108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1007 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1007  protein of unknown function DUF405  100 
 
 		 327 aa  619  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.120891  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0609  hypothetical protein  37.27 
 
 		 787 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6573  hypothetical protein  35.44 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00469917  normal  0.0258575 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4858  hypothetical protein  32.45 
 
 		 340 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0379  hypothetical protein  32.33 
 
 		 340 aa  123  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0031  protein of unknown function DUF405  37.03 
 
 		 352 aa  123  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4882  hypothetical protein  34.03 
 
 		 340 aa  123  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4889  hypothetical protein  31.56 
 
 		 340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8802  hypothetical protein  36.84 
 
 		 362 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4868  hypothetical protein  34.03 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4644  hypothetical protein  34.03 
 
 		 340 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4998  hypothetical protein  34.03 
 
 		 340 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4479  membrane spanning protein  33.13 
 
 		 340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4497  membrane spanning protein  30.97 
 
 		 340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5273  hypothetical protein  29.15 
 
 		 312 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4804  transmembrane protein  29.43 
 
 		 312 aa  99  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000142062  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1699  hypothetical protein  27.06 
 
 		 387 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1449  hypothetical protein  26.4 
 
 		 387 aa  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.831542  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1739  hypothetical protein  27.06 
 
 		 387 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00248027  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1663  hypothetical protein  26.4 
 
 		 387 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2517  protein of unknown function DUF418  33.11 
 
 		 307 aa  90.1  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1477  hypothetical protein  26.13 
 
 		 387 aa  89.7  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.117063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1593  hypothetical protein  26.13 
 
 		 387 aa  89.7  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3717  hypothetical protein  25.97 
 
 		 387 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5203  conserved membrane spanning protein  27.51 
 
 		 347 aa  87  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1492  hypothetical protein  25.87 
 
 		 387 aa  86.7  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.512867  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1628  hypothetical protein  25.65 
 
 		 387 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000608067  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0666  protein of unknown function DUF405  25.89 
 
 		 362 aa  77.8  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000167692  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1450  hypothetical protein  27.32 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000207641  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0820  hypothetical protein  29.56 
 
 		 365 aa  75.1  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0117  membrane protein  23.24 
 
 		 381 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000725343  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0179  hypothetical protein  24.46 
 
 		 381 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000571802  hitchhiker  1.74871e-35 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1499  protein of unknown function DUF405  39.29 
 
 		 388 aa  74.3  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4786  hypothetical protein  30.47 
 
 		 406 aa  72  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1198  hypothetical protein  34.41 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0285  protein of unknown function DUF418  36.94 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0015  hypothetical protein  32.37 
 
 		 381 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.428508  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01909  transport protein  36.59 
 
 		 409 aa  65.1  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.694528  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2885  protein of unknown function DUF405  44.44 
 
 		 414 aa  63.2  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.802913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1199  hypothetical protein  31.58 
 
 		 398 aa  62.8  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0683  protein of unknown function DUF405  33.33 
 
 		 387 aa  62.8  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2201  hypothetical protein  41.46 
 
 		 416 aa  62  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.964455  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3571  protein of unknown function DUF418  37.98 
 
 		 405 aa  62  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.983337  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.05 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.037271 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4423  hypothetical protein  32.86 
 
 		 417 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00407884  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1661  transport protein  35.66 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.414626  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1608  hypothetical protein  36.43 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30910  predicted membrane protein  42.71 
 
 		 392 aa  59.7  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0076  protein of unknown function DUF418  37.21 
 
 		 416 aa  59.3  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.477208  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0371  hypothetical protein  38.1 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1396  hypothetical protein  34.78 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2355  protein of unknown function DUF405  37.86 
 
 		 364 aa  57  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0455  hypothetical protein  32.5 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222068  hitchhiker  0.00425561 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1538  protein of unknown function DUF405  24.94 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3565  protein of unknown function DUF418  32.43 
 
 		 431 aa  56.6  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.708888  normal  0.443247 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1818  hypothetical protein  41.18 
 
 		 415 aa  55.8  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1736  protein of unknown function DUF405  38.27 
 
 		 410 aa  55.8  0.0000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.310002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0252  protein of unknown function DUF405  37.84 
 
 		 410 aa  55.8  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0775  hypothetical protein  33.7 
 
 		 401 aa  55.1  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0095945  normal  0.285929 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1304  hypothetical protein  24.21 
 
 		 388 aa  55.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0746  protein of unknown function DUF405  31.2 
 
 		 204 aa  54.7  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.685935 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2978  hypothetical protein  33.04 
 
 		 414 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2860  protein of unknown function DUF418  35.83 
 
 		 415 aa  53.9  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2799  hypothetical protein  32.17 
 
 		 414 aa  53.5  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2840  hypothetical protein  36.7 
 
 		 414 aa  53.5  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.110654 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0178  hypothetical protein  26.79 
 
 		 381 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2882  hypothetical protein  32.48 
 
 		 414 aa  52.8  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3078  hypothetical protein  30.77 
 
 		 411 aa  52.8  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4921  hypothetical protein  27.03 
 
 		 265 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0008351  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4881  hypothetical protein  27.27 
 
 		 390 aa  52.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00420784  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1171  protein of unknown function DUF418  37.11 
 
 		 394 aa  52  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0045  hypothetical protein  27.27 
 
 		 389 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000457904  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3067  hypothetical protein  35.65 
 
 		 404 aa  51.6  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0190  hypothetical protein  34.88 
 
 		 428 aa  52  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.55784  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4860  hypothetical protein  39.62 
 
 		 387 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3087  hypothetical protein  29.91 
 
 		 411 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3230  hypothetical protein  30.77 
 
 		 411 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1289  protein of unknown function DUF405  31.3 
 
 		 401 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4097  hypothetical protein  27.83 
 
 		 399 aa  49.3  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2115  protein of unknown function DUF418  26.42 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0733  protein of unknown function DUF405  32.79 
 
 		 398 aa  48.9  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3566  protein of unknown function DUF418  31.65 
 
 		 459 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.726105 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1203  hypothetical protein  29.57 
 
 		 398 aa  48.1  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3043  hypothetical protein  30.4 
 
 		 382 aa  47.8  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2404  hypothetical protein  31.9 
 
 		 382 aa  47.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.334101  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3286  hypothetical protein  36.25 
 
 		 385 aa  47  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.385085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2066  protein of unknown function DUF418  30.97 
 
 		 404 aa  47  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0837783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2447  hypothetical protein  35.07 
 
 		 385 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1671  hypothetical protein  33.88 
 
 		 395 aa  46.6  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2383  hypothetical protein  34.15 
 
 		 380 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.76362 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2427  hypothetical protein  34.15 
 
 		 380 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.901091 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2338  hypothetical protein  34.15 
 
 		 380 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.890901  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2541  hypothetical protein  34.15 
 
 		 380 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0379465  normal  0.156144 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02081  conserved inner membrane protein  35.07 
 
 		 385 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.452541  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1066  hypothetical protein  29.73 
 
 		 401 aa  45.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2286  hypothetical protein  35.07 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1496  hypothetical protein  35.07 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2299  hypothetical protein  34.52 
 
 		 385 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383736 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0814  hypothetical protein  35.07 
 
 		 385 aa  45.4  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2431  hypothetical protein  32.93 
 
 		 380 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.503306  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>