49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4134 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4134  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  479  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2013  hypothetical protein  41.77 
 
 		 326 aa  170  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.777902  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1035  hypothetical protein  41.63 
 
 		 365 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138536  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1178  hypothetical protein  42.13 
 
 		 328 aa  161  8.000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0102548  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2615  hypothetical protein  40.95 
 
 		 322 aa  161  9e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130361  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1137  hypothetical protein  41.82 
 
 		 298 aa  148  9e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0118905  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1261  hypothetical protein  40.93 
 
 		 335 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1871  hypothetical protein  38.96 
 
 		 263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0219449 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2067  protein of unknown function DUF1624  36.95 
 
 		 329 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1864  protein of unknown function DUF1624  34.77 
 
 		 329 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161953  normal  0.0500445 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1538  hypothetical protein  33.2 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00890695  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1837  hypothetical protein  29.31 
 
 		 258 aa  109  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00327  hypothetical protein  33.47 
 
 		 232 aa  108  6e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0143  hypothetical protein  29.71 
 
 		 253 aa  106  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1672  hypothetical protein  31.25 
 
 		 256 aa  105  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3195  protein of unknown function DUF1624  38.32 
 
 		 328 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.856715 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3006  hypothetical protein  38.32 
 
 		 328 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.166518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3231  protein of unknown function DUF1624  40 
 
 		 328 aa  102  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.356551 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2737  hypothetical protein  37.05 
 
 		 339 aa  102  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.891818 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2032  protein of unknown function DUF1624  29.8 
 
 		 256 aa  102  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1883  protein of unknown function DUF1624  36.75 
 
 		 334 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2413  hypothetical protein  30.2 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.248574  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0347  hypothetical protein  35.18 
 
 		 245 aa  99.4  5e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000605459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2952  hypothetical protein  30.04 
 
 		 264 aa  99.4  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1762  hypothetical protein  31.47 
 
 		 243 aa  97.8  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.175449 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1829  hypothetical protein  29.05 
 
 		 244 aa  98.2  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.390473 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0080  protein of unknown function DUF1624  31.49 
 
 		 237 aa  97.4  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000683778  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0665  hypothetical protein  26.02 
 
 		 245 aa  94.4  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.646627  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1147  hypothetical protein  28.87 
 
 		 254 aa  94.4  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1385  hypothetical protein  27.24 
 
 		 245 aa  90.9  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1683  hypothetical protein  30.17 
 
 		 246 aa  90.1  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1820  protein of unknown function DUF1624  29.8 
 
 		 261 aa  88.6  9e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1291  hypothetical protein  26.02 
 
 		 245 aa  88.2  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.687522 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0043  hypothetical protein  34.17 
 
 		 263 aa  87.8  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0429  hypothetical protein  31.11 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000311918  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2070  protein of unknown function DUF1624  30.17 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.250094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2995  hypothetical protein  29.96 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.961096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0098  hypothetical protein  31.09 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1793  hypothetical protein  28.57 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1588  hypothetical protein  26.1 
 
 		 270 aa  62  0.000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000117869  hitchhiker  0.00161321 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1589  hypothetical protein  28.28 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000654588  hitchhiker  0.00067208 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0771  protein of unknown function DUF1624  28 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.627513  normal  0.29852 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1587  hypothetical protein  27.31 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000110361  hitchhiker  0.00369303 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0380  hypothetical protein  37.78 
 
 		 336 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.421494 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0097  hypothetical protein  23.91 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1906  hypothetical protein  28.7 
 
 		 382 aa  48.9  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1635  hypothetical protein  28.7 
 
 		 382 aa  46.2  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.684419  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1720  transport protein  29.56 
 
 		 344 aa  44.3  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4326  hypothetical protein  29.8 
 
 		 368 aa  43.5  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>