48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1793 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1793  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  460  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2070  protein of unknown function DUF1624  42.66 
 
 		 235 aa  181  6e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.250094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0429  hypothetical protein  38.43 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000311918  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1538  hypothetical protein  31.93 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00890695  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1820  protein of unknown function DUF1624  35.27 
 
 		 261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0080  protein of unknown function DUF1624  32 
 
 		 237 aa  115  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000683778  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1683  hypothetical protein  31.76 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1147  hypothetical protein  32.91 
 
 		 254 aa  105  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0143  hypothetical protein  33.47 
 
 		 253 aa  98.2  9e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0665  hypothetical protein  31.15 
 
 		 245 aa  96.7  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.646627  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0097  hypothetical protein  28.69 
 
 		 254 aa  93.6  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0347  hypothetical protein  32.66 
 
 		 245 aa  93.2  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000605459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2615  hypothetical protein  29.13 
 
 		 322 aa  86.3  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130361  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1035  hypothetical protein  28.15 
 
 		 365 aa  85.5  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1871  hypothetical protein  28.51 
 
 		 263 aa  85.1  9e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0219449 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2013  hypothetical protein  31.12 
 
 		 326 aa  84  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.777902  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1291  hypothetical protein  30.08 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.687522 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0098  hypothetical protein  29.22 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4134  hypothetical protein  28.57 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0043  hypothetical protein  28.75 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1837  hypothetical protein  25.21 
 
 		 258 aa  80.9  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1385  hypothetical protein  28.34 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1178  hypothetical protein  30.12 
 
 		 328 aa  76.6  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0102548  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1588  hypothetical protein  25.88 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000117869  hitchhiker  0.00161321 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2952  hypothetical protein  23.55 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0771  protein of unknown function DUF1624  30.45 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.627513  normal  0.29852 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00327  hypothetical protein  29.74 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1829  hypothetical protein  26.38 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.390473 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1762  hypothetical protein  25.43 
 
 		 243 aa  72  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.175449 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1864  protein of unknown function DUF1624  28.63 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161953  normal  0.0500445 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1589  hypothetical protein  25.91 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000654588  hitchhiker  0.00067208 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2413  hypothetical protein  23.46 
 
 		 258 aa  68.6  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.248574  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1261  hypothetical protein  29.1 
 
 		 335 aa  66.6  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1672  hypothetical protein  22 
 
 		 256 aa  62  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2995  hypothetical protein  27.51 
 
 		 241 aa  62  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.961096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2032  protein of unknown function DUF1624  22.31 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1587  hypothetical protein  26.42 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000110361  hitchhiker  0.00369303 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2067  protein of unknown function DUF1624  28.57 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1137  hypothetical protein  29.33 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0118905  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3231  protein of unknown function DUF1624  27.27 
 
 		 328 aa  57  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.356551 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3006  hypothetical protein  28.21 
 
 		 328 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.166518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2737  hypothetical protein  26.22 
 
 		 339 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.891818 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3195  protein of unknown function DUF1624  26.62 
 
 		 328 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.856715 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1883  protein of unknown function DUF1624  37.31 
 
 		 334 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1006  hypothetical protein  25.48 
 
 		 355 aa  45.4  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.43971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3178  hypothetical protein  24.31 
 
 		 363 aa  43.5  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5717  hypothetical protein  26.67 
 
 		 398 aa  43.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1157  hypothetical protein  23.85 
 
 		 388 aa  42.7  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>