32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1560 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1560  hypothetical protein  100 
 
 		 382 aa  727    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214975  normal  0.807756 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1197  hypothetical protein  44.86 
 
 		 386 aa  179  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.673489  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2368  hypothetical protein  42.7 
 
 		 402 aa  176  7e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3181  hypothetical protein  42.12 
 
 		 371 aa  175  9e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3252  hypothetical protein  37.68 
 
 		 432 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2244  hypothetical protein  34.45 
 
 		 450 aa  147  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2675  hypothetical protein  32.83 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1542  hypothetical protein  35.75 
 
 		 445 aa  135  9e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170969  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3325  hypothetical protein  35.28 
 
 		 402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0514676  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1452  protein of unknown function DUF1624  32.13 
 
 		 411 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3077  hypothetical protein  37.09 
 
 		 404 aa  119  9e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0991  hypothetical protein  33.24 
 
 		 362 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0333  hypothetical protein  39.09 
 
 		 538 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.115307 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09280  hypothetical protein  39.02 
 
 		 313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1450  hypothetical protein  35.65 
 
 		 411 aa  106  8e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07140  predicted membrane protein  35.23 
 
 		 423 aa  103  5e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.125251  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0644  hypothetical protein  37.24 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.353612  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1481  hypothetical protein  34.41 
 
 		 378 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.526682  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2673  hypothetical protein  36.06 
 
 		 434 aa  100  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.277255 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4532  transport protein  32.12 
 
 		 354 aa  92  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36310  hypothetical protein  30.85 
 
 		 427 aa  80.9  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.740551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3869  hypothetical protein  32 
 
 		 385 aa  80.1  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0435346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20080  predicted membrane protein  37.68 
 
 		 450 aa  79.3  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0149559 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2187  hypothetical protein  25.61 
 
 		 361 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2015  hypothetical protein  24.87 
 
 		 361 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0652327  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06780  hypothetical protein  39.61 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18000  hypothetical protein  31.38 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.514365  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0017  hypothetical protein  25 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0858  hypothetical protein  31.38 
 
 		 394 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.581256  normal  0.122318 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1720  transport protein  27.27 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0666  protein of unknown function DUF405  23.32 
 
 		 362 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000167692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12320  hypothetical protein  31.83 
 
 		 346 aa  43.5  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.144184  normal  0.326836 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>