44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3195 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3195  protein of unknown function DUF1624  100 
 
 		 328 aa  636    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.856715 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3006  hypothetical protein  85.67 
 
 		 328 aa  486  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.166518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3231  protein of unknown function DUF1624  85.98 
 
 		 328 aa  481  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.356551 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2737  hypothetical protein  63.9 
 
 		 339 aa  319  3e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.891818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1883  protein of unknown function DUF1624  59.69 
 
 		 334 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2615  hypothetical protein  40.43 
 
 		 322 aa  193  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130361  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1035  hypothetical protein  42.37 
 
 		 365 aa  182  9.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2013  hypothetical protein  40.69 
 
 		 326 aa  179  5.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.777902  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1178  hypothetical protein  39.94 
 
 		 328 aa  168  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0102548  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1864  protein of unknown function DUF1624  36.73 
 
 		 329 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161953  normal  0.0500445 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1261  hypothetical protein  41.03 
 
 		 335 aa  155  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1137  hypothetical protein  39.26 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0118905  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1871  hypothetical protein  43.62 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0219449 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2067  protein of unknown function DUF1624  35.22 
 
 		 329 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4134  hypothetical protein  38.89 
 
 		 244 aa  141  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1538  hypothetical protein  36.25 
 
 		 249 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00890695  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1837  hypothetical protein  32.49 
 
 		 258 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2413  hypothetical protein  33.06 
 
 		 258 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.248574  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1829  hypothetical protein  34.15 
 
 		 244 aa  104  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.390473 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0380  hypothetical protein  68.75 
 
 		 336 aa  103  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.421494 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00327  hypothetical protein  34.63 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1672  hypothetical protein  34.03 
 
 		 256 aa  99.4  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1762  hypothetical protein  35.17 
 
 		 243 aa  98.2  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.175449 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2952  hypothetical protein  31.91 
 
 		 264 aa  97.1  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2032  protein of unknown function DUF1624  33.33 
 
 		 256 aa  96.7  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0347  hypothetical protein  33.46 
 
 		 245 aa  86.7  6e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000605459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1683  hypothetical protein  31.8 
 
 		 246 aa  86.3  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0665  hypothetical protein  25.19 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.646627  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1147  hypothetical protein  28.98 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1385  hypothetical protein  24.58 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0143  hypothetical protein  28.4 
 
 		 253 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0429  hypothetical protein  31.88 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000311918  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2995  hypothetical protein  32.91 
 
 		 241 aa  75.1  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.961096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1291  hypothetical protein  24.41 
 
 		 245 aa  72  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.687522 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1820  protein of unknown function DUF1624  34.13 
 
 		 261 aa  72  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2070  protein of unknown function DUF1624  27.67 
 
 		 235 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.250094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0043  hypothetical protein  34.75 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0080  protein of unknown function DUF1624  31.15 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000683778  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0097  hypothetical protein  26.88 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1793  hypothetical protein  25 
 
 		 234 aa  65.5  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1588  hypothetical protein  28.46 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000117869  hitchhiker  0.00161321 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1589  hypothetical protein  26.32 
 
 		 264 aa  51.6  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000654588  hitchhiker  0.00067208 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0098  hypothetical protein  28.97 
 
 		 244 aa  50.4  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1587  hypothetical protein  27.27 
 
 		 277 aa  49.3  0.00009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000110361  hitchhiker  0.00369303 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>