50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_63970 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_63970  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  748    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.989357 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5557  hypothetical protein  89.06 
 
 		 384 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2580  hypothetical protein  70.74 
 
 		 388 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2271  hypothetical protein  69.76 
 
 		 388 aa  530  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.188325  normal  0.105142 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3280  hypothetical protein  72.22 
 
 		 407 aa  518  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515764  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1930  hypothetical protein  69.76 
 
 		 388 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0332469 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1906  hypothetical protein  62.86 
 
 		 382 aa  479  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2059  hypothetical protein  70.29 
 
 		 388 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.453169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1635  hypothetical protein  62.77 
 
 		 382 aa  457  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.684419  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1365  hypothetical protein  68.7 
 
 		 382 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1866  hypothetical protein  67.82 
 
 		 405 aa  451  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.574386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3276  hypothetical protein  70.03 
 
 		 388 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2419  hypothetical protein  68.44 
 
 		 421 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.539289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2951  hypothetical protein  54.23 
 
 		 402 aa  389  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1089  protein of unknown function DUF1624  61.46 
 
 		 382 aa  384  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5189  hypothetical protein  57.94 
 
 		 429 aa  381  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3696  membrane protein-like protein  53.85 
 
 		 397 aa  354  2e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643247  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1157  hypothetical protein  53.93 
 
 		 388 aa  342  8e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2728  hypothetical protein  54.17 
 
 		 382 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0980  hypothetical protein  53.49 
 
 		 401 aa  335  1e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.260122 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0984  hypothetical protein  52.45 
 
 		 401 aa  328  9e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3286  hypothetical protein  52.43 
 
 		 426 aa  323  4e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1081  protein of unknown function DUF1624  51.92 
 
 		 428 aa  323  4e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147779 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1045  hypothetical protein  52.99 
 
 		 401 aa  322  5e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062609 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1201  hypothetical protein  56.3 
 
 		 398 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.592526  normal  0.119748 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3328  hypothetical protein  51.52 
 
 		 437 aa  315  7e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.853201  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3464  hypothetical protein  50.9 
 
 		 424 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0282982 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2880  hypothetical protein  51.02 
 
 		 418 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1140  protein of unknown function DUF1624  52.91 
 
 		 385 aa  288  9e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.983502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2111  hypothetical protein  55.46 
 
 		 392 aa  285  8e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3138  protein of unknown function DUF1624  54.72 
 
 		 387 aa  276  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5634  hypothetical protein  40.15 
 
 		 401 aa  252  8.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0519757  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5717  hypothetical protein  36.64 
 
 		 398 aa  228  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1535  hypothetical protein  41.18 
 
 		 398 aa  227  2e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000132608  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3906  hypothetical protein  36.29 
 
 		 414 aa  217  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576525  normal  0.126212 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1300  hypothetical protein  38.93 
 
 		 388 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2897  hypothetical protein  37.08 
 
 		 390 aa  209  5e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.905704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1726  hypothetical protein  35.73 
 
 		 408 aa  202  6e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0289  membrane protein  36.64 
 
 		 399 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0666  hypothetical protein  39.47 
 
 		 388 aa  184  3e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3048  hypothetical protein  41.32 
 
 		 440 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.634245  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3588  hypothetical protein  36.39 
 
 		 407 aa  179  8e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0967112  normal  0.500812 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2213  hypothetical protein  31.17 
 
 		 392 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.321622  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0458  hypothetical protein  29.07 
 
 		 375 aa  124  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0903662  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0794  membrane protein-like protein  29.15 
 
 		 388 aa  97.1  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.13785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0455  membrane protein-like protein  31.83 
 
 		 389 aa  95.9  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.741716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4226  membrane protein-like protein  31.05 
 
 		 389 aa  94  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1471  hypothetical protein  29.71 
 
 		 383 aa  80.5  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.430676  normal  0.785937 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0097  hypothetical protein  25.11 
 
 		 254 aa  45.4  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4886  hypothetical protein  31.96 
 
 		 383 aa  44.3  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00335271  normal  0.121358 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>