78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3780 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3780  hypothetical protein  100 
 
 		 401 aa  762    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4159  hypothetical protein  87.28 
 
 		 401 aa  591  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.776458  decreased coverage  0.000152397 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2581  hypothetical protein  39.47 
 
 		 388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.365833  normal  0.0605789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8135  hypothetical protein  38.73 
 
 		 397 aa  216  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026592  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0072  hypothetical protein  38.3 
 
 		 380 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484765  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3529  protein of unknown function DUF418  38.56 
 
 		 398 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.296308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4741  hypothetical protein  40.57 
 
 		 392 aa  186  7e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.400946  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0719  protein of unknown function DUF418  36.5 
 
 		 405 aa  179  5.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.699875  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4293  protein of unknown function DUF418  41.45 
 
 		 390 aa  179  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2152  hypothetical protein  32.27 
 
 		 393 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.391046 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0622  hypothetical protein  36.67 
 
 		 439 aa  168  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0035  hypothetical protein  37.24 
 
 		 402 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1063  protein of unknown function DUF405  37.04 
 
 		 472 aa  158  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1668  protein of unknown function DUF418  37.16 
 
 		 420 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1461  hypothetical protein  37.03 
 
 		 401 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1670  hypothetical protein  33.58 
 
 		 405 aa  149  8e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.704713  normal  0.19338 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1416  protein of unknown function DUF405  37.28 
 
 		 407 aa  144  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.548338  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0505  protein of unknown function DUF418  36 
 
 		 407 aa  142  9e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000344824 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1415  protein of unknown function DUF405  38.05 
 
 		 399 aa  139  7e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.845184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24880  predicted membrane protein  35.95 
 
 		 432 aa  138  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0615892  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3111  protein of unknown function DUF418  37.12 
 
 		 443 aa  137  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414343  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3607  protein of unknown function DUF418  36.61 
 
 		 407 aa  136  7.000000000000001e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.526186  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1236  hypothetical protein  33.92 
 
 		 399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15990  predicted membrane protein  36.68 
 
 		 414 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.230384 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1078  protein of unknown function DUF418  31.93 
 
 		 384 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0984  protein of unknown function DUF418  33.42 
 
 		 387 aa  122  8e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0392587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4423  hypothetical protein  27.34 
 
 		 417 aa  103  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00407884  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07880  predicted membrane protein  30.67 
 
 		 407 aa  96.3  9e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0455  hypothetical protein  27.78 
 
 		 415 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222068  hitchhiker  0.00425561 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0285  protein of unknown function DUF418  26.2 
 
 		 409 aa  77  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1538  protein of unknown function DUF405  29.47 
 
 		 406 aa  76.3  0.0000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0076  protein of unknown function DUF418  27.88 
 
 		 416 aa  75.9  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.477208  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2860  protein of unknown function DUF418  28.19 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2327  hypothetical protein  30.32 
 
 		 388 aa  68.2  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4804  transmembrane protein  24.23 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000142062  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1396  hypothetical protein  25.21 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5273  hypothetical protein  23.62 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2290  protein of unknown function DUF405  28.22 
 
 		 391 aa  62.8  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.578329  normal  0.0235381 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2066  protein of unknown function DUF418  25.54 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0837783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2885  protein of unknown function DUF405  26.54 
 
 		 414 aa  62  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.802913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1661  transport protein  26.46 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.414626  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0190  hypothetical protein  29.78 
 
 		 428 aa  58.5  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.55784  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0683  protein of unknown function DUF405  25.45 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1608  hypothetical protein  24.38 
 
 		 430 aa  58.2  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2355  protein of unknown function DUF405  27.61 
 
 		 364 aa  57.4  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2799  hypothetical protein  25.27 
 
 		 414 aa  57.4  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2882  hypothetical protein  25.27 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2115  protein of unknown function DUF418  23.68 
 
 		 412 aa  55.8  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3043  hypothetical protein  25.12 
 
 		 382 aa  56.2  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2840  hypothetical protein  28.29 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.110654 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4097  hypothetical protein  24.11 
 
 		 399 aa  55.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3571  protein of unknown function DUF418  26.57 
 
 		 405 aa  54.3  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.983337  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2978  hypothetical protein  25.2 
 
 		 414 aa  54.3  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3078  hypothetical protein  24.46 
 
 		 411 aa  53.5  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3087  hypothetical protein  24.52 
 
 		 411 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0775  hypothetical protein  27.23 
 
 		 401 aa  52.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0095945  normal  0.285929 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3230  hypothetical protein  24.52 
 
 		 411 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1671  hypothetical protein  31.21 
 
 		 395 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0733  protein of unknown function DUF405  25.43 
 
 		 398 aa  52  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1289  protein of unknown function DUF405  24.59 
 
 		 401 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2404  hypothetical protein  34 
 
 		 382 aa  50.4  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.334101  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1203  hypothetical protein  35.87 
 
 		 398 aa  50.1  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0252  protein of unknown function DUF405  31.09 
 
 		 410 aa  50.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0015  hypothetical protein  21.69 
 
 		 381 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.428508  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3286  hypothetical protein  28 
 
 		 385 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.385085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0179  hypothetical protein  21.03 
 
 		 381 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000571802  hitchhiker  1.74871e-35 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1942  hypothetical protein  32.82 
 
 		 391 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.235403  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3566  protein of unknown function DUF418  29.71 
 
 		 459 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.726105 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3565  protein of unknown function DUF418  32.03 
 
 		 431 aa  47.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.708888  normal  0.443247 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2305  hypothetical protein  31.93 
 
 		 391 aa  47  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2201  hypothetical protein  32.08 
 
 		 416 aa  47  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.964455  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00200  predicted membrane protein  25.74 
 
 		 397 aa  46.2  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.220914 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0746  protein of unknown function DUF405  29.01 
 
 		 204 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.685935 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1499  protein of unknown function DUF405  27.65 
 
 		 388 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0820  hypothetical protein  29.47 
 
 		 365 aa  45.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0379  hypothetical protein  22.88 
 
 		 340 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4916  protein of unknown function DUF418  31.71 
 
 		 401 aa  43.5  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.511749  normal  0.649012 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01909  transport protein  26.34 
 
 		 409 aa  43.1  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.694528  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>