48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0455 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0455  membrane protein-like protein  100 
 
 		 389 aa  761    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.741716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4226  membrane protein-like protein  80.72 
 
 		 389 aa  621  1e-177  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0794  membrane protein-like protein  55.08 
 
 		 388 aa  375  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.13785  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0458  hypothetical protein  27.69 
 
 		 375 aa  118  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0903662  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2271  hypothetical protein  28.85 
 
 		 388 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.188325  normal  0.105142 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2580  hypothetical protein  29.32 
 
 		 388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3280  hypothetical protein  28.99 
 
 		 407 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515764  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3696  membrane protein-like protein  28.3 
 
 		 397 aa  103  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643247  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1906  hypothetical protein  28.24 
 
 		 382 aa  102  8e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3048  hypothetical protein  30.61 
 
 		 440 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.634245  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2951  hypothetical protein  26.42 
 
 		 402 aa  94  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3906  hypothetical protein  28.11 
 
 		 414 aa  91.3  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576525  normal  0.126212 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1201  hypothetical protein  29.6 
 
 		 398 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.592526  normal  0.119748 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1866  hypothetical protein  30.87 
 
 		 405 aa  90.9  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.574386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1365  hypothetical protein  31.53 
 
 		 382 aa  90.1  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5634  hypothetical protein  27.41 
 
 		 401 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0519757  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0666  hypothetical protein  29.28 
 
 		 388 aa  87.4  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2897  hypothetical protein  24.92 
 
 		 390 aa  86.7  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.905704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5717  hypothetical protein  26.27 
 
 		 398 aa  84.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1635  hypothetical protein  29.61 
 
 		 382 aa  84.7  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.684419  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1471  hypothetical protein  29.15 
 
 		 383 aa  84.7  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.430676  normal  0.785937 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1157  hypothetical protein  28.12 
 
 		 388 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1726  hypothetical protein  24.75 
 
 		 408 aa  82.8  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1535  hypothetical protein  27.84 
 
 		 398 aa  81.3  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000132608  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5189  hypothetical protein  26.89 
 
 		 429 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1930  hypothetical protein  26.81 
 
 		 388 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0332469 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2728  hypothetical protein  27.98 
 
 		 382 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2213  hypothetical protein  25.99 
 
 		 392 aa  73.2  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.321622  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1300  hypothetical protein  27.8 
 
 		 388 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1140  protein of unknown function DUF1624  28.83 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.983502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2059  hypothetical protein  26.84 
 
 		 388 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.453169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2111  hypothetical protein  29.32 
 
 		 392 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3138  protein of unknown function DUF1624  29.7 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3588  hypothetical protein  23.17 
 
 		 407 aa  70.5  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0967112  normal  0.500812 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3286  hypothetical protein  26.17 
 
 		 426 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3464  hypothetical protein  25.06 
 
 		 424 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0282982 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0980  hypothetical protein  25.99 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.260122 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0984  hypothetical protein  25.25 
 
 		 401 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3328  hypothetical protein  24.45 
 
 		 437 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.853201  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1081  protein of unknown function DUF1624  25.31 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3276  hypothetical protein  25.99 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1045  hypothetical protein  27.48 
 
 		 401 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062609 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1089  protein of unknown function DUF1624  30.93 
 
 		 382 aa  63.5  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2880  hypothetical protein  24.21 
 
 		 418 aa  60.5  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2419  hypothetical protein  26.33 
 
 		 421 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.539289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0289  membrane protein  25 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63970  hypothetical protein  30.24 
 
 		 384 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.989357 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5557  hypothetical protein  30.28 
 
 		 384 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>