44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1883 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1883  protein of unknown function DUF1624  100 
 
 		 334 aa  641    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0380  hypothetical protein  75.23 
 
 		 336 aa  327  3e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.421494 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3195  protein of unknown function DUF1624  61.07 
 
 		 328 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.856715 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3231  protein of unknown function DUF1624  60.07 
 
 		 328 aa  298  8e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.356551 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3006  hypothetical protein  59.73 
 
 		 328 aa  297  2e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.166518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2737  hypothetical protein  60.26 
 
 		 339 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.891818 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2615  hypothetical protein  41.64 
 
 		 322 aa  205  8e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130361  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1035  hypothetical protein  43.43 
 
 		 365 aa  205  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1261  hypothetical protein  41.67 
 
 		 335 aa  181  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1178  hypothetical protein  41.35 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0102548  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2013  hypothetical protein  39.1 
 
 		 326 aa  173  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.777902  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2067  protein of unknown function DUF1624  37.24 
 
 		 329 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1864  protein of unknown function DUF1624  36.53 
 
 		 329 aa  162  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161953  normal  0.0500445 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1137  hypothetical protein  40.74 
 
 		 298 aa  159  5e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0118905  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4134  hypothetical protein  41.03 
 
 		 244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1871  hypothetical protein  43.7 
 
 		 263 aa  138  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0219449 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00327  hypothetical protein  35.02 
 
 		 232 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0347  hypothetical protein  35.89 
 
 		 245 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000605459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1829  hypothetical protein  33.6 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.390473 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2413  hypothetical protein  34.65 
 
 		 258 aa  107  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.248574  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1837  hypothetical protein  33.33 
 
 		 258 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1762  hypothetical protein  35.77 
 
 		 243 aa  98.6  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.175449 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1683  hypothetical protein  32.79 
 
 		 246 aa  99  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1538  hypothetical protein  34.15 
 
 		 249 aa  98.2  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00890695  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1147  hypothetical protein  29.27 
 
 		 254 aa  94  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2995  hypothetical protein  32.51 
 
 		 241 aa  94.4  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.961096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2952  hypothetical protein  33.07 
 
 		 264 aa  94  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2032  protein of unknown function DUF1624  32.54 
 
 		 256 aa  91.3  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1672  hypothetical protein  33.06 
 
 		 256 aa  90.1  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0143  hypothetical protein  28.33 
 
 		 253 aa  87.8  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1588  hypothetical protein  30.38 
 
 		 270 aa  86.7  6e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000117869  hitchhiker  0.00161321 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0080  protein of unknown function DUF1624  31.43 
 
 		 237 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000683778  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2070  protein of unknown function DUF1624  29.75 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.250094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1385  hypothetical protein  25.31 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0043  hypothetical protein  37.5 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1820  protein of unknown function DUF1624  29.67 
 
 		 261 aa  79  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0429  hypothetical protein  30.29 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000311918  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0665  hypothetical protein  23.05 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.646627  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0097  hypothetical protein  26.29 
 
 		 254 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1291  hypothetical protein  25.31 
 
 		 245 aa  72  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.687522 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1587  hypothetical protein  29.28 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000110361  hitchhiker  0.00369303 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1589  hypothetical protein  28.29 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000654588  hitchhiker  0.00067208 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1793  hypothetical protein  25.22 
 
 		 234 aa  65.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0098  hypothetical protein  31.98 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>