143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1661 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1661  transport protein  100 
 
 		 430 aa  864    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.414626  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1608  hypothetical protein  98.37 
 
 		 430 aa  848    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01909  transport protein  60.45 
 
 		 409 aa  438  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.694528  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2885  protein of unknown function DUF405  54.39 
 
 		 414 aa  400  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.802913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4423  hypothetical protein  35.28 
 
 		 417 aa  179  5.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00407884  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0455  hypothetical protein  36.25 
 
 		 415 aa  176  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222068  hitchhiker  0.00425561 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2860  protein of unknown function DUF418  34.36 
 
 		 415 aa  166  9e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0285  protein of unknown function DUF418  30.68 
 
 		 409 aa  160  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1538  protein of unknown function DUF405  33.1 
 
 		 406 aa  158  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3571  protein of unknown function DUF418  33.99 
 
 		 405 aa  158  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.983337  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0683  protein of unknown function DUF405  32.02 
 
 		 387 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0076  protein of unknown function DUF418  33.73 
 
 		 416 aa  152  8.999999999999999e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.477208  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3566  protein of unknown function DUF418  31.43 
 
 		 459 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.726105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2840  hypothetical protein  31.85 
 
 		 414 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.110654 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0733  protein of unknown function DUF405  33.25 
 
 		 398 aa  145  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0820  hypothetical protein  32.51 
 
 		 365 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0775  hypothetical protein  30.84 
 
 		 401 aa  143  6e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0095945  normal  0.285929 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1499  protein of unknown function DUF405  33.41 
 
 		 388 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1671  hypothetical protein  32.77 
 
 		 395 aa  139  8.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2355  protein of unknown function DUF405  32.91 
 
 		 364 aa  138  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2305  hypothetical protein  33.33 
 
 		 391 aa  138  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2201  hypothetical protein  30.84 
 
 		 416 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.964455  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2115  protein of unknown function DUF418  30.55 
 
 		 412 aa  134  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0190  hypothetical protein  31.49 
 
 		 428 aa  132  9e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.55784  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1942  hypothetical protein  31.11 
 
 		 391 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.235403  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2066  protein of unknown function DUF418  29.74 
 
 		 404 aa  129  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0837783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4881  hypothetical protein  28.33 
 
 		 390 aa  127  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00420784  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3565  protein of unknown function DUF418  28.35 
 
 		 431 aa  127  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.708888  normal  0.443247 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30910  predicted membrane protein  31.65 
 
 		 392 aa  126  7e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0045  hypothetical protein  26.83 
 
 		 389 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000457904  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1561  hypothetical protein  31.9 
 
 		 393 aa  125  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0117  membrane protein  28.57 
 
 		 381 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000725343  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1198  hypothetical protein  26.27 
 
 		 399 aa  123  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.33 
 
 		 410 aa  122  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.037271 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2752  hypothetical protein  33.09 
 
 		 385 aa  121  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.915358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0178  hypothetical protein  28.68 
 
 		 381 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0015  hypothetical protein  27.43 
 
 		 381 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.428508  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0179  hypothetical protein  28.57 
 
 		 381 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000571802  hitchhiker  1.74871e-35 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0814  hypothetical protein  32.69 
 
 		 385 aa  117  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1739  hypothetical protein  29.36 
 
 		 387 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00248027  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1699  hypothetical protein  29.76 
 
 		 387 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1066  hypothetical protein  30.18 
 
 		 401 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2447  hypothetical protein  32.85 
 
 		 385 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1628  hypothetical protein  27.57 
 
 		 387 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000608067  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1818  hypothetical protein  28.64 
 
 		 415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2383  hypothetical protein  32.01 
 
 		 380 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.76362 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2427  hypothetical protein  32.01 
 
 		 380 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.901091 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2541  hypothetical protein  32.44 
 
 		 380 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0379465  normal  0.156144 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02081  conserved inner membrane protein  32.51 
 
 		 385 aa  114  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.452541  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1506  protein of unknown function DUF418  32.51 
 
 		 385 aa  114  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.253618  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2299  hypothetical protein  32.05 
 
 		 385 aa  114  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383736 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4916  protein of unknown function DUF418  28.27 
 
 		 401 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.511749  normal  0.649012 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2338  hypothetical protein  31.76 
 
 		 380 aa  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.890901  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3717  hypothetical protein  28.64 
 
 		 387 aa  113  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3286  hypothetical protein  32.26 
 
 		 385 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.385085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1496  hypothetical protein  31.86 
 
 		 385 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2286  hypothetical protein  31.86 
 
 		 385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2431  hypothetical protein  31.39 
 
 		 380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.503306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4786  hypothetical protein  28.81 
 
 		 406 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1492  hypothetical protein  28.54 
 
 		 387 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.512867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1449  hypothetical protein  27.9 
 
 		 387 aa  109  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.831542  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0666  protein of unknown function DUF405  25.19 
 
 		 362 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000167692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1663  hypothetical protein  27.9 
 
 		 387 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3067  hypothetical protein  30.9 
 
 		 404 aa  107  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1477  hypothetical protein  27.66 
 
 		 387 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.117063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1593  hypothetical protein  27.66 
 
 		 387 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2404  hypothetical protein  30.65 
 
 		 382 aa  104  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.334101  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0746  protein of unknown function DUF405  39.16 
 
 		 204 aa  104  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.685935 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0371  hypothetical protein  30.73 
 
 		 397 aa  102  9e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2567  hypothetical protein  31.09 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2469  hypothetical protein  30.85 
 
 		 388 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3015  hypothetical protein  31.09 
 
 		 388 aa  101  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00833892 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2290  protein of unknown function DUF405  27.62 
 
 		 391 aa  100  6e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.578329  normal  0.0235381 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4860  hypothetical protein  30.42 
 
 		 387 aa  99.8  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3078  hypothetical protein  26.57 
 
 		 411 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1199  hypothetical protein  24.3 
 
 		 398 aa  97.8  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3087  hypothetical protein  26.15 
 
 		 411 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3230  hypothetical protein  26.15 
 
 		 411 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1289  protein of unknown function DUF405  26.15 
 
 		 401 aa  94  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1203  hypothetical protein  28.57 
 
 		 398 aa  92  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00200  predicted membrane protein  28.01 
 
 		 397 aa  90.5  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.220914 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1304  hypothetical protein  27.78 
 
 		 388 aa  89.4  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1888  hypothetical protein  27.27 
 
 		 389 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2327  hypothetical protein  29.35 
 
 		 388 aa  89  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1396  hypothetical protein  26.97 
 
 		 399 aa  87.8  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2882  hypothetical protein  27.59 
 
 		 414 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2799  hypothetical protein  27.7 
 
 		 414 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4921  hypothetical protein  25 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0008351  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2581  hypothetical protein  27.53 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.365833  normal  0.0605789 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1675  protein of unknown function DUF405  28.68 
 
 		 375 aa  84  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.965008  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5203  conserved membrane spanning protein  41.46 
 
 		 347 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2978  hypothetical protein  27.39 
 
 		 414 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1646  protein of unknown function DUF405  27.39 
 
 		 394 aa  80.5  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0505  protein of unknown function DUF418  26.97 
 
 		 407 aa  79.3  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000344824 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0252  protein of unknown function DUF405  58.9 
 
 		 410 aa  73.9  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15990  predicted membrane protein  27.76 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.230384 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3111  protein of unknown function DUF418  27.75 
 
 		 443 aa  73.2  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1171  protein of unknown function DUF418  31.54 
 
 		 394 aa  73.2  0.000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0622  hypothetical protein  25.71 
 
 		 439 aa  72  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25010  predicted membrane protein  26.81 
 
 		 417 aa  72  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>