100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8135 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8135  hypothetical protein  100 
 
 		 397 aa  763    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026592  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2581  hypothetical protein  45.97 
 
 		 388 aa  278  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.365833  normal  0.0605789 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4741  hypothetical protein  45.5 
 
 		 392 aa  273  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.400946  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3529  protein of unknown function DUF418  44.47 
 
 		 398 aa  269  5.9999999999999995e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.296308  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1416  protein of unknown function DUF405  44.42 
 
 		 407 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.548338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0622  hypothetical protein  44.01 
 
 		 439 aa  239  9e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0719  protein of unknown function DUF418  47.03 
 
 		 405 aa  233  3e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.699875  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0072  hypothetical protein  46.56 
 
 		 380 aa  232  9e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484765  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4293  protein of unknown function DUF418  43.8 
 
 		 390 aa  225  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0035  hypothetical protein  43.22 
 
 		 402 aa  222  8e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1415  protein of unknown function DUF405  44.01 
 
 		 399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.845184  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1668  protein of unknown function DUF418  40.51 
 
 		 420 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620816  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1063  protein of unknown function DUF405  40.97 
 
 		 472 aa  202  7e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3607  protein of unknown function DUF418  40.69 
 
 		 407 aa  202  7e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.526186  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1670  hypothetical protein  38.8 
 
 		 405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.704713  normal  0.19338 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0505  protein of unknown function DUF418  39.39 
 
 		 407 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000344824 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0984  protein of unknown function DUF418  41.39 
 
 		 387 aa  197  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0392587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3780  hypothetical protein  38.73 
 
 		 401 aa  196  5.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1461  hypothetical protein  37.68 
 
 		 401 aa  194  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1236  hypothetical protein  41.06 
 
 		 399 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2152  hypothetical protein  35.68 
 
 		 393 aa  188  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.391046 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3111  protein of unknown function DUF418  41 
 
 		 443 aa  184  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15990  predicted membrane protein  39.95 
 
 		 414 aa  182  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.230384 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4159  hypothetical protein  38.89 
 
 		 401 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.776458  decreased coverage  0.000152397 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24880  predicted membrane protein  39.6 
 
 		 432 aa  173  3.9999999999999995e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0615892  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1078  protein of unknown function DUF418  37.5 
 
 		 384 aa  168  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07880  predicted membrane protein  36.83 
 
 		 407 aa  137  4e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4423  hypothetical protein  28.21 
 
 		 417 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00407884  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2066  protein of unknown function DUF418  25.94 
 
 		 404 aa  87  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0837783  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0683  protein of unknown function DUF405  23.83 
 
 		 387 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1538  protein of unknown function DUF405  29.31 
 
 		 406 aa  82.4  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0455  hypothetical protein  28.1 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222068  hitchhiker  0.00425561 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3078  hypothetical protein  25.56 
 
 		 411 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3571  protein of unknown function DUF418  28.65 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.983337  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3230  hypothetical protein  25.31 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2115  protein of unknown function DUF418  23.58 
 
 		 412 aa  76.6  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3087  hypothetical protein  24.81 
 
 		 411 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1289  protein of unknown function DUF405  25.06 
 
 		 401 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4804  transmembrane protein  24.54 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000142062  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1499  protein of unknown function DUF405  28.21 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1203  hypothetical protein  26.19 
 
 		 398 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5273  hypothetical protein  24.41 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0190  hypothetical protein  29.89 
 
 		 428 aa  72.8  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.55784  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2327  hypothetical protein  28.75 
 
 		 388 aa  71.6  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30910  predicted membrane protein  27.34 
 
 		 392 aa  71.2  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1396  hypothetical protein  25.88 
 
 		 399 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00200  predicted membrane protein  27.1 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.220914 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1066  hypothetical protein  28.16 
 
 		 401 aa  69.7  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2860  protein of unknown function DUF418  30.43 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3566  protein of unknown function DUF418  26.11 
 
 		 459 aa  67.4  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.726105 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0117  membrane protein  21.22 
 
 		 381 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000725343  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2885  protein of unknown function DUF405  27.45 
 
 		 414 aa  65.5  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.802913  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0015  hypothetical protein  20.88 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.428508  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1608  hypothetical protein  26.37 
 
 		 430 aa  64.7  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1661  transport protein  26.6 
 
 		 430 aa  64.7  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.414626  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0285  protein of unknown function DUF418  25.55 
 
 		 409 aa  64.3  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2355  protein of unknown function DUF405  29.37 
 
 		 364 aa  63.5  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2338  hypothetical protein  27.27 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.890901  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2882  hypothetical protein  24.5 
 
 		 414 aa  62.8  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2427  hypothetical protein  27.27 
 
 		 380 aa  62.8  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.901091 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2383  hypothetical protein  27.27 
 
 		 380 aa  62.8  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.76362 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2840  hypothetical protein  27.27 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.110654 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2431  hypothetical protein  27.07 
 
 		 380 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.503306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0733  protein of unknown function DUF405  28.03 
 
 		 398 aa  62.4  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2404  hypothetical protein  37.69 
 
 		 382 aa  60.8  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.334101  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0045  hypothetical protein  22.06 
 
 		 389 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000457904  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2978  hypothetical protein  24.13 
 
 		 414 aa  59.7  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2799  hypothetical protein  23.51 
 
 		 414 aa  59.7  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2201  hypothetical protein  25.72 
 
 		 416 aa  60.1  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.964455  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4097  hypothetical protein  27.5 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4881  hypothetical protein  22.85 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00420784  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3043  hypothetical protein  30 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0179  hypothetical protein  19.47 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000571802  hitchhiker  1.74871e-35 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1671  hypothetical protein  26.07 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0076  protein of unknown function DUF418  26.15 
 
 		 416 aa  57  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.477208  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0746  protein of unknown function DUF405  34.02 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.685935 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1942  hypothetical protein  25.88 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.235403  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3565  protein of unknown function DUF418  24.15 
 
 		 431 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.708888  normal  0.443247 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2290  protein of unknown function DUF405  26.67 
 
 		 391 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.578329  normal  0.0235381 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2305  hypothetical protein  31.64 
 
 		 391 aa  54.7  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1561  hypothetical protein  43.37 
 
 		 393 aa  54.3  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25000  predicted membrane protein  28.87 
 
 		 387 aa  53.1  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2752  hypothetical protein  26.85 
 
 		 385 aa  52.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.915358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5203  conserved membrane spanning protein  25.06 
 
 		 347 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0775  hypothetical protein  25.42 
 
 		 401 aa  52  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0095945  normal  0.285929 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25010  predicted membrane protein  26.48 
 
 		 417 aa  51.2  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2541  hypothetical protein  34.07 
 
 		 380 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0379465  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0178  hypothetical protein  19.95 
 
 		 381 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1199  hypothetical protein  20.67 
 
 		 398 aa  50.8  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2447  hypothetical protein  34.07 
 
 		 385 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0820  hypothetical protein  29.47 
 
 		 365 aa  48.9  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02081  conserved inner membrane protein  34.07 
 
 		 385 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.452541  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3286  hypothetical protein  34.07 
 
 		 385 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.385085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0814  hypothetical protein  34.07 
 
 		 385 aa  47.8  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1506  protein of unknown function DUF418  34.07 
 
 		 385 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.253618  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2299  hypothetical protein  45.95 
 
 		 385 aa  47  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383736 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1888  hypothetical protein  26.82 
 
 		 389 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4916  protein of unknown function DUF418  26.05 
 
 		 401 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.511749  normal  0.649012 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01909  transport protein  26.45 
 
 		 409 aa  44.3  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.694528  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0691  hypothetical protein  25.14 
 
 		 381 aa  42.7  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>