50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0980 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1157  hypothetical protein  87.27 
 
 		 388 aa  654    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0984  hypothetical protein  95.01 
 
 		 401 aa  730    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1045  hypothetical protein  96.51 
 
 		 401 aa  726    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062609 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0980  hypothetical protein  100 
 
 		 401 aa  800    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.260122 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3464  hypothetical protein  76.25 
 
 		 424 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0282982 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1081  protein of unknown function DUF1624  76.5 
 
 		 428 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147779 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3286  hypothetical protein  75.75 
 
 		 426 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3328  hypothetical protein  74.5 
 
 		 437 aa  568  1e-161  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.853201  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2880  hypothetical protein  74.16 
 
 		 418 aa  569  1e-161  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2580  hypothetical protein  49.63 
 
 		 388 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1930  hypothetical protein  52.76 
 
 		 388 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0332469 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2271  hypothetical protein  51.05 
 
 		 388 aa  339  4e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.188325  normal  0.105142 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3280  hypothetical protein  50.12 
 
 		 407 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515764  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1906  hypothetical protein  49.48 
 
 		 382 aa  329  4e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2951  hypothetical protein  47.55 
 
 		 402 aa  316  6e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1365  hypothetical protein  52.32 
 
 		 382 aa  315  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5189  hypothetical protein  51.17 
 
 		 429 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1635  hypothetical protein  49.61 
 
 		 382 aa  311  1e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.684419  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2059  hypothetical protein  51.26 
 
 		 388 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.453169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3276  hypothetical protein  52.26 
 
 		 388 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1866  hypothetical protein  50.26 
 
 		 405 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.574386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5557  hypothetical protein  54.86 
 
 		 384 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2419  hypothetical protein  51.51 
 
 		 421 aa  299  5e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.539289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1089  protein of unknown function DUF1624  50 
 
 		 382 aa  299  6e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1201  hypothetical protein  47.03 
 
 		 398 aa  298  1e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.592526  normal  0.119748 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2728  hypothetical protein  47.41 
 
 		 382 aa  296  4e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3696  membrane protein-like protein  46.52 
 
 		 397 aa  295  8e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643247  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63970  hypothetical protein  53.35 
 
 		 384 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.989357 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3138  protein of unknown function DUF1624  46.82 
 
 		 387 aa  256  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1140  protein of unknown function DUF1624  50.61 
 
 		 385 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.983502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2111  hypothetical protein  48.44 
 
 		 392 aa  246  6e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5634  hypothetical protein  37.19 
 
 		 401 aa  231  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0519757  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2897  hypothetical protein  38.04 
 
 		 390 aa  217  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.905704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1300  hypothetical protein  37.06 
 
 		 388 aa  211  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5717  hypothetical protein  34.92 
 
 		 398 aa  210  4e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3906  hypothetical protein  36.39 
 
 		 414 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576525  normal  0.126212 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1726  hypothetical protein  37.32 
 
 		 408 aa  199  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1535  hypothetical protein  40.41 
 
 		 398 aa  188  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000132608  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0289  membrane protein  35.61 
 
 		 399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3048  hypothetical protein  40.6 
 
 		 440 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.634245  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0666  hypothetical protein  37.46 
 
 		 388 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3588  hypothetical protein  31.67 
 
 		 407 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0967112  normal  0.500812 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2213  hypothetical protein  33.23 
 
 		 392 aa  145  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.321622  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0458  hypothetical protein  29.08 
 
 		 375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0903662  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1471  hypothetical protein  28.85 
 
 		 383 aa  92.8  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.430676  normal  0.785937 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4226  membrane protein-like protein  24.94 
 
 		 389 aa  84  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0794  membrane protein-like protein  25.73 
 
 		 388 aa  76.6  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.13785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0455  membrane protein-like protein  26.73 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.741716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1588  hypothetical protein  27.02 
 
 		 270 aa  47.4  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000117869  hitchhiker  0.00161321 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1683  hypothetical protein  26.09 
 
 		 246 aa  43.9  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>