49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0347 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0347  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  470  1e-132  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000605459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1683  hypothetical protein  38.84 
 
 		 246 aa  145  5e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1820  protein of unknown function DUF1624  38.62 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1538  hypothetical protein  37.7 
 
 		 249 aa  137  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00890695  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1147  hypothetical protein  36.86 
 
 		 254 aa  136  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0665  hypothetical protein  34.02 
 
 		 245 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.646627  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0143  hypothetical protein  34.26 
 
 		 253 aa  133  3e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1385  hypothetical protein  33.2 
 
 		 245 aa  123  3e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0043  hypothetical protein  35.74 
 
 		 263 aa  118  9e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1291  hypothetical protein  34.84 
 
 		 245 aa  112  6e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.687522 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0429  hypothetical protein  33.77 
 
 		 229 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000311918  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2070  protein of unknown function DUF1624  32.24 
 
 		 235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.250094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1588  hypothetical protein  32.95 
 
 		 270 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000117869  hitchhiker  0.00161321 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0080  protein of unknown function DUF1624  32 
 
 		 237 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000683778  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0098  hypothetical protein  36.65 
 
 		 244 aa  105  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1587  hypothetical protein  34.9 
 
 		 277 aa  102  4e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000110361  hitchhiker  0.00369303 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1589  hypothetical protein  33.61 
 
 		 264 aa  103  4e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000654588  hitchhiker  0.00067208 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4134  hypothetical protein  35.18 
 
 		 244 aa  99.4  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1178  hypothetical protein  32.31 
 
 		 328 aa  94.7  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0102548  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0097  hypothetical protein  31.12 
 
 		 254 aa  94.7  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2013  hypothetical protein  32.24 
 
 		 326 aa  94  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.777902  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00327  hypothetical protein  31.4 
 
 		 232 aa  93.2  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1793  hypothetical protein  32.22 
 
 		 234 aa  90.9  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2032  protein of unknown function DUF1624  30.74 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1672  hypothetical protein  31.13 
 
 		 256 aa  89.4  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1035  hypothetical protein  28.74 
 
 		 365 aa  85.9  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1261  hypothetical protein  33.73 
 
 		 335 aa  84.3  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2615  hypothetical protein  29.27 
 
 		 322 aa  84  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130361  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1837  hypothetical protein  27.43 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1137  hypothetical protein  30.61 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0118905  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2413  hypothetical protein  25.59 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.248574  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1871  hypothetical protein  30 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0219449 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1762  hypothetical protein  29.51 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.175449 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2067  protein of unknown function DUF1624  28.69 
 
 		 329 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1883  protein of unknown function DUF1624  33.61 
 
 		 334 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3006  hypothetical protein  33.76 
 
 		 328 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.166518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1829  hypothetical protein  28.41 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.390473 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2952  hypothetical protein  25.59 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3231  protein of unknown function DUF1624  33.12 
 
 		 328 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.356551 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1864  protein of unknown function DUF1624  31.1 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161953  normal  0.0500445 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2995  hypothetical protein  30 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.961096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2737  hypothetical protein  32.89 
 
 		 339 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.891818 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3195  protein of unknown function DUF1624  32.52 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.856715 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1452  protein of unknown function DUF1624  30.77 
 
 		 411 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09280  hypothetical protein  28.85 
 
 		 313 aa  45.8  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1450  hypothetical protein  27.64 
 
 		 411 aa  45.8  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1006  hypothetical protein  27.31 
 
 		 355 aa  43.5  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.43971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1365  hypothetical protein  24.53 
 
 		 382 aa  43.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0771  protein of unknown function DUF1624  26.12 
 
 		 254 aa  42  0.009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.627513  normal  0.29852 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>