30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3077 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3077  hypothetical protein  100 
 
 		 404 aa  765    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1452  protein of unknown function DUF1624  38.01 
 
 		 411 aa  190  4e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1450  hypothetical protein  41.28 
 
 		 411 aa  177  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2244  hypothetical protein  37.36 
 
 		 450 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3252  hypothetical protein  36.61 
 
 		 432 aa  166  8e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3869  hypothetical protein  39.21 
 
 		 385 aa  164  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0435346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1542  hypothetical protein  37.44 
 
 		 445 aa  146  6e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170969  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1481  hypothetical protein  40.82 
 
 		 378 aa  144  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.526682  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3181  hypothetical protein  37.31 
 
 		 371 aa  143  6e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2368  hypothetical protein  37.57 
 
 		 402 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0644  hypothetical protein  38.23 
 
 		 412 aa  138  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.353612  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0858  hypothetical protein  40.94 
 
 		 394 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.581256  normal  0.122318 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1560  hypothetical protein  36.9 
 
 		 382 aa  138  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214975  normal  0.807756 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2675  hypothetical protein  33.25 
 
 		 434 aa  132  7.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20080  predicted membrane protein  37.06 
 
 		 450 aa  132  7.999999999999999e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0149559 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09280  hypothetical protein  36.82 
 
 		 313 aa  117  3.9999999999999997e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2673  hypothetical protein  38.6 
 
 		 434 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.277255 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0991  hypothetical protein  33.77 
 
 		 362 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0333  hypothetical protein  36.45 
 
 		 538 aa  94.4  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.115307 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1197  hypothetical protein  33.7 
 
 		 386 aa  92.8  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.673489  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36310  hypothetical protein  33.8 
 
 		 427 aa  91.7  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.740551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2015  hypothetical protein  24.73 
 
 		 361 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0652327  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0017  hypothetical protein  27.85 
 
 		 374 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06780  hypothetical protein  38.89 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2187  hypothetical protein  24.88 
 
 		 361 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07140  predicted membrane protein  34.79 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.125251  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18000  hypothetical protein  29.43 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.514365  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4532  transport protein  28.94 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1720  transport protein  29.24 
 
 		 344 aa  60.8  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12320  hypothetical protein  30.4 
 
 		 346 aa  43.9  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.144184  normal  0.326836 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>