52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3276 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3276  hypothetical protein  100 
 
 		 388 aa  768    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2419  hypothetical protein  96.13 
 
 		 421 aa  659    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.539289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2059  hypothetical protein  92.78 
 
 		 388 aa  662    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.453169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1930  hypothetical protein  88.4 
 
 		 388 aa  649    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0332469 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2580  hypothetical protein  70.54 
 
 		 388 aa  558  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2271  hypothetical protein  70.1 
 
 		 388 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.188325  normal  0.105142 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3280  hypothetical protein  76.6 
 
 		 407 aa  550  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515764  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1906  hypothetical protein  61.38 
 
 		 382 aa  464  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1365  hypothetical protein  67.29 
 
 		 382 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1635  hypothetical protein  62.17 
 
 		 382 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.684419  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1866  hypothetical protein  63.76 
 
 		 405 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.574386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5557  hypothetical protein  70.56 
 
 		 384 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63970  hypothetical protein  70.03 
 
 		 384 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.989357 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5189  hypothetical protein  57.62 
 
 		 429 aa  402  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1089  protein of unknown function DUF1624  62.73 
 
 		 382 aa  398  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2951  hypothetical protein  53.58 
 
 		 402 aa  392  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3696  membrane protein-like protein  53.98 
 
 		 397 aa  361  1e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643247  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2728  hypothetical protein  52.25 
 
 		 382 aa  341  2e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1157  hypothetical protein  53.14 
 
 		 388 aa  333  4e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0980  hypothetical protein  52.26 
 
 		 401 aa  327  3e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.260122 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0984  hypothetical protein  53.14 
 
 		 401 aa  325  1e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1201  hypothetical protein  53.39 
 
 		 398 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.592526  normal  0.119748 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1045  hypothetical protein  53.4 
 
 		 401 aa  320  3e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062609 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1081  protein of unknown function DUF1624  49.62 
 
 		 428 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147779 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3286  hypothetical protein  48.85 
 
 		 426 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3464  hypothetical protein  48.85 
 
 		 424 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0282982 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2880  hypothetical protein  49.1 
 
 		 418 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3328  hypothetical protein  47.85 
 
 		 437 aa  307  3e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.853201  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1140  protein of unknown function DUF1624  53.51 
 
 		 385 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.983502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2111  hypothetical protein  54.22 
 
 		 392 aa  299  6e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3138  protein of unknown function DUF1624  51.05 
 
 		 387 aa  267  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5634  hypothetical protein  43.15 
 
 		 401 aa  250  4e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0519757  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5717  hypothetical protein  37.59 
 
 		 398 aa  241  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3906  hypothetical protein  36.36 
 
 		 414 aa  215  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576525  normal  0.126212 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2897  hypothetical protein  37.15 
 
 		 390 aa  205  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.905704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1535  hypothetical protein  38.97 
 
 		 398 aa  204  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000132608  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1300  hypothetical protein  36.73 
 
 		 388 aa  202  8e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0289  membrane protein  40.12 
 
 		 399 aa  196  8.000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1726  hypothetical protein  35.66 
 
 		 408 aa  189  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3588  hypothetical protein  35.61 
 
 		 407 aa  181  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0967112  normal  0.500812 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3048  hypothetical protein  40.18 
 
 		 440 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.634245  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0666  hypothetical protein  38.26 
 
 		 388 aa  173  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2213  hypothetical protein  30.89 
 
 		 392 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.321622  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0458  hypothetical protein  28.46 
 
 		 375 aa  111  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0903662  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4226  membrane protein-like protein  27.69 
 
 		 389 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0794  membrane protein-like protein  26.58 
 
 		 388 aa  84.7  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.13785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0455  membrane protein-like protein  26.42 
 
 		 389 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.741716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1471  hypothetical protein  26.16 
 
 		 383 aa  72.4  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.430676  normal  0.785937 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1006  hypothetical protein  26.79 
 
 		 355 aa  49.7  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.43971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1147  hypothetical protein  26.55 
 
 		 254 aa  46.6  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0097  hypothetical protein  24.66 
 
 		 254 aa  44.7  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1538  hypothetical protein  27.57 
 
 		 249 aa  44.3  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00890695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>