133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4860 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4860  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  752    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3565  protein of unknown function DUF418  30.79 
 
 		 431 aa  155  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.708888  normal  0.443247 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1538  protein of unknown function DUF405  30.52 
 
 		 406 aa  149  8e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0775  hypothetical protein  31.73 
 
 		 401 aa  144  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0095945  normal  0.285929 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3566  protein of unknown function DUF418  30.84 
 
 		 459 aa  139  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.726105 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2860  protein of unknown function DUF418  29.37 
 
 		 415 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3078  hypothetical protein  29.56 
 
 		 411 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4423  hypothetical protein  30.62 
 
 		 417 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00407884  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3230  hypothetical protein  29.56 
 
 		 411 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3087  hypothetical protein  29.31 
 
 		 411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0045  hypothetical protein  28.57 
 
 		 389 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000457904  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0733  protein of unknown function DUF405  32.24 
 
 		 398 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0076  protein of unknown function DUF418  30.38 
 
 		 416 aa  126  5e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.477208  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1289  protein of unknown function DUF405  29.05 
 
 		 401 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2201  hypothetical protein  32.75 
 
 		 416 aa  124  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.964455  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4881  hypothetical protein  27.82 
 
 		 390 aa  123  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00420784  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1499  protein of unknown function DUF405  28.94 
 
 		 388 aa  123  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4786  hypothetical protein  30.28 
 
 		 406 aa  119  7.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1203  hypothetical protein  27.85 
 
 		 398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2882  hypothetical protein  30.73 
 
 		 414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0455  hypothetical protein  28.43 
 
 		 415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222068  hitchhiker  0.00425561 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1661  transport protein  30.42 
 
 		 430 aa  113  5e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.414626  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0190  hypothetical protein  29.4 
 
 		 428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.55784  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1671  hypothetical protein  32.14 
 
 		 395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1608  hypothetical protein  30.07 
 
 		 430 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4097  hypothetical protein  26.87 
 
 		 399 aa  110  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2290  protein of unknown function DUF405  31.44 
 
 		 391 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.578329  normal  0.0235381 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30910  predicted membrane protein  32.32 
 
 		 392 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3067  hypothetical protein  33.92 
 
 		 404 aa  110  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0285  protein of unknown function DUF418  26.43 
 
 		 409 aa  110  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2978  hypothetical protein  29.82 
 
 		 414 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1396  hypothetical protein  27.76 
 
 		 399 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3043  hypothetical protein  27.39 
 
 		 382 aa  107  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2299  hypothetical protein  31.5 
 
 		 385 aa  107  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383736 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2885  protein of unknown function DUF405  28.75 
 
 		 414 aa  107  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.802913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2447  hypothetical protein  30.97 
 
 		 385 aa  106  7e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02081  conserved inner membrane protein  30.97 
 
 		 385 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.452541  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1506  protein of unknown function DUF418  30.97 
 
 		 385 aa  104  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.253618  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0814  hypothetical protein  30.97 
 
 		 385 aa  105  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2799  hypothetical protein  28.8 
 
 		 414 aa  104  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3286  hypothetical protein  30.97 
 
 		 385 aa  104  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.385085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1199  hypothetical protein  26.65 
 
 		 398 aa  103  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2286  hypothetical protein  30.97 
 
 		 385 aa  103  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0252  protein of unknown function DUF405  35.73 
 
 		 410 aa  103  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2305  hypothetical protein  31.16 
 
 		 391 aa  103  6e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0691  hypothetical protein  29.67 
 
 		 381 aa  102  9e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1198  hypothetical protein  24.26 
 
 		 399 aa  102  9e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0666  protein of unknown function DUF405  27.68 
 
 		 362 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000167692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1496  hypothetical protein  30.71 
 
 		 385 aa  102  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2840  hypothetical protein  29.62 
 
 		 414 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.110654 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2383  hypothetical protein  29.66 
 
 		 380 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.76362 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2427  hypothetical protein  29.66 
 
 		 380 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.901091 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2338  hypothetical protein  29.66 
 
 		 380 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.890901  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2752  hypothetical protein  31.19 
 
 		 385 aa  100  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.915358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1942  hypothetical protein  31.19 
 
 		 391 aa  100  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.235403  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2431  hypothetical protein  29.66 
 
 		 380 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.503306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1561  hypothetical protein  30.9 
 
 		 393 aa  99.8  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2115  protein of unknown function DUF418  25.06 
 
 		 412 aa  97.8  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2541  hypothetical protein  29.66 
 
 		 380 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0379465  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0117  membrane protein  25.06 
 
 		 381 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000725343  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01909  transport protein  30 
 
 		 409 aa  94.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.694528  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1818  hypothetical protein  30.37 
 
 		 415 aa  92.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.5 
 
 		 410 aa  90.9  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.037271 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1449  hypothetical protein  25.58 
 
 		 387 aa  89.7  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.831542  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1663  hypothetical protein  25.58 
 
 		 387 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2355  protein of unknown function DUF405  29.62 
 
 		 364 aa  89  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1492  hypothetical protein  25.96 
 
 		 387 aa  88.6  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.512867  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0820  hypothetical protein  31.47 
 
 		 365 aa  88.6  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1477  hypothetical protein  25.32 
 
 		 387 aa  87.4  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.117063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1593  hypothetical protein  25.32 
 
 		 387 aa  87.4  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1739  hypothetical protein  24.62 
 
 		 387 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00248027  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2404  hypothetical protein  30.33 
 
 		 382 aa  86.3  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.334101  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0609  hypothetical protein  29.34 
 
 		 787 aa  86.3  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1699  hypothetical protein  25.71 
 
 		 387 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1450  hypothetical protein  25.77 
 
 		 387 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000207641  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3571  protein of unknown function DUF418  30.48 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.983337  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3717  hypothetical protein  24.62 
 
 		 387 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0178  hypothetical protein  24.81 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1628  hypothetical protein  23.72 
 
 		 387 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000608067  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2066  protein of unknown function DUF418  24.88 
 
 		 404 aa  82.8  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0837783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0179  hypothetical protein  24.37 
 
 		 381 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000571802  hitchhiker  1.74871e-35 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0371  hypothetical protein  29.63 
 
 		 397 aa  79.7  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4921  hypothetical protein  26.27 
 
 		 265 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0008351  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3015  hypothetical protein  32.83 
 
 		 388 aa  79.3  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00833892 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2567  hypothetical protein  32.83 
 
 		 388 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2469  hypothetical protein  32.58 
 
 		 388 aa  78.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1171  protein of unknown function DUF418  25.38 
 
 		 394 aa  78.6  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0015  hypothetical protein  30.72 
 
 		 381 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.428508  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1066  hypothetical protein  27.23 
 
 		 401 aa  75.9  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1304  hypothetical protein  25.71 
 
 		 388 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4916  protein of unknown function DUF418  30.17 
 
 		 401 aa  76.3  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.511749  normal  0.649012 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1646  protein of unknown function DUF405  31.98 
 
 		 394 aa  72.8  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0683  protein of unknown function DUF405  34.48 
 
 		 387 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0746  protein of unknown function DUF405  34.19 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.685935 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4868  hypothetical protein  32 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4479  membrane spanning protein  32 
 
 		 340 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4497  membrane spanning protein  31.2 
 
 		 340 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0379  hypothetical protein  32 
 
 		 340 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4644  hypothetical protein  31.2 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4998  hypothetical protein  31.2 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>