145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_30910 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_30910  predicted membrane protein  100 
 
 
392 aa  763    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0252  protein of unknown function DUF405  51.43 
 
 
410 aa  266  5e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3571  protein of unknown function DUF418  44.68 
 
 
405 aa  250  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.983337  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2840  hypothetical protein  42.09 
 
 
414 aa  240  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.110654 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4423  hypothetical protein  34.24 
 
 
417 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00407884  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0455  hypothetical protein  31.82 
 
 
415 aa  152  8.999999999999999e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222068  hitchhiker  0.00425561 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1608  hypothetical protein  31.9 
 
 
430 aa  150  3e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1661  transport protein  31.65 
 
 
430 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.414626  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4881  hypothetical protein  29.8 
 
 
390 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00420784  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2115  protein of unknown function DUF418  29.31 
 
 
412 aa  142  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0045  hypothetical protein  29.55 
 
 
389 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000457904  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0285  protein of unknown function DUF418  29.32 
 
 
409 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2885  protein of unknown function DUF405  34.26 
 
 
414 aa  129  9.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.802913  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.93 
 
 
410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.037271 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1628  hypothetical protein  27.13 
 
 
387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000608067  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1449  hypothetical protein  27.53 
 
 
387 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.831542  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1663  hypothetical protein  27.53 
 
 
387 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1699  hypothetical protein  27.11 
 
 
387 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1477  hypothetical protein  27.42 
 
 
387 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.117063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1593  hypothetical protein  27.42 
 
 
387 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1739  hypothetical protein  26.65 
 
 
387 aa  123  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00248027  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3717  hypothetical protein  26.96 
 
 
387 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1492  hypothetical protein  27.01 
 
 
387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.512867  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0015  hypothetical protein  25.96 
 
 
381 aa  120  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.428508  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1450  hypothetical protein  26.46 
 
 
387 aa  119  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000207641  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0117  membrane protein  26.14 
 
 
381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000725343  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01909  transport protein  33.02 
 
 
409 aa  113  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.694528  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0683  protein of unknown function DUF405  27.53 
 
 
387 aa  113  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0178  hypothetical protein  24.94 
 
 
381 aa  112  9e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4860  hypothetical protein  31.91 
 
 
387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138362  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2066  protein of unknown function DUF418  28.07 
 
 
404 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0837783  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1171  protein of unknown function DUF418  27.91 
 
 
394 aa  112  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1499  protein of unknown function DUF405  30.63 
 
 
388 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0179  hypothetical protein  25.13 
 
 
381 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000571802  hitchhiker  1.74871e-35 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1888  hypothetical protein  32.19 
 
 
389 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5273  hypothetical protein  25 
 
 
312 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2355  protein of unknown function DUF405  32.63 
 
 
364 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4804  transmembrane protein  24.67 
 
 
312 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000142062  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00200  predicted membrane protein  27.93 
 
 
397 aa  103  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.220914 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2860  protein of unknown function DUF418  28.43 
 
 
415 aa  101  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4786  hypothetical protein  30.15 
 
 
406 aa  101  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6743  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1304  hypothetical protein  26.1 
 
 
388 aa  100  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2290  protein of unknown function DUF405  30.99 
 
 
391 aa  99.8  8e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.578329  normal  0.0235381 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2201  hypothetical protein  28.85 
 
 
416 aa  99  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.964455  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0775  hypothetical protein  31.12 
 
 
401 aa  98.2  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0095945  normal  0.285929 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0666  protein of unknown function DUF405  24.93 
 
 
362 aa  97.1  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000167692  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0622  hypothetical protein  29.78 
 
 
439 aa  96.7  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0190  hypothetical protein  27.87 
 
 
428 aa  95.9  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.55784  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1818  hypothetical protein  27.18 
 
 
415 aa  95.5  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0820  hypothetical protein  32.16 
 
 
365 aa  93.6  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0076  protein of unknown function DUF418  28.68 
 
 
416 aa  93.6  6e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.477208  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1538  protein of unknown function DUF405  31.13 
 
 
406 aa  91.7  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3067  hypothetical protein  30.35 
 
 
404 aa  89.7  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1199  hypothetical protein  24.48 
 
 
398 aa  89  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4921  hypothetical protein  28.43 
 
 
265 aa  87.4  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0008351  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1066  hypothetical protein  30.31 
 
 
401 aa  86.7  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1668  protein of unknown function DUF418  30.32 
 
 
420 aa  85.9  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620816  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1198  hypothetical protein  25.26 
 
 
399 aa  85.9  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4889  hypothetical protein  25 
 
 
340 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4741  hypothetical protein  28.2 
 
 
392 aa  82.4  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.400946  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1063  protein of unknown function DUF405  30.05 
 
 
472 aa  82  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0371  hypothetical protein  28.75 
 
 
397 aa  81.6  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1736  protein of unknown function DUF405  32.04 
 
 
410 aa  82  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.310002  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4916  protein of unknown function DUF418  29.35 
 
 
401 aa  82  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.511749  normal  0.649012 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1671  hypothetical protein  29.2 
 
 
395 aa  80.9  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3566  protein of unknown function DUF418  25.62 
 
 
459 aa  80.5  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.726105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1461  hypothetical protein  28.1 
 
 
401 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8135  hypothetical protein  28.54 
 
 
397 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026592  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3529  protein of unknown function DUF418  28.98 
 
 
398 aa  78.2  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.296308  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2581  hypothetical protein  28.09 
 
 
388 aa  77  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.365833  normal  0.0605789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8802  hypothetical protein  30.95 
 
 
362 aa  76.3  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1289  protein of unknown function DUF405  25.27 
 
 
401 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3078  hypothetical protein  25.07 
 
 
411 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3087  hypothetical protein  24.93 
 
 
411 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3230  hypothetical protein  25.27 
 
 
411 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3111  protein of unknown function DUF418  31.74 
 
 
443 aa  75.5  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414343  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15990  predicted membrane protein  31.39 
 
 
414 aa  75.1  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.230384 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0691  hypothetical protein  27.09 
 
 
381 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0719  protein of unknown function DUF418  32.52 
 
 
405 aa  73.6  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.699875  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1078  protein of unknown function DUF418  29.77 
 
 
384 aa  73.2  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1119  protein of unknown function DUF405  29.02 
 
 
381 aa  72.4  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2799  hypothetical protein  24.72 
 
 
414 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1416  protein of unknown function DUF405  29.57 
 
 
407 aa  72  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.548338  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1646  protein of unknown function DUF405  30.69 
 
 
394 aa  71.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1396  hypothetical protein  25.84 
 
 
399 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2327  hypothetical protein  29.56 
 
 
388 aa  70.1  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0609  hypothetical protein  36.81 
 
 
787 aa  69.7  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2882  hypothetical protein  27.22 
 
 
414 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2978  hypothetical protein  25.29 
 
 
414 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1203  hypothetical protein  23.44 
 
 
398 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1942  hypothetical protein  26.97 
 
 
391 aa  69.3  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.235403  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4293  protein of unknown function DUF418  26.85 
 
 
390 aa  68.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2152  hypothetical protein  27.01 
 
 
393 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.391046 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2305  hypothetical protein  26.74 
 
 
391 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0031  protein of unknown function DUF405  27.98 
 
 
352 aa  67  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2752  hypothetical protein  25.64 
 
 
385 aa  66.6  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.915358  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0746  protein of unknown function DUF405  29.75 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.685935 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25000  predicted membrane protein  29.9 
 
 
387 aa  65.9  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1670  hypothetical protein  29.37 
 
 
405 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.704713  normal  0.19338 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3043  hypothetical protein  23.31 
 
 
382 aa  65.1  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>