17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1006 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1006  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  678    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.43971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5634  hypothetical protein  25.45 
 
 		 401 aa  53.9  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0519757  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0665  hypothetical protein  22.9 
 
 		 245 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.646627  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1147  hypothetical protein  27.31 
 
 		 254 aa  50.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2951  hypothetical protein  24.92 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1201  hypothetical protein  28.34 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.592526  normal  0.119748 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3138  protein of unknown function DUF1624  27.93 
 
 		 387 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1450  hypothetical protein  27.49 
 
 		 411 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1589  hypothetical protein  26.29 
 
 		 264 aa  47.8  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000654588  hitchhiker  0.00067208 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1385  hypothetical protein  22.43 
 
 		 245 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2213  hypothetical protein  24.38 
 
 		 392 aa  47.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.321622  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1140  protein of unknown function DUF1624  29.44 
 
 		 385 aa  47  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.983502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1793  hypothetical protein  25.48 
 
 		 234 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0347  hypothetical protein  27.31 
 
 		 245 aa  43.5  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000605459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3906  hypothetical protein  26.54 
 
 		 414 aa  43.1  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576525  normal  0.126212 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3276  hypothetical protein  28.02 
 
 		 388 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2419  hypothetical protein  28.02 
 
 		 421 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.539289  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>