48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0794 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0794  membrane protein-like protein  100 
 
 
388 aa  764    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.13785  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4226  membrane protein-like protein  53.93 
 
 
389 aa  386  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0455  membrane protein-like protein  55.08 
 
 
389 aa  355  5.999999999999999e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.741716  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3048  hypothetical protein  29.01 
 
 
440 aa  99  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.634245  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0458  hypothetical protein  28.21 
 
 
375 aa  96.3  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0903662  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2897  hypothetical protein  26.11 
 
 
390 aa  94.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.905704  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1906  hypothetical protein  28.21 
 
 
382 aa  89  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2580  hypothetical protein  25.83 
 
 
388 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0666  hypothetical protein  29.33 
 
 
388 aa  86.7  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5634  hypothetical protein  26.72 
 
 
401 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0519757  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2951  hypothetical protein  28.29 
 
 
402 aa  84  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1866  hypothetical protein  29.39 
 
 
405 aa  83.6  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.574386  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3696  membrane protein-like protein  25.93 
 
 
397 aa  83.2  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643247  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2271  hypothetical protein  25.78 
 
 
388 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.188325  normal  0.105142 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1300  hypothetical protein  29.19 
 
 
388 aa  80.5  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2728  hypothetical protein  27.6 
 
 
382 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1157  hypothetical protein  27.19 
 
 
388 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1201  hypothetical protein  28.81 
 
 
398 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.592526  normal  0.119748 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1726  hypothetical protein  24.64 
 
 
408 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1635  hypothetical protein  27.76 
 
 
382 aa  74.3  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.684419  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3588  hypothetical protein  23.35 
 
 
407 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0967112  normal  0.500812 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1089  protein of unknown function DUF1624  29.07 
 
 
382 aa  74.7  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0984  hypothetical protein  26.03 
 
 
401 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2213  hypothetical protein  25.61 
 
 
392 aa  71.6  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.321622  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2880  hypothetical protein  26.73 
 
 
418 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3906  hypothetical protein  26.81 
 
 
414 aa  70.1  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576525  normal  0.126212 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3328  hypothetical protein  25.97 
 
 
437 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.853201  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3286  hypothetical protein  26.3 
 
 
426 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5189  hypothetical protein  26.27 
 
 
429 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1081  protein of unknown function DUF1624  25.97 
 
 
428 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147779 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3464  hypothetical protein  26.25 
 
 
424 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0282982 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1365  hypothetical protein  28.65 
 
 
382 aa  67.4  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0980  hypothetical protein  25.73 
 
 
401 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.260122 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1140  protein of unknown function DUF1624  29.04 
 
 
385 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.983502  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3280  hypothetical protein  25.97 
 
 
407 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515764  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1045  hypothetical protein  25.15 
 
 
401 aa  67  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0062609 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5717  hypothetical protein  22.09 
 
 
398 aa  63.2  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1535  hypothetical protein  25.61 
 
 
398 aa  61.6  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000132608  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5557  hypothetical protein  31.35 
 
 
384 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63970  hypothetical protein  31.85 
 
 
384 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.989357 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2059  hypothetical protein  27.53 
 
 
388 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.453169  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1930  hypothetical protein  23.23 
 
 
388 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0332469 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3276  hypothetical protein  27.52 
 
 
388 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2419  hypothetical protein  27.06 
 
 
421 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.539289  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2111  hypothetical protein  32.85 
 
 
392 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0289  membrane protein  25.99 
 
 
399 aa  51.2  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3138  protein of unknown function DUF1624  30 
 
 
387 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1471  hypothetical protein  26.98 
 
 
383 aa  48.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.430676  normal  0.785937 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>