110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3607 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3607  protein of unknown function DUF418  100 
 
 		 407 aa  781    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.526186  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1668  protein of unknown function DUF418  52.66 
 
 		 420 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0622  hypothetical protein  49.37 
 
 		 439 aa  302  6.000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15990  predicted membrane protein  48.51 
 
 		 414 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.230384 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1461  hypothetical protein  44.96 
 
 		 401 aa  265  7e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3111  protein of unknown function DUF418  48.77 
 
 		 443 aa  263  3e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24880  predicted membrane protein  43.96 
 
 		 432 aa  258  2e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0615892  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1063  protein of unknown function DUF405  45.18 
 
 		 472 aa  248  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2581  hypothetical protein  43.35 
 
 		 388 aa  247  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.365833  normal  0.0605789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8135  hypothetical protein  41.08 
 
 		 397 aa  227  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026592  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1670  hypothetical protein  39.81 
 
 		 405 aa  217  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.704713  normal  0.19338 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0505  protein of unknown function DUF418  39.85 
 
 		 407 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000344824 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1416  protein of unknown function DUF405  41.09 
 
 		 407 aa  192  7e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.548338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4741  hypothetical protein  35.96 
 
 		 392 aa  186  9e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.400946  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0072  hypothetical protein  41.75 
 
 		 380 aa  183  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484765  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1415  protein of unknown function DUF405  40.2 
 
 		 399 aa  182  7e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.845184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0035  hypothetical protein  38.33 
 
 		 402 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2152  hypothetical protein  34.66 
 
 		 393 aa  178  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.391046 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1078  protein of unknown function DUF418  37.86 
 
 		 384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4293  protein of unknown function DUF418  37.93 
 
 		 390 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3529  protein of unknown function DUF418  36.13 
 
 		 398 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.296308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1236  hypothetical protein  37.07 
 
 		 399 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0719  protein of unknown function DUF418  40 
 
 		 405 aa  150  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.699875  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3780  hypothetical protein  35.94 
 
 		 401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0984  protein of unknown function DUF418  36.62 
 
 		 387 aa  141  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0392587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4159  hypothetical protein  36.41 
 
 		 401 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.776458  decreased coverage  0.000152397 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4423  hypothetical protein  29.93 
 
 		 417 aa  106  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00407884  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0455  hypothetical protein  30.18 
 
 		 415 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222068  hitchhiker  0.00425561 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0683  protein of unknown function DUF405  24.13 
 
 		 387 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4804  transmembrane protein  23.06 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000142062  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00200  predicted membrane protein  26.97 
 
 		 397 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.220914 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2115  protein of unknown function DUF418  22.97 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2327  hypothetical protein  29.29 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2066  protein of unknown function DUF418  25.54 
 
 		 404 aa  73.2  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0837783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0117  membrane protein  22.17 
 
 		 381 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000725343  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0015  hypothetical protein  21.48 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.428508  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3087  hypothetical protein  24.82 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3230  hypothetical protein  24.06 
 
 		 411 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1396  hypothetical protein  23.41 
 
 		 399 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3078  hypothetical protein  23.82 
 
 		 411 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0746  protein of unknown function DUF405  31.17 
 
 		 204 aa  69.3  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.685935 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0179  hypothetical protein  22.64 
 
 		 381 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000571802  hitchhiker  1.74871e-35 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1499  protein of unknown function DUF405  28.26 
 
 		 388 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1289  protein of unknown function DUF405  24.17 
 
 		 401 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0076  protein of unknown function DUF418  28.92 
 
 		 416 aa  68.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.477208  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2290  protein of unknown function DUF405  26.88 
 
 		 391 aa  67.8  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.578329  normal  0.0235381 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0820  hypothetical protein  28.61 
 
 		 365 aa  67.4  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2752  hypothetical protein  26.6 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.915358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2404  hypothetical protein  26.01 
 
 		 382 aa  64.7  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.334101  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1561  hypothetical protein  33.13 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0178  hypothetical protein  21.89 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2305  hypothetical protein  26.44 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2201  hypothetical protein  25.47 
 
 		 416 aa  62.4  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.964455  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0045  hypothetical protein  22.25 
 
 		 389 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000457904  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1506  protein of unknown function DUF418  35.82 
 
 		 385 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.253618  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0190  hypothetical protein  29.69 
 
 		 428 aa  60.8  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.55784  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2299  hypothetical protein  35.07 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383736 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2799  hypothetical protein  31.16 
 
 		 414 aa  59.7  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3286  hypothetical protein  35.07 
 
 		 385 aa  59.7  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.385085  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02081  conserved inner membrane protein  35.07 
 
 		 385 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.452541  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1496  hypothetical protein  35.07 
 
 		 385 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0814  hypothetical protein  35.07 
 
 		 385 aa  59.7  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2860  protein of unknown function DUF418  27.7 
 
 		 415 aa  59.7  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2286  hypothetical protein  35.07 
 
 		 385 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0666  protein of unknown function DUF405  23.81 
 
 		 362 aa  59.3  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000167692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2885  protein of unknown function DUF405  25.82 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.802913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2882  hypothetical protein  31.16 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3043  hypothetical protein  29.41 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4881  hypothetical protein  22.64 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00420784  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1608  hypothetical protein  30.28 
 
 		 430 aa  57.8  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2541  hypothetical protein  34.33 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0379465  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2447  hypothetical protein  34.33 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1661  transport protein  30.28 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.414626  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2383  hypothetical protein  34.33 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.76362 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2427  hypothetical protein  34.33 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.901091 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30910  predicted membrane protein  26.61 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1628  hypothetical protein  28.81 
 
 		 387 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000608067  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4097  hypothetical protein  22.19 
 
 		 399 aa  56.6  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2978  hypothetical protein  30.66 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1671  hypothetical protein  23.42 
 
 		 395 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3566  protein of unknown function DUF418  32.12 
 
 		 459 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.726105 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5273  hypothetical protein  27.93 
 
 		 312 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1538  protein of unknown function DUF405  26.6 
 
 		 406 aa  55.5  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3565  protein of unknown function DUF418  38.1 
 
 		 431 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.708888  normal  0.443247 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2840  hypothetical protein  26.52 
 
 		 414 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.110654 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1203  hypothetical protein  28.06 
 
 		 398 aa  54.7  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0285  protein of unknown function DUF418  23.56 
 
 		 409 aa  53.5  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1888  hypothetical protein  25.22 
 
 		 389 aa  53.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1066  hypothetical protein  30.16 
 
 		 401 aa  52.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0733  protein of unknown function DUF405  29.2 
 
 		 398 aa  52.4  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1942  hypothetical protein  28.24 
 
 		 391 aa  50.4  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.235403  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1198  hypothetical protein  21.43 
 
 		 399 aa  50.1  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3717  hypothetical protein  26.75 
 
 		 387 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1699  hypothetical protein  27.27 
 
 		 387 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3067  hypothetical protein  31.09 
 
 		 404 aa  48.5  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1739  hypothetical protein  27.27 
 
 		 387 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00248027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1450  hypothetical protein  23.85 
 
 		 387 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000207641  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07880  predicted membrane protein  40.54 
 
 		 407 aa  47.4  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2355  protein of unknown function DUF405  27.25 
 
 		 364 aa  47  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1477  hypothetical protein  27.69 
 
 		 387 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.117063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>