45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0665 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0665  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  474  1e-133  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.646627  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1385  hypothetical protein  84.49 
 
 
245 aa  410  1e-113  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1291  hypothetical protein  87.76 
 
 
245 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.687522 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1683  hypothetical protein  32.78 
 
 
246 aa  143  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1820  protein of unknown function DUF1624  35.86 
 
 
261 aa  138  7e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1147  hypothetical protein  38.72 
 
 
254 aa  137  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1538  hypothetical protein  31.78 
 
 
249 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00890695  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0347  hypothetical protein  34.02 
 
 
245 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000605459  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0143  hypothetical protein  35.04 
 
 
253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2070  protein of unknown function DUF1624  35.44 
 
 
235 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.250094  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0429  hypothetical protein  34.78 
 
 
229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000311918  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1588  hypothetical protein  32.64 
 
 
270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000117869  hitchhiker  0.00161321 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0043  hypothetical protein  28.69 
 
 
263 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0097  hypothetical protein  31.49 
 
 
254 aa  101  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1589  hypothetical protein  29.91 
 
 
264 aa  98.6  8e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000654588  hitchhiker  0.00067208 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2615  hypothetical protein  28.21 
 
 
322 aa  98.2  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130361  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2013  hypothetical protein  29.79 
 
 
326 aa  97.4  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.777902  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4134  hypothetical protein  26.02 
 
 
244 aa  94.4  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0080  protein of unknown function DUF1624  28.33 
 
 
237 aa  94.4  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000683778  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0098  hypothetical protein  29 
 
 
244 aa  93.6  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1793  hypothetical protein  30.87 
 
 
234 aa  92.8  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1035  hypothetical protein  25.53 
 
 
365 aa  86.7  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138536  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1178  hypothetical protein  25.82 
 
 
328 aa  84.7  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0102548  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1587  hypothetical protein  33.06 
 
 
277 aa  82  0.000000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000110361  hitchhiker  0.00369303 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1871  hypothetical protein  25.7 
 
 
263 aa  81.3  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0219449 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2032  protein of unknown function DUF1624  21.46 
 
 
256 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00327  hypothetical protein  28.1 
 
 
232 aa  77.4  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1261  hypothetical protein  28.88 
 
 
335 aa  76.3  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1829  hypothetical protein  23.08 
 
 
244 aa  75.9  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.390473 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1672  hypothetical protein  20.65 
 
 
256 aa  75.1  0.0000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2413  hypothetical protein  22.86 
 
 
258 aa  73.6  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.248574  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2952  hypothetical protein  20.56 
 
 
264 aa  73.2  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2067  protein of unknown function DUF1624  27.05 
 
 
329 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1864  protein of unknown function DUF1624  24.69 
 
 
329 aa  72  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161953  normal  0.0500445 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1837  hypothetical protein  22.08 
 
 
258 aa  70.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3195  protein of unknown function DUF1624  25.93 
 
 
328 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.856715 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3231  protein of unknown function DUF1624  26.34 
 
 
328 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.356551 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1137  hypothetical protein  24.23 
 
 
298 aa  69.3  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0118905  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3006  hypothetical protein  26.88 
 
 
328 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.166518  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1762  hypothetical protein  21.25 
 
 
243 aa  66.6  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.175449 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2737  hypothetical protein  25.43 
 
 
339 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.891818 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2995  hypothetical protein  29.61 
 
 
241 aa  59.3  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.961096  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1006  hypothetical protein  22.9 
 
 
355 aa  51.6  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.43971  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4326  hypothetical protein  31.45 
 
 
368 aa  50.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1883  protein of unknown function DUF1624  29.58 
 
 
334 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>