57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1538 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1538  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  485  1e-136  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00890695  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1683  hypothetical protein  48.5 
 
 		 246 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1820  protein of unknown function DUF1624  49.36 
 
 		 261 aa  203  2e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1147  hypothetical protein  38.36 
 
 		 254 aa  169  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0143  hypothetical protein  38.89 
 
 		 253 aa  163  3e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0043  hypothetical protein  41.25 
 
 		 263 aa  152  7e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2070  protein of unknown function DUF1624  37.45 
 
 		 235 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.250094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0347  hypothetical protein  37.7 
 
 		 245 aa  137  1e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000605459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0429  hypothetical protein  36.09 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000311918  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0665  hypothetical protein  31.78 
 
 		 245 aa  135  8e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.646627  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0098  hypothetical protein  39.92 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2013  hypothetical protein  37.76 
 
 		 326 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.777902  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1385  hypothetical protein  34.18 
 
 		 245 aa  130  3e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1178  hypothetical protein  37.45 
 
 		 328 aa  122  7e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0102548  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1291  hypothetical protein  31.65 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.687522 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0080  protein of unknown function DUF1624  34.54 
 
 		 237 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000683778  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1793  hypothetical protein  31 
 
 		 234 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4134  hypothetical protein  33.2 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1589  hypothetical protein  31.76 
 
 		 264 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000654588  hitchhiker  0.00067208 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2413  hypothetical protein  34.57 
 
 		 258 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.248574  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1137  hypothetical protein  36.89 
 
 		 298 aa  106  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0118905  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2615  hypothetical protein  36.36 
 
 		 322 aa  106  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130361  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0097  hypothetical protein  33.61 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1035  hypothetical protein  35.37 
 
 		 365 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1588  hypothetical protein  29.6 
 
 		 270 aa  98.2  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000117869  hitchhiker  0.00161321 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2952  hypothetical protein  32.13 
 
 		 264 aa  97.4  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00327  hypothetical protein  32.54 
 
 		 232 aa  95.9  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1672  hypothetical protein  30.99 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2032  protein of unknown function DUF1624  31.95 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1762  hypothetical protein  31.2 
 
 		 243 aa  93.6  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.175449 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1829  hypothetical protein  32.81 
 
 		 244 aa  93.6  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.390473 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1837  hypothetical protein  29.61 
 
 		 258 aa  89.7  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1871  hypothetical protein  29.1 
 
 		 263 aa  89  6e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0219449 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1261  hypothetical protein  34.84 
 
 		 335 aa  89  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1864  protein of unknown function DUF1624  30.83 
 
 		 329 aa  85.1  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161953  normal  0.0500445 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2067  protein of unknown function DUF1624  31.28 
 
 		 329 aa  79  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3195  protein of unknown function DUF1624  34.68 
 
 		 328 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.856715 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1587  hypothetical protein  29.32 
 
 		 277 aa  75.5  0.0000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000110361  hitchhiker  0.00369303 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2737  hypothetical protein  30.04 
 
 		 339 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.891818 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2995  hypothetical protein  30.04 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.961096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3231  protein of unknown function DUF1624  32.14 
 
 		 328 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.356551 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3006  hypothetical protein  33.78 
 
 		 328 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.166518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1906  hypothetical protein  29.49 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0458  hypothetical protein  25 
 
 		 375 aa  53.9  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0903662  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1883  protein of unknown function DUF1624  43.66 
 
 		 334 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2213  hypothetical protein  27.19 
 
 		 392 aa  52.4  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.321622  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1635  hypothetical protein  27.44 
 
 		 382 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.684419  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0771  protein of unknown function DUF1624  30.13 
 
 		 254 aa  51.2  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.627513  normal  0.29852 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2271  hypothetical protein  28.84 
 
 		 388 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.188325  normal  0.105142 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2580  hypothetical protein  28.84 
 
 		 388 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1930  hypothetical protein  28.64 
 
 		 388 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0332469 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1365  hypothetical protein  27.4 
 
 		 382 aa  48.5  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2059  hypothetical protein  28.17 
 
 		 388 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.453169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3276  hypothetical protein  27.57 
 
 		 388 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2419  hypothetical protein  27.57 
 
 		 421 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.539289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4326  hypothetical protein  25.65 
 
 		 368 aa  43.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2728  hypothetical protein  27.1 
 
 		 382 aa  42.4  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>