114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2517 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2517  protein of unknown function DUF418  100 
 
 		 307 aa  571  1.0000000000000001e-162  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8802  hypothetical protein  53.72 
 
 		 362 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0609  hypothetical protein  48.71 
 
 		 787 aa  207  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6573  hypothetical protein  43.96 
 
 		 315 aa  166  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00469917  normal  0.0258575 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0031  protein of unknown function DUF405  39.87 
 
 		 352 aa  151  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4889  hypothetical protein  30.6 
 
 		 340 aa  126  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4882  hypothetical protein  30.6 
 
 		 340 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4858  hypothetical protein  29.97 
 
 		 340 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0379  hypothetical protein  30.09 
 
 		 340 aa  122  8e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4868  hypothetical protein  30.38 
 
 		 340 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4479  membrane spanning protein  30.91 
 
 		 340 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4644  hypothetical protein  30.6 
 
 		 340 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4998  hypothetical protein  30.6 
 
 		 340 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4497  membrane spanning protein  30.6 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1007  protein of unknown function DUF405  33.12 
 
 		 327 aa  90.9  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.120891  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5273  hypothetical protein  25.78 
 
 		 312 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5203  conserved membrane spanning protein  27.24 
 
 		 347 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4804  transmembrane protein  23.24 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000142062  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2860  protein of unknown function DUF418  28.49 
 
 		 415 aa  79.3  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1538  protein of unknown function DUF405  28.06 
 
 		 406 aa  75.1  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0015  hypothetical protein  22.39 
 
 		 381 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.428508  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2752  hypothetical protein  27.98 
 
 		 385 aa  72  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.915358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0683  protein of unknown function DUF405  25.74 
 
 		 387 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1739  hypothetical protein  25.77 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00248027  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1699  hypothetical protein  26.88 
 
 		 387 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1203  hypothetical protein  26.69 
 
 		 398 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1628  hypothetical protein  25.23 
 
 		 387 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000608067  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0666  protein of unknown function DUF405  23.43 
 
 		 362 aa  68.9  0.00000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000167692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0775  hypothetical protein  31.76 
 
 		 401 aa  67  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0095945  normal  0.285929 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3717  hypothetical protein  25.99 
 
 		 387 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1198  hypothetical protein  24.85 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1492  hypothetical protein  27.78 
 
 		 387 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.512867  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0179  hypothetical protein  21.71 
 
 		 381 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000571802  hitchhiker  1.74871e-35 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1289  protein of unknown function DUF405  26.21 
 
 		 401 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0178  hypothetical protein  21.47 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2885  protein of unknown function DUF405  29.41 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.802913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0076  protein of unknown function DUF418  27.73 
 
 		 416 aa  63.9  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.477208  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1199  hypothetical protein  22.19 
 
 		 398 aa  63.5  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4786  hypothetical protein  40.22 
 
 		 406 aa  62  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2383  hypothetical protein  26.39 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.76362 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2427  hypothetical protein  26.39 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.901091 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1818  hypothetical protein  27.63 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0733  protein of unknown function DUF405  28.94 
 
 		 398 aa  59.7  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07880  predicted membrane protein  48.68 
 
 		 407 aa  59.7  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2115  protein of unknown function DUF418  31.82 
 
 		 412 aa  59.7  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0455  hypothetical protein  30.94 
 
 		 415 aa  58.9  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222068  hitchhiker  0.00425561 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1396  hypothetical protein  27.91 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3078  hypothetical protein  24.86 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4916  protein of unknown function DUF418  29.77 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.511749  normal  0.649012 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01909  transport protein  33.71 
 
 		 409 aa  57.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.694528  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1499  protein of unknown function DUF405  34.53 
 
 		 388 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02081  conserved inner membrane protein  32.12 
 
 		 385 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.452541  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1506  protein of unknown function DUF418  32.12 
 
 		 385 aa  57  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.253618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2447  hypothetical protein  32.12 
 
 		 385 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0814  hypothetical protein  32.12 
 
 		 385 aa  57  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3286  hypothetical protein  32.12 
 
 		 385 aa  57  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.385085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2286  hypothetical protein  32.12 
 
 		 385 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2299  hypothetical protein  32.12 
 
 		 385 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383736 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1450  hypothetical protein  36.36 
 
 		 387 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000207641  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4921  hypothetical protein  28.7 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0008351  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4423  hypothetical protein  36.96 
 
 		 417 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00407884  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0820  hypothetical protein  36.36 
 
 		 365 aa  55.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1496  hypothetical protein  32.12 
 
 		 385 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1171  protein of unknown function DUF418  23.81 
 
 		 394 aa  54.7  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00200  predicted membrane protein  28.01 
 
 		 397 aa  54.3  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.220914 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0285  protein of unknown function DUF418  30.28 
 
 		 409 aa  54.3  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30910  predicted membrane protein  31.25 
 
 		 392 aa  53.9  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0045  hypothetical protein  27.78 
 
 		 389 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000457904  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2066  protein of unknown function DUF418  36.56 
 
 		 404 aa  53.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0837783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.4 
 
 		 410 aa  53.1  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.037271 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0746  protein of unknown function DUF405  36.84 
 
 		 204 aa  53.5  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.685935 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1449  hypothetical protein  37.27 
 
 		 387 aa  53.1  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.831542  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4881  hypothetical protein  27.78 
 
 		 390 aa  53.1  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00420784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1663  hypothetical protein  37.27 
 
 		 387 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3566  protein of unknown function DUF418  37.76 
 
 		 459 aa  52.8  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.726105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1888  hypothetical protein  30.23 
 
 		 389 aa  52.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2355  protein of unknown function DUF405  30.7 
 
 		 364 aa  52  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1477  hypothetical protein  36.36 
 
 		 387 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.117063  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1066  hypothetical protein  29.78 
 
 		 401 aa  51.6  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1593  hypothetical protein  36.36 
 
 		 387 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2152  hypothetical protein  29.79 
 
 		 393 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.391046 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4860  hypothetical protein  34.32 
 
 		 387 aa  51.6  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1561  hypothetical protein  30.77 
 
 		 393 aa  51.6  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2567  hypothetical protein  31.01 
 
 		 388 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1608  hypothetical protein  39.17 
 
 		 430 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2469  hypothetical protein  31.01 
 
 		 388 aa  50.8  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1304  hypothetical protein  33.9 
 
 		 388 aa  50.4  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1942  hypothetical protein  42.65 
 
 		 391 aa  50.4  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.235403  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0117  membrane protein  28.28 
 
 		 381 aa  49.7  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000725343  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1671  hypothetical protein  44.12 
 
 		 395 aa  49.7  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2290  protein of unknown function DUF405  25.65 
 
 		 391 aa  49.7  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.578329  normal  0.0235381 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1661  transport protein  38.32 
 
 		 430 aa  49.3  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.414626  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2431  hypothetical protein  40.79 
 
 		 380 aa  49.3  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.503306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2338  hypothetical protein  40.79 
 
 		 380 aa  49.3  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.890901  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2541  hypothetical protein  40.79 
 
 		 380 aa  49.3  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0379465  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0371  hypothetical protein  32.64 
 
 		 397 aa  48.5  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0505  protein of unknown function DUF418  39.29 
 
 		 407 aa  47.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000344824 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1416  protein of unknown function DUF405  35.23 
 
 		 407 aa  47.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.548338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3087  hypothetical protein  31.06 
 
 		 411 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3230  hypothetical protein  31.06 
 
 		 411 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>