69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0984 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0984  protein of unknown function DUF418  100 
 
 
387 aa  729    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0392587  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0035  hypothetical protein  48.19 
 
 
402 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2581  hypothetical protein  40.99 
 
 
388 aa  216  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.365833  normal  0.0605789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8135  hypothetical protein  41.39 
 
 
397 aa  216  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026592  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4741  hypothetical protein  40.53 
 
 
392 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.400946  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3529  protein of unknown function DUF418  40.66 
 
 
398 aa  206  5e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.296308  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1078  protein of unknown function DUF418  40.62 
 
 
384 aa  171  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1670  hypothetical protein  37.85 
 
 
405 aa  170  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.704713  normal  0.19338 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1668  protein of unknown function DUF418  41.27 
 
 
420 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620816  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2152  hypothetical protein  37.66 
 
 
393 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.391046 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4293  protein of unknown function DUF418  38.5 
 
 
390 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0072  hypothetical protein  40.21 
 
 
380 aa  159  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484765  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0505  protein of unknown function DUF418  38.23 
 
 
407 aa  158  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000344824 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1415  protein of unknown function DUF405  40 
 
 
399 aa  155  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.845184  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1416  protein of unknown function DUF405  37.4 
 
 
407 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.548338  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1063  protein of unknown function DUF405  36.9 
 
 
472 aa  144  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24880  predicted membrane protein  36.02 
 
 
432 aa  143  4e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0615892  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1461  hypothetical protein  36.79 
 
 
401 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3607  protein of unknown function DUF418  34.94 
 
 
407 aa  139  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.526186  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1236  hypothetical protein  36.87 
 
 
399 aa  134  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0719  protein of unknown function DUF418  36.72 
 
 
405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.699875  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3780  hypothetical protein  33.42 
 
 
401 aa  126  6e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4159  hypothetical protein  37.12 
 
 
401 aa  126  6e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.776458  decreased coverage  0.000152397 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0622  hypothetical protein  37.84 
 
 
439 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15990  predicted membrane protein  33.5 
 
 
414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.230384 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3111  protein of unknown function DUF418  39.9 
 
 
443 aa  94  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414343  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07880  predicted membrane protein  35.07 
 
 
407 aa  92.8  9e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0683  protein of unknown function DUF405  26.52 
 
 
387 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2840  hypothetical protein  31.14 
 
 
414 aa  74.3  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.110654 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1538  protein of unknown function DUF405  28.67 
 
 
406 aa  67.4  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3043  hypothetical protein  24.13 
 
 
382 aa  63.5  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2860  protein of unknown function DUF418  27.18 
 
 
415 aa  63.5  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3087  hypothetical protein  26.16 
 
 
411 aa  60.5  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3571  protein of unknown function DUF418  27.93 
 
 
405 aa  57.8  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.983337  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2066  protein of unknown function DUF418  24.23 
 
 
404 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0837783  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2290  protein of unknown function DUF405  28.44 
 
 
391 aa  54.3  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.578329  normal  0.0235381 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0666  protein of unknown function DUF405  22.31 
 
 
362 aa  53.5  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000167692  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1396  hypothetical protein  23.89 
 
 
399 aa  53.5  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1289  protein of unknown function DUF405  31.25 
 
 
401 aa  53.1  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2882  hypothetical protein  25.28 
 
 
414 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0076  protein of unknown function DUF418  27.55 
 
 
416 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.477208  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4423  hypothetical protein  25.79 
 
 
417 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00407884  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5273  hypothetical protein  22.04 
 
 
312 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3230  hypothetical protein  30.47 
 
 
411 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0190  hypothetical protein  30.77 
 
 
428 aa  50.4  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.55784  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3078  hypothetical protein  29.69 
 
 
411 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0733  protein of unknown function DUF405  26.29 
 
 
398 aa  50.1  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0015  hypothetical protein  30.63 
 
 
381 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.428508  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3286  hypothetical protein  28.57 
 
 
385 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.385085  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1496  hypothetical protein  28.57 
 
 
385 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0117  membrane protein  33.1 
 
 
381 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000725343  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2799  hypothetical protein  25 
 
 
414 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0455  hypothetical protein  26.82 
 
 
415 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222068  hitchhiker  0.00425561 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1506  protein of unknown function DUF418  28.08 
 
 
385 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.253618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2447  hypothetical protein  28.08 
 
 
385 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02081  conserved inner membrane protein  28.08 
 
 
385 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.452541  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1203  hypothetical protein  29.03 
 
 
398 aa  47.4  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0814  hypothetical protein  28.08 
 
 
385 aa  47.4  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2286  hypothetical protein  28.08 
 
 
385 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2885  protein of unknown function DUF405  27.36 
 
 
414 aa  46.6  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.802913  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4804  transmembrane protein  25.11 
 
 
312 aa  46.2  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000142062  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3566  protein of unknown function DUF418  33.07 
 
 
459 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.726105 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0045  hypothetical protein  22.52 
 
 
389 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000457904  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2299  hypothetical protein  28.08 
 
 
385 aa  46.2  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383736 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30910  predicted membrane protein  29.45 
 
 
392 aa  45.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4097  hypothetical protein  25.36 
 
 
399 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4881  hypothetical protein  21.79 
 
 
390 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00420784  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2752  hypothetical protein  24.58 
 
 
385 aa  43.9  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.915358  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3565  protein of unknown function DUF418  33.33 
 
 
431 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.708888  normal  0.443247 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>