51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1147 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1147  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  496  1e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0143  hypothetical protein  40.48 
 
 
253 aa  201  9e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1538  hypothetical protein  38.3 
 
 
249 aa  170  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00890695  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1683  hypothetical protein  40.17 
 
 
246 aa  167  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1820  protein of unknown function DUF1624  40.32 
 
 
261 aa  162  7e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0347  hypothetical protein  37.6 
 
 
245 aa  148  8e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000605459  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0665  hypothetical protein  38.93 
 
 
245 aa  143  2e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.646627  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2070  protein of unknown function DUF1624  36.36 
 
 
235 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.250094  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1385  hypothetical protein  37.7 
 
 
245 aa  140  3e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0429  hypothetical protein  40 
 
 
229 aa  138  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000311918  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1589  hypothetical protein  35.68 
 
 
264 aa  135  8e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000654588  hitchhiker  0.00067208 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0043  hypothetical protein  35.48 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1291  hypothetical protein  36.78 
 
 
245 aa  128  7.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.687522 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0080  protein of unknown function DUF1624  35.48 
 
 
237 aa  121  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000683778  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0098  hypothetical protein  33.2 
 
 
244 aa  118  9e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1588  hypothetical protein  31.47 
 
 
270 aa  112  6e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000117869  hitchhiker  0.00161321 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1793  hypothetical protein  33.33 
 
 
234 aa  105  8e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2615  hypothetical protein  30 
 
 
322 aa  97.4  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130361  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4134  hypothetical protein  28.57 
 
 
244 aa  97.1  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1587  hypothetical protein  35.32 
 
 
277 aa  93.6  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000110361  hitchhiker  0.00369303 
 
 
-
 
NC_004310  BR1178  hypothetical protein  29.32 
 
 
328 aa  92.8  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0102548  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2013  hypothetical protein  29.88 
 
 
326 aa  91.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.777902  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1871  hypothetical protein  28 
 
 
263 aa  88.2  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0219449 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00327  hypothetical protein  29.8 
 
 
232 aa  86.7  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1035  hypothetical protein  29.27 
 
 
365 aa  86.3  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138536  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1762  hypothetical protein  28.35 
 
 
243 aa  84.7  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.175449 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1829  hypothetical protein  26.48 
 
 
244 aa  82.4  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.390473 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1137  hypothetical protein  28.63 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0118905  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3231  protein of unknown function DUF1624  28.95 
 
 
328 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.356551 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2413  hypothetical protein  28.12 
 
 
258 aa  78.6  0.00000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.248574  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3006  hypothetical protein  28.95 
 
 
328 aa  78.6  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.166518  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1672  hypothetical protein  28.96 
 
 
256 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1261  hypothetical protein  28.03 
 
 
335 aa  78.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2952  hypothetical protein  25.3 
 
 
264 aa  76.6  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2995  hypothetical protein  28.69 
 
 
241 aa  74.7  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.961096  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2032  protein of unknown function DUF1624  27.84 
 
 
256 aa  73.2  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0097  hypothetical protein  29.29 
 
 
254 aa  73.2  0.000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3195  protein of unknown function DUF1624  29.54 
 
 
328 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.856715 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1837  hypothetical protein  24.49 
 
 
258 aa  72  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2067  protein of unknown function DUF1624  26.94 
 
 
329 aa  69.7  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2737  hypothetical protein  30.17 
 
 
339 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.891818 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1864  protein of unknown function DUF1624  26.12 
 
 
329 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161953  normal  0.0500445 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1883  protein of unknown function DUF1624  40.58 
 
 
334 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1006  hypothetical protein  27.31 
 
 
355 aa  50.4  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.43971  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3276  hypothetical protein  26.55 
 
 
388 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2419  hypothetical protein  28.32 
 
 
421 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.539289  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2059  hypothetical protein  27.4 
 
 
388 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.453169  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1140  protein of unknown function DUF1624  26.91 
 
 
385 aa  43.9  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.983502  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0004  hypothetical protein  27.54 
 
 
351 aa  43.9  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.326311  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1201  hypothetical protein  28.31 
 
 
398 aa  42.7  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.592526  normal  0.119748 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3138  protein of unknown function DUF1624  30.13 
 
 
387 aa  42.4  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>