58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1078 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1078  protein of unknown function DUF418  100 
 
 		 384 aa  720    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2152  hypothetical protein  42.06 
 
 		 393 aa  261  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.391046 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1236  hypothetical protein  40.73 
 
 		 399 aa  203  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2581  hypothetical protein  39.9 
 
 		 388 aa  203  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.365833  normal  0.0605789 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1670  hypothetical protein  40.15 
 
 		 405 aa  202  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.704713  normal  0.19338 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1461  hypothetical protein  38.27 
 
 		 401 aa  195  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8135  hypothetical protein  38.13 
 
 		 397 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026592  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1668  protein of unknown function DUF418  38.18 
 
 		 420 aa  194  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620816  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3529  protein of unknown function DUF418  38.68 
 
 		 398 aa  189  5.999999999999999e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.296308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4741  hypothetical protein  39.47 
 
 		 392 aa  187  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.400946  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0984  protein of unknown function DUF418  41.28 
 
 		 387 aa  183  6e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0392587  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1063  protein of unknown function DUF405  37.69 
 
 		 472 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0622  hypothetical protein  38.27 
 
 		 439 aa  170  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0719  protein of unknown function DUF418  42.2 
 
 		 405 aa  166  6.9999999999999995e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.699875  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4293  protein of unknown function DUF418  40.53 
 
 		 390 aa  164  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3607  protein of unknown function DUF418  38.66 
 
 		 407 aa  160  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.526186  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15990  predicted membrane protein  41.84 
 
 		 414 aa  158  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.230384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0072  hypothetical protein  37.6 
 
 		 380 aa  155  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0035  hypothetical protein  38.7 
 
 		 402 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24880  predicted membrane protein  36.34 
 
 		 432 aa  149  7e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0615892  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1416  protein of unknown function DUF405  36.6 
 
 		 407 aa  147  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.548338  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1415  protein of unknown function DUF405  35.81 
 
 		 399 aa  143  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.845184  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0505  protein of unknown function DUF418  35.6 
 
 		 407 aa  139  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000344824 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4159  hypothetical protein  33.25 
 
 		 401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.776458  decreased coverage  0.000152397 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3780  hypothetical protein  32.04 
 
 		 401 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07880  predicted membrane protein  33.42 
 
 		 407 aa  98.2  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4423  hypothetical protein  28.3 
 
 		 417 aa  87  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00407884  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0455  hypothetical protein  25.93 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222068  hitchhiker  0.00425561 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30910  predicted membrane protein  28.76 
 
 		 392 aa  69.7  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0683  protein of unknown function DUF405  22.25 
 
 		 387 aa  67  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2115  protein of unknown function DUF418  25.6 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3111  protein of unknown function DUF418  45.98 
 
 		 443 aa  64.3  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3230  hypothetical protein  29.23 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3087  hypothetical protein  29.23 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1289  protein of unknown function DUF405  29.23 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3078  hypothetical protein  29.23 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5273  hypothetical protein  22.19 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2882  hypothetical protein  23.96 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0117  membrane protein  21.91 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000725343  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0015  hypothetical protein  20.9 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.428508  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4804  transmembrane protein  22.73 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000142062  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2799  hypothetical protein  31.03 
 
 		 414 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1203  hypothetical protein  29.23 
 
 		 398 aa  55.5  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0179  hypothetical protein  23.38 
 
 		 381 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000571802  hitchhiker  1.74871e-35 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0285  protein of unknown function DUF418  22 
 
 		 409 aa  53.9  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3043  hypothetical protein  27.35 
 
 		 382 aa  53.5  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2978  hypothetical protein  22.78 
 
 		 414 aa  53.1  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00200  predicted membrane protein  27.48 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.220914 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2404  hypothetical protein  32.2 
 
 		 382 aa  51.6  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.334101  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4097  hypothetical protein  30.3 
 
 		 399 aa  50.1  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3571  protein of unknown function DUF418  26.89 
 
 		 405 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.983337  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1396  hypothetical protein  21.6 
 
 		 399 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0746  protein of unknown function DUF405  28.97 
 
 		 204 aa  47  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.685935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1888  hypothetical protein  30.04 
 
 		 389 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0252  protein of unknown function DUF405  26.32 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2885  protein of unknown function DUF405  27.11 
 
 		 414 aa  43.9  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.802913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1499  protein of unknown function DUF405  39.08 
 
 		 388 aa  43.9  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2201  hypothetical protein  25.06 
 
 		 416 aa  43.1  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.964455  normal  0.524788 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>