96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1236 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1236  hypothetical protein  100 
 
 
399 aa  768    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2152  hypothetical protein  51.78 
 
 
393 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.391046 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8135  hypothetical protein  41.06 
 
 
397 aa  226  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026592  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2581  hypothetical protein  38.29 
 
 
388 aa  219  7.999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.365833  normal  0.0605789 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0622  hypothetical protein  38.7 
 
 
439 aa  205  9e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1078  protein of unknown function DUF418  40 
 
 
384 aa  204  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1063  protein of unknown function DUF405  39.49 
 
 
472 aa  192  7e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1668  protein of unknown function DUF418  39.29 
 
 
420 aa  187  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620816  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3529  protein of unknown function DUF418  36.43 
 
 
398 aa  186  8e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.296308  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4741  hypothetical protein  36.75 
 
 
392 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.400946  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1670  hypothetical protein  36.95 
 
 
405 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.704713  normal  0.19338 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1461  hypothetical protein  37.35 
 
 
401 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24880  predicted membrane protein  39.2 
 
 
432 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0615892  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1416  protein of unknown function DUF405  37.41 
 
 
407 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.548338  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15990  predicted membrane protein  36.39 
 
 
414 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.230384 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3607  protein of unknown function DUF418  36.61 
 
 
407 aa  159  6e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.526186  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0505  protein of unknown function DUF418  34.3 
 
 
407 aa  159  8e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000344824 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1415  protein of unknown function DUF405  36.91 
 
 
399 aa  155  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.845184  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0035  hypothetical protein  37.69 
 
 
402 aa  153  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0072  hypothetical protein  35.7 
 
 
380 aa  152  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484765  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4293  protein of unknown function DUF418  38.26 
 
 
390 aa  150  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0719  protein of unknown function DUF418  36.73 
 
 
405 aa  145  9e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.699875  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0984  protein of unknown function DUF418  37.12 
 
 
387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0392587  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3780  hypothetical protein  32.59 
 
 
401 aa  133  6.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4159  hypothetical protein  32.57 
 
 
401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.776458  decreased coverage  0.000152397 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0285  protein of unknown function DUF418  25.19 
 
 
409 aa  86.3  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07880  predicted membrane protein  34.27 
 
 
407 aa  84.7  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3111  protein of unknown function DUF418  45.53 
 
 
443 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414343  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1289  protein of unknown function DUF405  24.56 
 
 
401 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4097  hypothetical protein  24.31 
 
 
399 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3087  hypothetical protein  24.3 
 
 
411 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3230  hypothetical protein  24.43 
 
 
411 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1538  protein of unknown function DUF405  28.12 
 
 
406 aa  77.4  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1396  hypothetical protein  26.12 
 
 
399 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3078  hypothetical protein  24.17 
 
 
411 aa  77  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4423  hypothetical protein  27.49 
 
 
417 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00407884  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3571  protein of unknown function DUF418  31.11 
 
 
405 aa  73.9  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.983337  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0117  membrane protein  22.73 
 
 
381 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000725343  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3043  hypothetical protein  25.76 
 
 
382 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1203  hypothetical protein  25.85 
 
 
398 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0455  hypothetical protein  28.08 
 
 
415 aa  69.7  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222068  hitchhiker  0.00425561 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0076  protein of unknown function DUF418  26.86 
 
 
416 aa  68.6  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.477208  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2799  hypothetical protein  24.94 
 
 
414 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2882  hypothetical protein  24.62 
 
 
414 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0015  hypothetical protein  21.55 
 
 
381 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.428508  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1671  hypothetical protein  23.37 
 
 
395 aa  65.1  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2327  hypothetical protein  29.98 
 
 
388 aa  64.3  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0683  protein of unknown function DUF405  22.73 
 
 
387 aa  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2978  hypothetical protein  25.13 
 
 
414 aa  63.2  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2885  protein of unknown function DUF405  28.57 
 
 
414 aa  59.3  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.802913  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0746  protein of unknown function DUF405  36.08 
 
 
204 aa  59.7  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.685935 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2305  hypothetical protein  27.27 
 
 
391 aa  58.2  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2860  protein of unknown function DUF418  25.88 
 
 
415 aa  57  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0178  hypothetical protein  21.23 
 
 
381 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1942  hypothetical protein  23.16 
 
 
391 aa  56.2  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.235403  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01909  transport protein  26.37 
 
 
409 aa  54.7  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.694528  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0179  hypothetical protein  21.62 
 
 
381 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000571802  hitchhiker  1.74871e-35 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1661  transport protein  24.24 
 
 
430 aa  54.3  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.414626  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4804  transmembrane protein  23.78 
 
 
312 aa  53.9  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000142062  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1608  hypothetical protein  24.47 
 
 
430 aa  53.9  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1066  hypothetical protein  26.97 
 
 
401 aa  52  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2752  hypothetical protein  28.49 
 
 
385 aa  52.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.915358  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5273  hypothetical protein  23.51 
 
 
312 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2115  protein of unknown function DUF418  23 
 
 
412 aa  50.8  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3566  protein of unknown function DUF418  29.81 
 
 
459 aa  50.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.726105 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1628  hypothetical protein  25.96 
 
 
387 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000608067  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2290  protein of unknown function DUF405  23.68 
 
 
391 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.578329  normal  0.0235381 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2447  hypothetical protein  30.77 
 
 
385 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1561  hypothetical protein  37.35 
 
 
393 aa  48.5  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0666  protein of unknown function DUF405  25 
 
 
362 aa  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000167692  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2404  hypothetical protein  30.83 
 
 
382 aa  47.8  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.334101  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2299  hypothetical protein  31.94 
 
 
385 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383736 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3286  hypothetical protein  30.07 
 
 
385 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.385085  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0814  hypothetical protein  30.07 
 
 
385 aa  47.4  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02081  conserved inner membrane protein  30.07 
 
 
385 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.452541  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4882  hypothetical protein  29.69 
 
 
340 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4889  hypothetical protein  29.69 
 
 
340 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2286  hypothetical protein  31.94 
 
 
385 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1506  protein of unknown function DUF418  37.35 
 
 
385 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.253618  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1496  hypothetical protein  31.94 
 
 
385 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0379  hypothetical protein  29.69 
 
 
340 aa  47  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4479  membrane spanning protein  28.91 
 
 
340 aa  46.6  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0017  hypothetical protein  24.36 
 
 
374 aa  46.6  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4998  hypothetical protein  28.91 
 
 
340 aa  46.6  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4644  hypothetical protein  28.91 
 
 
340 aa  46.6  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4858  hypothetical protein  28.12 
 
 
340 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4497  membrane spanning protein  28.91 
 
 
340 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3565  protein of unknown function DUF418  28.26 
 
 
431 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.708888  normal  0.443247 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3067  hypothetical protein  26.98 
 
 
404 aa  45.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0190  hypothetical protein  32.64 
 
 
428 aa  44.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.55784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4868  hypothetical protein  28.12 
 
 
340 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2201  hypothetical protein  28.57 
 
 
416 aa  43.5  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.964455  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0045  hypothetical protein  22.61 
 
 
389 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000457904  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1450  hypothetical protein  25 
 
 
387 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000207641  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2066  protein of unknown function DUF418  22.66 
 
 
404 aa  43.1  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0837783  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5203  conserved membrane spanning protein  28.57 
 
 
347 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>