DUF405  27.96 
 
 
364 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2752  hypothetical protein  25.92 
 
 
385 aa  57  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.915358  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2447  hypothetical protein  26.59 
 
 
385 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1496  hypothetical protein  26.76 
 
 
385 aa  56.6  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3565  protein of unknown function DUF418  24.51 
 
 
431 aa  56.2  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.708888  normal  0.443247 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3286  hypothetical protein  26.03 
 
 
385 aa  56.2  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.385085  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02081  conserved inner membrane protein  26.59 
 
 
385 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.452541  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2286  hypothetical protein  26.52 
 
 
385 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0814  hypothetical protein  26.59 
 
 
385 aa  55.5  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2299  hypothetical protein  26.59 
 
 
385 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383736 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0117  membrane protein  20.11 
 
 
381 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000725343  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2201  hypothetical protein  24.6 
 
 
416 aa  54.7  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.964455  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1199  hypothetical protein  21.89 
 
 
398 aa  54.3  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1506  protein of unknown function DUF418  26.34 
 
 
385 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.253618  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1499  protein of unknown function DUF405  25.66 
 
 
388 aa  53.5  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0666  protein of unknown function DUF405  22.39 
 
 
362 aa  53.1  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000167692  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2305  hypothetical protein  26.88 
 
 
391 aa  53.1  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1066  hypothetical protein  28.06 
 
 
401 aa  52.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1198  hypothetical protein  21.17 
 
 
399 aa  52.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0733  protein of unknown function DUF405  39.29 
 
 
398 aa  52.4  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.1 
 
 
410 aa  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.037271 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2404  hypothetical protein  41.03 
 
 
382 aa  51.6  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.334101  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0015  hypothetical protein  19.66 
 
 
381 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.428508  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1671  hypothetical protein  25.12 
 
 
395 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0045  hypothetical protein  22.77 
 
 
389 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000457904  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4881  hypothetical protein  21.99 
 
 
390 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00420784  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0179  hypothetical protein  19.83 
 
 
381 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000571802  hitchhiker  1.74871e-35 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0775  hypothetical protein  25.8 
 
 
401 aa  47.4  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0095945  normal  0.285929 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0746  protein of unknown function DUF405  26.95 
 
 
204 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.685935 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1739  hypothetical protein  22.38 
 
 
387 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00248027  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0178  hypothetical protein  20.96 
 
 
381 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0017  hypothetical protein  24.15 
 
 
374 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1942  hypothetical protein  23.85 
 
 
391 aa  43.9  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.235403  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0252  protein of unknown function DUF405  28.36 
 
 
410 aa  43.5  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.680617 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>