45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1035 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1035  hypothetical protein  100 
 
 		 365 aa  741    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2615  hypothetical protein  48.92 
 
 		 322 aa  288  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130361  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2013  hypothetical protein  47.95 
 
 		 326 aa  276  5e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.777902  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1178  hypothetical protein  47.23 
 
 		 328 aa  267  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0102548  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1864  protein of unknown function DUF1624  46.06 
 
 		 329 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161953  normal  0.0500445 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2067  protein of unknown function DUF1624  45.78 
 
 		 329 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1137  hypothetical protein  47.26 
 
 		 298 aa  251  9.000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0118905  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1261  hypothetical protein  43.15 
 
 		 335 aa  231  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1871  hypothetical protein  47.81 
 
 		 263 aa  179  8e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0219449 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4134  hypothetical protein  41.63 
 
 		 244 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3006  hypothetical protein  40.92 
 
 		 328 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.166518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2737  hypothetical protein  42.36 
 
 		 339 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.891818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3231  protein of unknown function DUF1624  40.07 
 
 		 328 aa  153  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.356551 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1883  protein of unknown function DUF1624  43.43 
 
 		 334 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3195  protein of unknown function DUF1624  41.16 
 
 		 328 aa  152  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.856715 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00327  hypothetical protein  36.97 
 
 		 232 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0143  hypothetical protein  33.47 
 
 		 253 aa  114  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1538  hypothetical protein  35.37 
 
 		 249 aa  110  5e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00890695  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2413  hypothetical protein  33.74 
 
 		 258 aa  109  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.248574  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1837  hypothetical protein  34 
 
 		 258 aa  109  8.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1829  hypothetical protein  36.95 
 
 		 244 aa  107  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.390473 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1762  hypothetical protein  36.82 
 
 		 243 aa  105  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.175449 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1683  hypothetical protein  31.3 
 
 		 246 aa  105  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2952  hypothetical protein  32.46 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1385  hypothetical protein  29.17 
 
 		 245 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1672  hypothetical protein  33.6 
 
 		 256 aa  100  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2032  protein of unknown function DUF1624  32.13 
 
 		 256 aa  98.2  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0098  hypothetical protein  32.92 
 
 		 244 aa  91.3  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1793  hypothetical protein  30 
 
 		 234 aa  90.9  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1820  protein of unknown function DUF1624  31.17 
 
 		 261 aa  89.7  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0665  hypothetical protein  26.27 
 
 		 245 aa  89.4  9e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.646627  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1291  hypothetical protein  25.93 
 
 		 245 aa  87.8  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.687522 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0347  hypothetical protein  28.74 
 
 		 245 aa  87.4  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000605459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1147  hypothetical protein  28.57 
 
 		 254 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2995  hypothetical protein  30.98 
 
 		 241 aa  82.4  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.961096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0080  protein of unknown function DUF1624  27 
 
 		 237 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000683778  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0043  hypothetical protein  33.96 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2070  protein of unknown function DUF1624  29.49 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.250094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0097  hypothetical protein  27.34 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0429  hypothetical protein  30.7 
 
 		 229 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000311918  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1589  hypothetical protein  28.63 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000654588  hitchhiker  0.00067208 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1588  hypothetical protein  25.2 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000117869  hitchhiker  0.00161321 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0380  hypothetical protein  51.33 
 
 		 336 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.421494 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1587  hypothetical protein  24.48 
 
 		 277 aa  55.1  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000110361  hitchhiker  0.00369303 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0771  protein of unknown function DUF1624  27.48 
 
 		 254 aa  50.8  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.627513  normal  0.29852 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>