42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1762 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1762  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.175449 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1829  hypothetical protein  60.85 
 
 
244 aa  276  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.390473 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2952  hypothetical protein  61.25 
 
 
264 aa  268  5e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1672  hypothetical protein  59.44 
 
 
256 aa  259  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2032  protein of unknown function DUF1624  58.23 
 
 
256 aa  256  3e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2413  hypothetical protein  58.51 
 
 
258 aa  254  8e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.248574  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1837  hypothetical protein  60.32 
 
 
258 aa  249  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2615  hypothetical protein  34.15 
 
 
322 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130361  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2013  hypothetical protein  37.13 
 
 
326 aa  105  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.777902  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1178  hypothetical protein  35.8 
 
 
328 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0102548  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1871  hypothetical protein  34.89 
 
 
263 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0219449 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1035  hypothetical protein  36.86 
 
 
365 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138536  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2995  hypothetical protein  30.42 
 
 
241 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.961096  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4134  hypothetical protein  31.47 
 
 
244 aa  97.8  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1538  hypothetical protein  31.2 
 
 
249 aa  93.6  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00890695  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1261  hypothetical protein  34.85 
 
 
335 aa  92.8  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1137  hypothetical protein  35.27 
 
 
298 aa  88.6  8e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0118905  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1820  protein of unknown function DUF1624  32.78 
 
 
261 aa  88.2  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00327  hypothetical protein  32.77 
 
 
232 aa  88.2  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1864  protein of unknown function DUF1624  33.06 
 
 
329 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161953  normal  0.0500445 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2737  hypothetical protein  32.88 
 
 
339 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.891818 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2067  protein of unknown function DUF1624  30.77 
 
 
329 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1683  hypothetical protein  31.09 
 
 
246 aa  79.3  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1147  hypothetical protein  27.64 
 
 
254 aa  79  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0143  hypothetical protein  27.46 
 
 
253 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0347  hypothetical protein  29.51 
 
 
245 aa  75.9  0.0000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000605459  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0429  hypothetical protein  27.59 
 
 
229 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000311918  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3195  protein of unknown function DUF1624  35.67 
 
 
328 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.856715 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1883  protein of unknown function DUF1624  33.06 
 
 
334 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3231  protein of unknown function DUF1624  32.7 
 
 
328 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.356551 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3006  hypothetical protein  32.7 
 
 
328 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.166518  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1793  hypothetical protein  25.76 
 
 
234 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0098  hypothetical protein  30.08 
 
 
244 aa  69.3  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2070  protein of unknown function DUF1624  25.73 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.250094  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0080  protein of unknown function DUF1624  26.58 
 
 
237 aa  67  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000683778  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0665  hypothetical protein  21.25 
 
 
245 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.646627  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1385  hypothetical protein  21.46 
 
 
245 aa  62.8  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1291  hypothetical protein  21.67 
 
 
245 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.687522 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0043  hypothetical protein  31.02 
 
 
263 aa  53.9  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0097  hypothetical protein  24.05 
 
 
254 aa  53.5  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1589  hypothetical protein  25 
 
 
264 aa  50.8  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000654588  hitchhiker  0.00067208 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1588  hypothetical protein  24.9 
 
 
270 aa  47  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000117869  hitchhiker  0.00161321 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>