128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1066 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1066  hypothetical protein  100 
 
 		 401 aa  777    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4916  protein of unknown function DUF418  59.16 
 
 		 401 aa  431  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.511749  normal  0.649012 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00200  predicted membrane protein  47.38 
 
 		 397 aa  309  5.9999999999999995e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.220914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1888  hypothetical protein  45.82 
 
 		 389 aa  276  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1675  protein of unknown function DUF405  44.69 
 
 		 375 aa  234  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.965008  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1119  protein of unknown function DUF405  41.42 
 
 		 381 aa  234  3e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1646  protein of unknown function DUF405  47.2 
 
 		 394 aa  230  4e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25000  predicted membrane protein  36.6 
 
 		 387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14550  predicted membrane protein  35.5 
 
 		 384 aa  155  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24980  predicted membrane protein  37.63 
 
 		 412 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.740551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25010  predicted membrane protein  35.47 
 
 		 417 aa  151  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0455  hypothetical protein  31.34 
 
 		 415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222068  hitchhiker  0.00425561 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1608  hypothetical protein  29.7 
 
 		 430 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1661  transport protein  30.18 
 
 		 430 aa  116  6e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.414626  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4423  hypothetical protein  30.28 
 
 		 417 aa  116  8.999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00407884  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2305  hypothetical protein  30.17 
 
 		 391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2115  protein of unknown function DUF418  28.47 
 
 		 412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0190  hypothetical protein  31.36 
 
 		 428 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.55784  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1538  protein of unknown function DUF405  29.56 
 
 		 406 aa  112  9e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2860  protein of unknown function DUF418  29.59 
 
 		 415 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2885  protein of unknown function DUF405  30.02 
 
 		 414 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.802913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1671  hypothetical protein  27.16 
 
 		 395 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2201  hypothetical protein  28.33 
 
 		 416 aa  106  7e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.964455  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0285  protein of unknown function DUF418  27.12 
 
 		 409 aa  106  7e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1942  hypothetical protein  28.18 
 
 		 391 aa  106  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.235403  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2752  hypothetical protein  26.91 
 
 		 385 aa  103  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.915358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0733  protein of unknown function DUF405  30.15 
 
 		 398 aa  100  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0775  hypothetical protein  27.11 
 
 		 401 aa  97.8  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0095945  normal  0.285929 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1561  hypothetical protein  30.32 
 
 		 393 aa  95.5  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2299  hypothetical protein  27.64 
 
 		 385 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383736 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0814  hypothetical protein  27.53 
 
 		 385 aa  92  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3286  hypothetical protein  28.13 
 
 		 385 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.385085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2447  hypothetical protein  27.53 
 
 		 385 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1506  protein of unknown function DUF418  27.88 
 
 		 385 aa  89.7  8e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.253618  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1198  hypothetical protein  24.01 
 
 		 399 aa  89.4  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02081  conserved inner membrane protein  27.62 
 
 		 385 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.452541  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2286  hypothetical protein  27.88 
 
 		 385 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2383  hypothetical protein  27 
 
 		 380 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.76362 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2427  hypothetical protein  27 
 
 		 380 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.901091 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4097  hypothetical protein  26.05 
 
 		 399 aa  87.4  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2431  hypothetical protein  27 
 
 		 380 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.503306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2338  hypothetical protein  27 
 
 		 380 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.890901  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1496  hypothetical protein  27.88 
 
 		 385 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4881  hypothetical protein  22.83 
 
 		 390 aa  86.7  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00420784  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1396  hypothetical protein  27.08 
 
 		 399 aa  86.3  9e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1199  hypothetical protein  24.29 
 
 		 398 aa  85.9  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0820  hypothetical protein  31.25 
 
 		 365 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01909  transport protein  29.95 
 
 		 409 aa  84.3  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.694528  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2066  protein of unknown function DUF418  29.06 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0837783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2541  hypothetical protein  27 
 
 		 380 aa  83.2  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0379465  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2355  protein of unknown function DUF405  30.38 
 
 		 364 aa  82.8  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0076  protein of unknown function DUF418  26.63 
 
 		 416 aa  81.6  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.477208  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0045  hypothetical protein  22.57 
 
 		 389 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000457904  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2404  hypothetical protein  29.02 
 
 		 382 aa  81.6  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.334101  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3078  hypothetical protein  22.08 
 
 		 411 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3566  protein of unknown function DUF418  25.59 
 
 		 459 aa  81.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.726105 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2290  protein of unknown function DUF405  27.11 
 
 		 391 aa  80.9  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.578329  normal  0.0235381 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3571  protein of unknown function DUF418  28.5 
 
 		 405 aa  80.1  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.983337  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3230  hypothetical protein  23.02 
 
 		 411 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3087  hypothetical protein  23.02 
 
 		 411 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3043  hypothetical protein  24.7 
 
 		 382 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1203  hypothetical protein  25.31 
 
 		 398 aa  77  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0015  hypothetical protein  21.89 
 
 		 381 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.428508  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0683  protein of unknown function DUF405  24.81 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1289  protein of unknown function DUF405  22.49 
 
 		 401 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2840  hypothetical protein  28.89 
 
 		 414 aa  74.7  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.110654 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0666  protein of unknown function DUF405  23.56 
 
 		 362 aa  74.7  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000167692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2799  hypothetical protein  26.45 
 
 		 414 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2882  hypothetical protein  26.2 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1668  protein of unknown function DUF418  28.23 
 
 		 420 aa  71.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2567  hypothetical protein  27.76 
 
 		 388 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0117  membrane protein  23.51 
 
 		 381 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000725343  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0622  hypothetical protein  28.32 
 
 		 439 aa  70.9  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2469  hypothetical protein  27.76 
 
 		 388 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3015  hypothetical protein  27.79 
 
 		 388 aa  70.9  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00833892 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30910  predicted membrane protein  30.31 
 
 		 392 aa  70.9  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0179  hypothetical protein  23.23 
 
 		 381 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000571802  hitchhiker  1.74871e-35 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1499  protein of unknown function DUF405  26.99 
 
 		 388 aa  69.7  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8135  hypothetical protein  28.16 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026592  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.08 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.037271 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4804  transmembrane protein  23.45 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000142062  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2978  hypothetical protein  23.64 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3067  hypothetical protein  29.28 
 
 		 404 aa  66.6  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0691  hypothetical protein  28.53 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1699  hypothetical protein  23.48 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3565  protein of unknown function DUF418  23.26 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.708888  normal  0.443247 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1450  hypothetical protein  25.13 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000207641  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2327  hypothetical protein  30.02 
 
 		 388 aa  65.1  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1492  hypothetical protein  24.8 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.512867  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1628  hypothetical protein  24.1 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000608067  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15990  predicted membrane protein  26.82 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.230384 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0178  hypothetical protein  21.46 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0252  protein of unknown function DUF405  28.24 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4786  hypothetical protein  27.38 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3717  hypothetical protein  22.92 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1670  hypothetical protein  26.47 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.704713  normal  0.19338 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1739  hypothetical protein  23.62 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00248027  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0746  protein of unknown function DUF405  32.65 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.685935 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1477  hypothetical protein  24.74 
 
 		 387 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.117063  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5273  hypothetical protein  23.34 
 
 		 312 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>