52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1157 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1157  hypothetical protein  100 
 
 		 388 aa  775    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0984  hypothetical protein  86.6 
 
 		 401 aa  654    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0980  hypothetical protein  87.27 
 
 		 401 aa  651    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.260122 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1045  hypothetical protein  86.82 
 
 		 401 aa  635    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062609 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3464  hypothetical protein  75.89 
 
 		 424 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0282982 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1081  protein of unknown function DUF1624  75.89 
 
 		 428 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147779 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3286  hypothetical protein  75.38 
 
 		 426 aa  567  1e-161  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3328  hypothetical protein  74.37 
 
 		 437 aa  564  1e-160  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.853201  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2880  hypothetical protein  74.56 
 
 		 418 aa  556  1e-157  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2580  hypothetical protein  50.9 
 
 		 388 aa  359  4e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2271  hypothetical protein  51.29 
 
 		 388 aa  358  7e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.188325  normal  0.105142 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1930  hypothetical protein  52.88 
 
 		 388 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0332469 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3280  hypothetical protein  51.79 
 
 		 407 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515764  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1906  hypothetical protein  49.74 
 
 		 382 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5189  hypothetical protein  51.15 
 
 		 429 aa  324  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2059  hypothetical protein  53.66 
 
 		 388 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.453169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1365  hypothetical protein  52.33 
 
 		 382 aa  322  5e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2951  hypothetical protein  48.58 
 
 		 402 aa  317  2e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1866  hypothetical protein  50.26 
 
 		 405 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.574386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1635  hypothetical protein  47.91 
 
 		 382 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.684419  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5557  hypothetical protein  54.59 
 
 		 384 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3276  hypothetical protein  52.88 
 
 		 388 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2728  hypothetical protein  46.11 
 
 		 382 aa  305  7e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1089  protein of unknown function DUF1624  49.87 
 
 		 382 aa  304  1.0000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3696  membrane protein-like protein  47.72 
 
 		 397 aa  300  2e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643247  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2419  hypothetical protein  51.83 
 
 		 421 aa  298  7e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.539289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63970  hypothetical protein  53.93 
 
 		 384 aa  292  7e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.989357 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1201  hypothetical protein  47.53 
 
 		 398 aa  291  1e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.592526  normal  0.119748 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3138  protein of unknown function DUF1624  51.1 
 
 		 387 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1140  protein of unknown function DUF1624  50.77 
 
 		 385 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.983502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2111  hypothetical protein  52.55 
 
 		 392 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5634  hypothetical protein  37.8 
 
 		 401 aa  245  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0519757  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2897  hypothetical protein  39.04 
 
 		 390 aa  224  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.905704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5717  hypothetical protein  35.84 
 
 		 398 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1300  hypothetical protein  36.96 
 
 		 388 aa  214  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3906  hypothetical protein  36.88 
 
 		 414 aa  212  7e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576525  normal  0.126212 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1726  hypothetical protein  35.49 
 
 		 408 aa  199  9e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1535  hypothetical protein  42.9 
 
 		 398 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000132608  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0289  membrane protein  36.31 
 
 		 399 aa  182  9.000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0666  hypothetical protein  37.39 
 
 		 388 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3588  hypothetical protein  34.79 
 
 		 407 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0967112  normal  0.500812 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3048  hypothetical protein  39.35 
 
 		 440 aa  179  9e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.634245  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2213  hypothetical protein  32.17 
 
 		 392 aa  158  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.321622  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0458  hypothetical protein  28.86 
 
 		 375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0903662  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1471  hypothetical protein  29.58 
 
 		 383 aa  98.6  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.430676  normal  0.785937 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0794  membrane protein-like protein  27.07 
 
 		 388 aa  87.4  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.13785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4226  membrane protein-like protein  26.87 
 
 		 389 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0455  membrane protein-like protein  28.61 
 
 		 389 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.741716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1588  hypothetical protein  27.85 
 
 		 270 aa  48.1  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000117869  hitchhiker  0.00161321 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1793  hypothetical protein  23.85 
 
 		 234 aa  43.5  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0097  hypothetical protein  24.34 
 
 		 254 aa  43.5  0.007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1683  hypothetical protein  23.85 
 
 		 246 aa  43.1  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>