88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0035 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0035  hypothetical protein  100 
 
 
402 aa  782    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0984  protein of unknown function DUF418  48.95 
 
 
387 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0392587  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2581  hypothetical protein  41.93 
 
 
388 aa  249  5e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.365833  normal  0.0605789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8135  hypothetical protein  43.22 
 
 
397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026592  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3529  protein of unknown function DUF418  42.07 
 
 
398 aa  242  7e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.296308  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4741  hypothetical protein  41.03 
 
 
392 aa  237  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.400946  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4293  protein of unknown function DUF418  41.33 
 
 
390 aa  209  5e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1670  hypothetical protein  37.56 
 
 
405 aa  203  5e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.704713  normal  0.19338 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1668  protein of unknown function DUF418  37.84 
 
 
420 aa  196  9e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620816  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0072  hypothetical protein  37.72 
 
 
380 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484765  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1415  protein of unknown function DUF405  39.79 
 
 
399 aa  172  5.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.845184  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1461  hypothetical protein  36.18 
 
 
401 aa  172  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2152  hypothetical protein  36.04 
 
 
393 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.391046 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3607  protein of unknown function DUF418  37.75 
 
 
407 aa  169  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.526186  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0505  protein of unknown function DUF418  35.29 
 
 
407 aa  167  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000344824 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3111  protein of unknown function DUF418  38.66 
 
 
443 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414343  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3780  hypothetical protein  36.91 
 
 
401 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0622  hypothetical protein  37.99 
 
 
439 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24880  predicted membrane protein  36.57 
 
 
432 aa  162  9e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0615892  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1416  protein of unknown function DUF405  36.46 
 
 
407 aa  162  9e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.548338  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0719  protein of unknown function DUF418  38.52 
 
 
405 aa  159  8e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.699875  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1078  protein of unknown function DUF418  37.43 
 
 
384 aa  156  6e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1236  hypothetical protein  37.18 
 
 
399 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1063  protein of unknown function DUF405  33.49 
 
 
472 aa  152  8e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4159  hypothetical protein  37.76 
 
 
401 aa  147  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.776458  decreased coverage  0.000152397 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15990  predicted membrane protein  34.85 
 
 
414 aa  135  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.230384 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07880  predicted membrane protein  33.94 
 
 
407 aa  100  5e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2066  protein of unknown function DUF418  25 
 
 
404 aa  85.9  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0837783  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1661  transport protein  25.69 
 
 
430 aa  76.6  0.0000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.414626  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1608  hypothetical protein  25.69 
 
 
430 aa  76.3  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3571  protein of unknown function DUF418  29.9 
 
 
405 aa  69.7  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.983337  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1198  hypothetical protein  22 
 
 
399 aa  68.2  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2885  protein of unknown function DUF405  28.37 
 
 
414 aa  65.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.802913  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1538  protein of unknown function DUF405  27.78 
 
 
406 aa  64.3  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4423  hypothetical protein  25.24 
 
 
417 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00407884  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0285  protein of unknown function DUF418  23.66 
 
 
409 aa  63.5  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3565  protein of unknown function DUF418  23.11 
 
 
431 aa  63.2  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.708888  normal  0.443247 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00200  predicted membrane protein  28.3 
 
 
397 aa  62  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.220914 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2860  protein of unknown function DUF418  26.27 
 
 
415 aa  62  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2327  hypothetical protein  26.33 
 
 
388 aa  62.4  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30910  predicted membrane protein  28.57 
 
 
392 aa  59.3  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1199  hypothetical protein  19.8 
 
 
398 aa  59.3  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01909  transport protein  26.7 
 
 
409 aa  57.4  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.694528  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0455  hypothetical protein  24.88 
 
 
415 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222068  hitchhiker  0.00425561 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2840  hypothetical protein  28.35 
 
 
414 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.110654 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4097  hypothetical protein  22.17 
 
 
399 aa  55.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2305  hypothetical protein  25.6 
 
 
391 aa  55.1  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1942  hypothetical protein  24.43 
 
 
391 aa  53.1  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.235403  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4804  transmembrane protein  22.19 
 
 
312 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000142062  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2882  hypothetical protein  22.01 
 
 
414 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4881  hypothetical protein  21.16 
 
 
390 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00420784  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2115  protein of unknown function DUF418  23.63 
 
 
412 aa  52.4  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1671  hypothetical protein  24.16 
 
 
395 aa  51.2  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1496  hypothetical protein  29.87 
 
 
385 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3286  hypothetical protein  29.22 
 
 
385 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.385085  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3078  hypothetical protein  24.16 
 
 
411 aa  50.4  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3230  hypothetical protein  23.94 
 
 
411 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2404  hypothetical protein  33.85 
 
 
382 aa  50.1  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.334101  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3043  hypothetical protein  23.55 
 
 
382 aa  50.1  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5273  hypothetical protein  21.13 
 
 
312 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3087  hypothetical protein  23.94 
 
 
411 aa  49.7  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2799  hypothetical protein  21.43 
 
 
414 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2286  hypothetical protein  29.22 
 
 
385 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4916  protein of unknown function DUF418  26.32 
 
 
401 aa  49.7  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.511749  normal  0.649012 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0683  protein of unknown function DUF405  22.31 
 
 
387 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2355  protein of unknown function DUF405  37 
 
 
364 aa  48.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1506  protein of unknown function DUF418  28.57 
 
 
385 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.253618  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02081  conserved inner membrane protein  28.57 
 
 
385 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.452541  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1396  hypothetical protein  24.1 
 
 
399 aa  47.8  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2201  hypothetical protein  25.37 
 
 
416 aa  48.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.964455  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3566  protein of unknown function DUF418  29.46 
 
 
459 aa  47.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.726105 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1289  protein of unknown function DUF405  23.66 
 
 
401 aa  47.8  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2299  hypothetical protein  28.57 
 
 
385 aa  47  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383736 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0666  protein of unknown function DUF405  19.73 
 
 
362 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000167692  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1066  hypothetical protein  27.51 
 
 
401 aa  45.8  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0371  hypothetical protein  37.8 
 
 
397 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0814  hypothetical protein  27.92 
 
 
385 aa  44.7  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2447  hypothetical protein  27.92 
 
 
385 aa  44.7  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0252  protein of unknown function DUF405  28.46 
 
 
410 aa  44.3  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0117  membrane protein  30.17 
 
 
381 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000725343  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2338  hypothetical protein  27.52 
 
 
380 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.890901  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2431  hypothetical protein  26.85 
 
 
380 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.503306  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0076  protein of unknown function DUF418  34.15 
 
 
416 aa  43.5  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.477208  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2383  hypothetical protein  32.56 
 
 
380 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.76362 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2427  hypothetical protein  32.56 
 
 
380 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.901091 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2541  hypothetical protein  32.56 
 
 
380 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0379465  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1499  protein of unknown function DUF405  24.62 
 
 
388 aa  43.1  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0190  hypothetical protein  25.93 
 
 
428 aa  43.1  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.55784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>