49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2111 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2111  hypothetical protein  100 
 
 
392 aa  746    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1201  hypothetical protein  70.54 
 
 
398 aa  473  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.592526  normal  0.119748 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3138  protein of unknown function DUF1624  74.6 
 
 
387 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1140  protein of unknown function DUF1624  73.54 
 
 
385 aa  450  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.983502  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2580  hypothetical protein  51.3 
 
 
388 aa  345  6e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2271  hypothetical protein  52.45 
 
 
388 aa  344  1e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.188325  normal  0.105142 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3280  hypothetical protein  52.62 
 
 
407 aa  334  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515764  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2951  hypothetical protein  51.87 
 
 
402 aa  332  9e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2728  hypothetical protein  59.93 
 
 
382 aa  330  2e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1930  hypothetical protein  53.52 
 
 
388 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0332469 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1906  hypothetical protein  49.59 
 
 
382 aa  325  8.000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1365  hypothetical protein  57.75 
 
 
382 aa  320  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1866  hypothetical protein  55.01 
 
 
405 aa  316  4e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.574386  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2059  hypothetical protein  52.34 
 
 
388 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.453169  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3276  hypothetical protein  53.12 
 
 
388 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5189  hypothetical protein  53.93 
 
 
429 aa  300  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1635  hypothetical protein  49.04 
 
 
382 aa  293  5e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.684419  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2419  hypothetical protein  52.49 
 
 
421 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.539289  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1157  hypothetical protein  52.38 
 
 
388 aa  290  3e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1089  protein of unknown function DUF1624  55.31 
 
 
382 aa  289  5.0000000000000004e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3696  membrane protein-like protein  50 
 
 
397 aa  284  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643247  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1045  hypothetical protein  50.6 
 
 
401 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0062609 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3286  hypothetical protein  45.38 
 
 
426 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3464  hypothetical protein  45.64 
 
 
424 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0282982 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0984  hypothetical protein  50.3 
 
 
401 aa  277  3e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2880  hypothetical protein  44.1 
 
 
418 aa  276  4e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1081  protein of unknown function DUF1624  45.38 
 
 
428 aa  275  8e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147779 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3328  hypothetical protein  45.18 
 
 
437 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.853201  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0980  hypothetical protein  51.66 
 
 
401 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.260122 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5557  hypothetical protein  59.55 
 
 
384 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63970  hypothetical protein  55.16 
 
 
384 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.989357 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5634  hypothetical protein  41.74 
 
 
401 aa  262  8e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0519757  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5717  hypothetical protein  38.19 
 
 
398 aa  233  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3906  hypothetical protein  40.83 
 
 
414 aa  224  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576525  normal  0.126212 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1726  hypothetical protein  38.06 
 
 
408 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1300  hypothetical protein  38.66 
 
 
388 aa  210  4e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2897  hypothetical protein  40 
 
 
390 aa  209  9e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.905704  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0289  membrane protein  40.45 
 
 
399 aa  207  3e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1535  hypothetical protein  40.51 
 
 
398 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000132608  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3588  hypothetical protein  39.52 
 
 
407 aa  182  8.000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0967112  normal  0.500812 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0666  hypothetical protein  38.28 
 
 
388 aa  180  4e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3048  hypothetical protein  39.65 
 
 
440 aa  179  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.634245  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2213  hypothetical protein  33.24 
 
 
392 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.321622  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0458  hypothetical protein  30.64 
 
 
375 aa  119  7.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0903662  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0455  membrane protein-like protein  27.85 
 
 
389 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.741716  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4226  membrane protein-like protein  27.19 
 
 
389 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0794  membrane protein-like protein  27.3 
 
 
388 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.13785  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1471  hypothetical protein  31.61 
 
 
383 aa  68.9  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.430676  normal  0.785937 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1006  hypothetical protein  26.61 
 
 
355 aa  49.3  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.43971  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>