32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_09280 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_09280  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  609  1e-173  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1452  protein of unknown function DUF1624  35.02 
 
 		 411 aa  135  9e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1450  hypothetical protein  33.92 
 
 		 411 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2244  hypothetical protein  37.25 
 
 		 450 aa  122  9e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3252  hypothetical protein  41.15 
 
 		 432 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3181  hypothetical protein  41.63 
 
 		 371 aa  108  9.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0333  hypothetical protein  36.12 
 
 		 538 aa  107  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.115307 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2368  hypothetical protein  38.89 
 
 		 402 aa  105  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20080  predicted membrane protein  35.23 
 
 		 450 aa  105  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0149559 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1560  hypothetical protein  39.02 
 
 		 382 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214975  normal  0.807756 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1542  hypothetical protein  30.49 
 
 		 445 aa  97.4  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170969  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2675  hypothetical protein  31.7 
 
 		 434 aa  97.1  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2673  hypothetical protein  33.33 
 
 		 434 aa  96.7  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.277255 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3325  hypothetical protein  41.04 
 
 		 402 aa  96.3  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0514676  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3869  hypothetical protein  40.58 
 
 		 385 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0435346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3077  hypothetical protein  36.82 
 
 		 404 aa  90.1  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1481  hypothetical protein  41.87 
 
 		 378 aa  89  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.526682  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06780  hypothetical protein  36.25 
 
 		 412 aa  82.4  0.000000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36310  hypothetical protein  36.25 
 
 		 427 aa  74.3  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.740551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4532  transport protein  32.74 
 
 		 354 aa  73.6  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07140  predicted membrane protein  36.7 
 
 		 423 aa  73.2  0.000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.125251  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0644  hypothetical protein  37.16 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.353612  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18000  hypothetical protein  30.08 
 
 		 405 aa  65.9  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.514365  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0991  hypothetical protein  30.38 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1720  transport protein  31.6 
 
 		 344 aa  63.9  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2187  hypothetical protein  30.33 
 
 		 361 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1197  hypothetical protein  33.98 
 
 		 386 aa  58.9  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.673489  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2015  hypothetical protein  30.36 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0652327  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0017  hypothetical protein  28 
 
 		 374 aa  56.2  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0858  hypothetical protein  32.02 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.581256  normal  0.122318 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0347  hypothetical protein  28.85 
 
 		 245 aa  45.8  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000605459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0143  hypothetical protein  27.4 
 
 		 253 aa  44.3  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>