83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1063 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1063  protein of unknown function DUF405  100 
 
 		 472 aa  892    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0622  hypothetical protein  54.09 
 
 		 439 aa  350  3e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3111  protein of unknown function DUF418  53.9 
 
 		 443 aa  286  4e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1461  hypothetical protein  48.5 
 
 		 401 aa  280  4e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1668  protein of unknown function DUF418  46.45 
 
 		 420 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15990  predicted membrane protein  44.6 
 
 		 414 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.230384 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2581  hypothetical protein  41.67 
 
 		 388 aa  222  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.365833  normal  0.0605789 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3607  protein of unknown function DUF418  45.64 
 
 		 407 aa  220  3.9999999999999997e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.526186  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8135  hypothetical protein  40.56 
 
 		 397 aa  205  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026592  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24880  predicted membrane protein  41.19 
 
 		 432 aa  195  1e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0615892  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1416  protein of unknown function DUF405  41.03 
 
 		 407 aa  182  9.000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.548338  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3529  protein of unknown function DUF418  39.2 
 
 		 398 aa  181  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.296308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1670  hypothetical protein  37.38 
 
 		 405 aa  178  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.704713  normal  0.19338 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0719  protein of unknown function DUF418  40.67 
 
 		 405 aa  177  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.699875  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2152  hypothetical protein  35.1 
 
 		 393 aa  169  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.391046 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0505  protein of unknown function DUF418  39.39 
 
 		 407 aa  167  5e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000344824 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1236  hypothetical protein  38.73 
 
 		 399 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1415  protein of unknown function DUF405  39.74 
 
 		 399 aa  164  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.845184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0072  hypothetical protein  38.83 
 
 		 380 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4741  hypothetical protein  37.53 
 
 		 392 aa  162  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.400946  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1078  protein of unknown function DUF418  37.53 
 
 		 384 aa  160  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4293  protein of unknown function DUF418  39.75 
 
 		 390 aa  156  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3780  hypothetical protein  35.06 
 
 		 401 aa  139  8.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0035  hypothetical protein  34.45 
 
 		 402 aa  136  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4159  hypothetical protein  34.88 
 
 		 401 aa  131  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.776458  decreased coverage  0.000152397 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0984  protein of unknown function DUF418  35.77 
 
 		 387 aa  124  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0392587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07880  predicted membrane protein  33.42 
 
 		 407 aa  99.8  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30910  predicted membrane protein  29.44 
 
 		 392 aa  77.8  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4423  hypothetical protein  28.34 
 
 		 417 aa  77  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00407884  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0683  protein of unknown function DUF405  24.7 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0117  membrane protein  23.62 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000725343  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2327  hypothetical protein  32.24 
 
 		 388 aa  63.2  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3571  protein of unknown function DUF418  37.5 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.983337  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0285  protein of unknown function DUF418  22.25 
 
 		 409 aa  59.7  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0455  hypothetical protein  27.09 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222068  hitchhiker  0.00425561 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2840  hypothetical protein  28.79 
 
 		 414 aa  57.4  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.110654 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0015  hypothetical protein  28.08 
 
 		 381 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.428508  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1499  protein of unknown function DUF405  25.46 
 
 		 388 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0076  protein of unknown function DUF418  36.03 
 
 		 416 aa  55.5  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.477208  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0178  hypothetical protein  23.19 
 
 		 381 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2066  protein of unknown function DUF418  24.11 
 
 		 404 aa  53.9  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0837783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0190  hypothetical protein  31.53 
 
 		 428 aa  53.5  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.55784  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2860  protein of unknown function DUF418  25.94 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1608  hypothetical protein  25.37 
 
 		 430 aa  52  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1661  transport protein  25.62 
 
 		 430 aa  51.6  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.414626  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0179  hypothetical protein  22.78 
 
 		 381 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000571802  hitchhiker  1.74871e-35 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0045  hypothetical protein  22.9 
 
 		 389 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000457904  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3566  protein of unknown function DUF418  37.11 
 
 		 459 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.726105 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3043  hypothetical protein  35.64 
 
 		 382 aa  49.7  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2115  protein of unknown function DUF418  20.94 
 
 		 412 aa  49.7  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1289  protein of unknown function DUF405  29.55 
 
 		 401 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3087  hypothetical protein  29.55 
 
 		 411 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3230  hypothetical protein  29.55 
 
 		 411 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2799  hypothetical protein  30 
 
 		 414 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3078  hypothetical protein  29.92 
 
 		 411 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1066  hypothetical protein  29.43 
 
 		 401 aa  48.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1628  hypothetical protein  30.6 
 
 		 387 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000608067  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1450  hypothetical protein  31.15 
 
 		 387 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000207641  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2882  hypothetical protein  30 
 
 		 414 aa  47.4  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4916  protein of unknown function DUF418  28.62 
 
 		 401 aa  47.4  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.511749  normal  0.649012 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1739  hypothetical protein  27.94 
 
 		 387 aa  47  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00248027  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2885  protein of unknown function DUF405  26.97 
 
 		 414 aa  46.6  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.802913  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1396  hypothetical protein  28.24 
 
 		 399 aa  47  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1496  hypothetical protein  29.35 
 
 		 385 aa  47  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1203  hypothetical protein  25.41 
 
 		 398 aa  47  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3717  hypothetical protein  29.41 
 
 		 387 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02081  conserved inner membrane protein  25.29 
 
 		 385 aa  46.2  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.452541  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1506  protein of unknown function DUF418  25.29 
 
 		 385 aa  46.2  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.253618  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1538  protein of unknown function DUF405  32.39 
 
 		 406 aa  45.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4804  transmembrane protein  25.83 
 
 		 312 aa  45.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000142062  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2286  hypothetical protein  28.26 
 
 		 385 aa  45.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1663  hypothetical protein  30.05 
 
 		 387 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1477  hypothetical protein  30.05 
 
 		 387 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.117063  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1449  hypothetical protein  30.05 
 
 		 387 aa  44.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.831542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1593  hypothetical protein  30.05 
 
 		 387 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2299  hypothetical protein  25.29 
 
 		 385 aa  45.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383736 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01909  transport protein  25.58 
 
 		 409 aa  45.1  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.694528  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5273  hypothetical protein  25.83 
 
 		 312 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2290  protein of unknown function DUF405  26.91 
 
 		 391 aa  44.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.578329  normal  0.0235381 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2201  hypothetical protein  30.41 
 
 		 416 aa  44.3  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.964455  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1699  hypothetical protein  28.65 
 
 		 387 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1818  hypothetical protein  26.06 
 
 		 415 aa  43.9  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2447  hypothetical protein  25.33 
 
 		 385 aa  43.5  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>