45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1471 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1471  hypothetical protein  100 
 
 		 383 aa  747    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.430676  normal  0.785937 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1157  hypothetical protein  29.77 
 
 		 388 aa  94.4  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3048  hypothetical protein  31.65 
 
 		 440 aa  92  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.634245  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0458  hypothetical protein  25.19 
 
 		 375 aa  90.1  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0903662  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1045  hypothetical protein  29.28 
 
 		 401 aa  86.3  9e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062609 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0984  hypothetical protein  29.57 
 
 		 401 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0980  hypothetical protein  28.99 
 
 		 401 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.260122 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1081  protein of unknown function DUF1624  28.98 
 
 		 428 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147779 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2897  hypothetical protein  27.51 
 
 		 390 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.905704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2271  hypothetical protein  26.65 
 
 		 388 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.188325  normal  0.105142 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2580  hypothetical protein  27.59 
 
 		 388 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5634  hypothetical protein  27.75 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0519757  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3286  hypothetical protein  28.98 
 
 		 426 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1535  hypothetical protein  28.49 
 
 		 398 aa  80.9  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000132608  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3464  hypothetical protein  29.01 
 
 		 424 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0282982 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0666  hypothetical protein  27.97 
 
 		 388 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2880  hypothetical protein  28.53 
 
 		 418 aa  77  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3588  hypothetical protein  28.24 
 
 		 407 aa  76.6  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0967112  normal  0.500812 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3328  hypothetical protein  28.48 
 
 		 437 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.853201  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0455  membrane protein-like protein  29 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.741716  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2728  hypothetical protein  30.38 
 
 		 382 aa  73.2  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1201  hypothetical protein  30.86 
 
 		 398 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.592526  normal  0.119748 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1365  hypothetical protein  29.01 
 
 		 382 aa  72.4  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5717  hypothetical protein  25 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1906  hypothetical protein  26.8 
 
 		 382 aa  70.1  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1866  hypothetical protein  29.24 
 
 		 405 aa  69.3  0.00000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.574386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3280  hypothetical protein  28.19 
 
 		 407 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515764  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2951  hypothetical protein  25.8 
 
 		 402 aa  68.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4226  membrane protein-like protein  27.14 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1726  hypothetical protein  25.68 
 
 		 408 aa  67  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1635  hypothetical protein  28.82 
 
 		 382 aa  66.6  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.684419  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3696  membrane protein-like protein  30.46 
 
 		 397 aa  65.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643247  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1140  protein of unknown function DUF1624  30.65 
 
 		 385 aa  62  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.983502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5189  hypothetical protein  27.63 
 
 		 429 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1930  hypothetical protein  26.67 
 
 		 388 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0332469 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2059  hypothetical protein  26.39 
 
 		 388 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.453169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3138  protein of unknown function DUF1624  29.47 
 
 		 387 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3906  hypothetical protein  24.05 
 
 		 414 aa  53.9  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576525  normal  0.126212 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0289  membrane protein  24.93 
 
 		 399 aa  51.6  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5557  hypothetical protein  28.06 
 
 		 384 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1089  protein of unknown function DUF1624  28.33 
 
 		 382 aa  48.9  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0794  membrane protein-like protein  26.98 
 
 		 388 aa  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.13785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3276  hypothetical protein  26.04 
 
 		 388 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1300  hypothetical protein  25.29 
 
 		 388 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63970  hypothetical protein  27.22 
 
 		 384 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.989357 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>