50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1140 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1140  protein of unknown function DUF1624  100 
 
 		 385 aa  741    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.983502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1201  hypothetical protein  88.59 
 
 		 398 aa  604  9.999999999999999e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.592526  normal  0.119748 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3138  protein of unknown function DUF1624  74.14 
 
 		 387 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2111  hypothetical protein  74.06 
 
 		 392 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2580  hypothetical protein  50.53 
 
 		 388 aa  345  7e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2271  hypothetical protein  50.8 
 
 		 388 aa  344  1e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.188325  normal  0.105142 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2951  hypothetical protein  53.56 
 
 		 402 aa  344  2e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3280  hypothetical protein  52.73 
 
 		 407 aa  334  1e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515764  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1906  hypothetical protein  50.27 
 
 		 382 aa  333  3e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2728  hypothetical protein  54.64 
 
 		 382 aa  332  7.000000000000001e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1930  hypothetical protein  54.4 
 
 		 388 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0332469 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2059  hypothetical protein  53.76 
 
 		 388 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.453169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1635  hypothetical protein  48.52 
 
 		 382 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.684419  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1365  hypothetical protein  55.29 
 
 		 382 aa  306  4.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5189  hypothetical protein  53.2 
 
 		 429 aa  300  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3276  hypothetical protein  53.51 
 
 		 388 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1866  hypothetical protein  51.47 
 
 		 405 aa  293  4e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.574386  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1157  hypothetical protein  46.89 
 
 		 388 aa  290  4e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2419  hypothetical protein  52.7 
 
 		 421 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.539289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1089  protein of unknown function DUF1624  52.09 
 
 		 382 aa  286  5.999999999999999e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5557  hypothetical protein  55.03 
 
 		 384 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0980  hypothetical protein  51.11 
 
 		 401 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.260122 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1045  hypothetical protein  50.15 
 
 		 401 aa  281  1e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062609 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3286  hypothetical protein  44.53 
 
 		 426 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2880  hypothetical protein  45.2 
 
 		 418 aa  280  4e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1081  protein of unknown function DUF1624  44.53 
 
 		 428 aa  279  7e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147779 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3328  hypothetical protein  48.63 
 
 		 437 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.853201  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0984  hypothetical protein  50.48 
 
 		 401 aa  276  5e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3464  hypothetical protein  44.42 
 
 		 424 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0282982 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3696  membrane protein-like protein  51.81 
 
 		 397 aa  273  5.000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643247  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63970  hypothetical protein  52.91 
 
 		 384 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.989357 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5634  hypothetical protein  44.34 
 
 		 401 aa  266  4e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0519757  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5717  hypothetical protein  38.32 
 
 		 398 aa  239  5.999999999999999e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1726  hypothetical protein  37.44 
 
 		 408 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3906  hypothetical protein  42.51 
 
 		 414 aa  228  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576525  normal  0.126212 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1300  hypothetical protein  41.61 
 
 		 388 aa  223  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2897  hypothetical protein  40.85 
 
 		 390 aa  222  9e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.905704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1535  hypothetical protein  41.18 
 
 		 398 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000132608  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3588  hypothetical protein  40.37 
 
 		 407 aa  194  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0967112  normal  0.500812 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0289  membrane protein  36.05 
 
 		 399 aa  187  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3048  hypothetical protein  39.9 
 
 		 440 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.634245  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0666  hypothetical protein  37.7 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2213  hypothetical protein  30.13 
 
 		 392 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.321622  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0458  hypothetical protein  28.83 
 
 		 375 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0903662  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0794  membrane protein-like protein  29.73 
 
 		 388 aa  96.3  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.13785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4226  membrane protein-like protein  27.83 
 
 		 389 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0455  membrane protein-like protein  28.31 
 
 		 389 aa  87  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.741716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1471  hypothetical protein  29.74 
 
 		 383 aa  85.1  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.430676  normal  0.785937 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1006  hypothetical protein  27.55 
 
 		 355 aa  53.5  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.43971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1147  hypothetical protein  27.19 
 
 		 254 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>