51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2580 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2580  hypothetical protein  100 
 
 		 388 aa  773    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2271  hypothetical protein  93.54 
 
 		 388 aa  728    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.188325  normal  0.105142 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3280  hypothetical protein  72.09 
 
 		 407 aa  561  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515764  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1930  hypothetical protein  72.54 
 
 		 388 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0332469 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2059  hypothetical protein  70.28 
 
 		 388 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.453169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3276  hypothetical protein  70.54 
 
 		 388 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2419  hypothetical protein  69.25 
 
 		 421 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.539289  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1365  hypothetical protein  67.19 
 
 		 382 aa  469  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1906  hypothetical protein  59.74 
 
 		 382 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5557  hypothetical protein  70.71 
 
 		 384 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1866  hypothetical protein  62.86 
 
 		 405 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.574386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1635  hypothetical protein  59.21 
 
 		 382 aa  443  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.684419  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63970  hypothetical protein  70.56 
 
 		 384 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.989357 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5189  hypothetical protein  57.07 
 
 		 429 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2951  hypothetical protein  54.09 
 
 		 402 aa  398  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1089  protein of unknown function DUF1624  56.32 
 
 		 382 aa  372  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3696  membrane protein-like protein  53.03 
 
 		 397 aa  364  1e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643247  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1157  hypothetical protein  50.9 
 
 		 388 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2728  hypothetical protein  50.66 
 
 		 382 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0980  hypothetical protein  49.63 
 
 		 401 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.260122 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1201  hypothetical protein  50.13 
 
 		 398 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.592526  normal  0.119748 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0984  hypothetical protein  50 
 
 		 401 aa  325  9e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1045  hypothetical protein  49.13 
 
 		 401 aa  320  3e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062609 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1140  protein of unknown function DUF1624  49.73 
 
 		 385 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.983502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1081  protein of unknown function DUF1624  47.19 
 
 		 428 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147779 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3464  hypothetical protein  46.94 
 
 		 424 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0282982 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3286  hypothetical protein  46.94 
 
 		 426 aa  299  5e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2880  hypothetical protein  47.34 
 
 		 418 aa  295  7e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3328  hypothetical protein  45.71 
 
 		 437 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.853201  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2111  hypothetical protein  55.48 
 
 		 392 aa  287  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3138  protein of unknown function DUF1624  47.89 
 
 		 387 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5634  hypothetical protein  40.12 
 
 		 401 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0519757  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5717  hypothetical protein  37.59 
 
 		 398 aa  236  7e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1535  hypothetical protein  39.64 
 
 		 398 aa  223  3e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000132608  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3906  hypothetical protein  36.8 
 
 		 414 aa  213  7e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576525  normal  0.126212 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2897  hypothetical protein  36.99 
 
 		 390 aa  213  7e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.905704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1726  hypothetical protein  36.36 
 
 		 408 aa  208  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1300  hypothetical protein  35.35 
 
 		 388 aa  199  5e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3048  hypothetical protein  39.3 
 
 		 440 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.634245  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0289  membrane protein  37.06 
 
 		 399 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0666  hypothetical protein  34.65 
 
 		 388 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3588  hypothetical protein  33.74 
 
 		 407 aa  178  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0967112  normal  0.500812 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2213  hypothetical protein  30.87 
 
 		 392 aa  155  9e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.321622  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0458  hypothetical protein  29.29 
 
 		 375 aa  136  7.000000000000001e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0903662  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4226  membrane protein-like protein  27.78 
 
 		 389 aa  101  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0455  membrane protein-like protein  29.32 
 
 		 389 aa  100  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.741716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0794  membrane protein-like protein  25.83 
 
 		 388 aa  88.2  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.13785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1471  hypothetical protein  27.59 
 
 		 383 aa  80.9  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.430676  normal  0.785937 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1538  hypothetical protein  28.84 
 
 		 249 aa  49.3  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00890695  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0097  hypothetical protein  25 
 
 		 254 aa  48.5  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1683  hypothetical protein  26.32 
 
 		 246 aa  44.3  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>