45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0429 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0429  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  447  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000311918  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2070  protein of unknown function DUF1624  52.4 
 
 		 235 aa  227  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.250094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1793  hypothetical protein  38.14 
 
 		 234 aa  149  4e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0143  hypothetical protein  39.34 
 
 		 253 aa  144  8.000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1538  hypothetical protein  36.6 
 
 		 249 aa  141  7e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00890695  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1147  hypothetical protein  40.17 
 
 		 254 aa  138  8.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0080  protein of unknown function DUF1624  36.21 
 
 		 237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000683778  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1683  hypothetical protein  34.31 
 
 		 246 aa  129  4.0000000000000003e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0665  hypothetical protein  35.44 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.646627  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1820  protein of unknown function DUF1624  35.68 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0347  hypothetical protein  33.61 
 
 		 245 aa  114  8.999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000605459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1385  hypothetical protein  34.48 
 
 		 245 aa  112  3e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0098  hypothetical protein  34.87 
 
 		 244 aa  106  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0043  hypothetical protein  34.58 
 
 		 263 aa  105  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1291  hypothetical protein  34.45 
 
 		 245 aa  102  7e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.687522 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2413  hypothetical protein  30.67 
 
 		 258 aa  94  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.248574  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4134  hypothetical protein  31.72 
 
 		 244 aa  89.7  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0097  hypothetical protein  32.03 
 
 		 254 aa  88.2  9e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2952  hypothetical protein  27.31 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1829  hypothetical protein  31.47 
 
 		 244 aa  81.6  0.000000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.390473 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2013  hypothetical protein  32.51 
 
 		 326 aa  81.3  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.777902  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1588  hypothetical protein  29.15 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000117869  hitchhiker  0.00161321 
 
 
-
 
NC_004310  BR1178  hypothetical protein  29.41 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0102548  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1762  hypothetical protein  27.92 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.175449 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2615  hypothetical protein  30.99 
 
 		 322 aa  78.2  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130361  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1589  hypothetical protein  27.08 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000654588  hitchhiker  0.00067208 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1672  hypothetical protein  28.57 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1837  hypothetical protein  27.35 
 
 		 258 aa  75.1  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00327  hypothetical protein  32.49 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1035  hypothetical protein  31.78 
 
 		 365 aa  73.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2032  protein of unknown function DUF1624  27.85 
 
 		 256 aa  72  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1587  hypothetical protein  31.8 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000110361  hitchhiker  0.00369303 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1137  hypothetical protein  28.7 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0118905  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1871  hypothetical protein  28.81 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0219449 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2995  hypothetical protein  33.61 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.961096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2067  protein of unknown function DUF1624  29.55 
 
 		 329 aa  66.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1864  protein of unknown function DUF1624  29.55 
 
 		 329 aa  65.1  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161953  normal  0.0500445 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2737  hypothetical protein  29.96 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.891818 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3195  protein of unknown function DUF1624  33.77 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.856715 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0771  protein of unknown function DUF1624  30.65 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.627513  normal  0.29852 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3006  hypothetical protein  32.47 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.166518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3231  protein of unknown function DUF1624  34.25 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.356551 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1261  hypothetical protein  27.64 
 
 		 335 aa  53.9  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2897  hypothetical protein  26.91 
 
 		 390 aa  42.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.905704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1006  hypothetical protein  27.27 
 
 		 355 aa  42  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.43971  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>